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6dvc

Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 6nt spacer

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 170.9 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)

UniProt P9WGZ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–347 链 B； UniProt 1–347 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P9WGY9） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P9WGY7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P9WGY5） ECF RNA polymerase sigma factor SigL × 1 （P9WGH5） ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*CP*CP*GP*TP*GP*AP*GP*TP*CP*GP*AP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*CP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*CP*GP*GP*AP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(*CP*UP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000 分辨率 3.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6DVC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5UH5 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3 nt of RNA 提交 2017-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；400 ul 50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.75 Å R-free 0.248
5UH6 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2ntRNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.84 Å R-free 0.264
5UH8 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.18 Å R-free 0.257
5UH9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.40 Å R-free 0.332
5UHA Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.91 Å R-free 0.279
5UHB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.29 Å R-free 0.267
5UHC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.80 Å R-free 0.267
5UHD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.01 Å R-free 0.264
5UHE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.04 Å R-free 0.259
5UHF Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-IX336 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88D N-(2-methylphenyl)-Nalpha-(selenophene-2-carbonyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.4, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.34 Å R-free 0.267
5UHG Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 and Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.97 Å R-free 0.260
5ZX2 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 7nt RNA 提交 2018-05-17 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；2% Tacsimate pH 5.0, 0.1 M Sodium citrate pH5.6, 16 % PEG3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
5ZX3 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme with ECF sigma factor sigma H 提交 2018-05-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M NaAc, 0.1 M sodium citrate pH5.5, 10% PEG4000
分辨率 2.75 Å R-free 0.258
6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.232
6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.241
6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.90 Å R-free 0.246
6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.81 Å R-free 0.248
6FBV Single particle cryo em structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase in complex with Fidaxomicin 提交 2017-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 FI8 Fidaxomicin × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；3.5 microliter 1 microM Mtb RNAP-Lpm and 50 microMolar Lpm in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM dithiothreitol, and 0.1% n-octyl-beta-D-glucopyranoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å R-free 0.331
6JCX Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 6nt RNA 提交 2019-01-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08M Magnesium acetate, 0.05M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.256
6JCY Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation open complex with a chimeric ECF sigma factor sigH/E 提交 2019-01-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2M sodium acetate, 0.1M sodium citrate pH 5.5, 10% PEG4000
分辨率 3.11 Å R-free 0.238
6KON Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 5 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 10% PEG 400
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
6KOO Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 7 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
6KOP Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 9 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.008 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH6.5, 14% PEG 400
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
6KOQ Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 10 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylated pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 3.35 Å R-free 0.260
7PP4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme comprising sigma factor SigB 提交 2021-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 a 1–347（347 aa）
链 b 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7Q4U Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme octamer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 A 1–347（347 aa）
链 AA 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
链 FA 1–347（347 aa）
链 G 1–347（347 aa）
链 GA 1–347（347 aa）
链 H 1–347（347 aa）
链 LA 1–347（347 aa）
链 M 1–347（347 aa）
链 MA 1–347（347 aa）
链 N 1–347（347 aa）
链 RA 1–347（347 aa）
链 S 1–347（347 aa）
链 SA 1–347（347 aa）
链 T 1–347（347 aa）
链 Z 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.39 Å
7Q59 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme dimer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
链 a 1–347（347 aa）
链 b 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
7Z8Q Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase core 提交 2022-03-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 a 1–347（347 aa）
链 b 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
8EHQ Mycobacterium tuberculosis paused transcription complex with Bacillus subtilis NusG 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.00 Å
8EJ3 M. tuberculosis RNAP pause escaped complex with Bacillus subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-09-16 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.13 Å
8EOE Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_LG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8EOF Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_PG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EOS M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG and CMPCPP 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.10 Å
8EOT M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EXY M. tuberculosis RNAP paused complex with B. subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-10-26 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8HIH Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with transcription factor GlnR 提交 2022-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
链 G 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9FJP Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo 提交 2024-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 a 1–347（347 aa）
链 b 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9FJR Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B docked conformation 提交 2024-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 a 1–347（347 aa）
链 b 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9FJS Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B undocked conformation 提交 2024-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 a 1–347（347 aa）
链 b 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9JI2 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with unphosphated PhoP 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9JI3 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9JI4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9JI5 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules 提交 2024-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
链 I 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9KET Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules(composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9KEU Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9KEV Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9M98 Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9M9D Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9M9E Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9MRQ Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase elongation complex bound to inhibitor N-aroyl-N-aryl-phenylalanine amide (AAP)-SO2 提交 2025-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–347（347 aa）
链 B 1–347（347 aa）
未记录 A1BNV N-[2-(1,1-dioxo-1lambda~6~-thiomorpholin-4-yl)phenyl]-Nalpha-(2-fluorobenzoyl)-D-phenylalaninamide × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å

共 50 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOA_MYCTU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 13–359； UniProt 1–347 作者链 B； PDB构建体 13–359； UniProt 1–347

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)

UniProt P9WGY9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–1178 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P9WGZ1） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P9WGY7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P9WGY5） ECF RNA polymerase sigma factor SigL × 1 （P9WGH5） ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*CP*CP*GP*TP*GP*AP*GP*TP*CP*GP*AP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*CP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*CP*GP*GP*AP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(*CP*UP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000 分辨率 3.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6DVC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5UH5 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3 nt of RNA 提交 2017-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；400 ul 50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.75 Å R-free 0.248
5UH6 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2ntRNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.84 Å R-free 0.264
5UH8 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.18 Å R-free 0.257
5UH9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.40 Å R-free 0.332
5UHA Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.91 Å R-free 0.279
5UHB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.29 Å R-free 0.267
5UHC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.80 Å R-free 0.267
5UHD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.01 Å R-free 0.264
5UHE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.04 Å R-free 0.259
5UHF Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-IX336 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88D N-(2-methylphenyl)-Nalpha-(selenophene-2-carbonyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.4, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.34 Å R-free 0.267
5UHG Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 and Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.97 Å R-free 0.260
5ZX2 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 7nt RNA 提交 2018-05-17 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；2% Tacsimate pH 5.0, 0.1 M Sodium citrate pH5.6, 16 % PEG3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
5ZX3 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme with ECF sigma factor sigma H 提交 2018-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M NaAc, 0.1 M sodium citrate pH5.5, 10% PEG4000
分辨率 2.75 Å R-free 0.258
6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.232
6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.241
6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.90 Å R-free 0.246
6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.81 Å R-free 0.248
6FBV Single particle cryo em structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase in complex with Fidaxomicin 提交 2017-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 FI8 Fidaxomicin × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；3.5 microliter 1 microM Mtb RNAP-Lpm and 50 microMolar Lpm in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM dithiothreitol, and 0.1% n-octyl-beta-D-glucopyranoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å R-free 0.331
6JCX Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 6nt RNA 提交 2019-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08M Magnesium acetate, 0.05M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.256
6JCY Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation open complex with a chimeric ECF sigma factor sigH/E 提交 2019-01-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2M sodium acetate, 0.1M sodium citrate pH 5.5, 10% PEG4000
分辨率 3.11 Å R-free 0.238
6KON Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 5 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 10% PEG 400
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
6KOO Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 7 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
6KOP Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 9 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.008 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH6.5, 14% PEG 400
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
6KOQ Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 10 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylated pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 3.35 Å R-free 0.260
7PP4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme comprising sigma factor SigB 提交 2021-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 c 6–1178（1173 aa）
突变：L2E3G4C5 -> V ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7Q4U Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme octamer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 BA 6–1178（1173 aa）
链 C 6–1178（1173 aa）
链 HA 6–1178（1173 aa）
链 I 6–1178（1173 aa）
链 NA 6–1178（1173 aa）
链 O 6–1178（1173 aa）
链 TA 6–1178（1173 aa）
链 V 6–1178（1173 aa）
突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.39 Å
7Q59 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme dimer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 6–1178（1173 aa）
链 c 6–1178（1173 aa）
突变：L2E3G4C5 -> V 突变：L2E3G4C5 -> V ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
7Z8Q Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase core 提交 2022-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 c 6–1178（1173 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
8CWR Complex structure of WhiB3 and the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera in space group R3 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 815–829（15 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 SO4 SULFATE ION × 6 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 NI NICKEL (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；10-20 mM NiCl2, 0.8-1.0 M Li2SO4
分辨率 1.50 Å R-free 0.212
8CWT Complex structure of WhiB3 and the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera in space group P43212 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 815–829（15 aa）
链 D 815–829（15 aa）
链 F 815–829（15 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 SO4 SULFATE ION × 25 NI NICKEL (II) ION × 7 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10-20 mM NiCl2, 0.8-1.0 M Li2SO4
分辨率 1.35 Å R-free 0.174
8D5V WhiB6 bound to the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2022-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 815–829（15 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Na Citrate pH 5.5, 20% PEG3000
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
8D5V WhiB6 bound to the SigmaAr4-RNAP Beta flap tip chimera 提交 2022-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 815–829（15 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Na Citrate pH 5.5, 20% PEG3000
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
8EHQ Mycobacterium tuberculosis paused transcription complex with Bacillus subtilis NusG 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.00 Å
8EJ3 M. tuberculosis RNAP pause escaped complex with Bacillus subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-09-16 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.13 Å
8EOE Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_LG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8EOF Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_PG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EOS M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG and CMPCPP 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.10 Å
8EOT M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EXY M. tuberculosis RNAP paused complex with B. subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-10-26 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8HIH Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with transcription factor GlnR 提交 2022-11-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9FJP Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 c 6–1178（1173 aa）
突变：L2E3G4C5I6 -> V ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9FJR Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B docked conformation 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 c 6–1178（1173 aa）
突变：L2E3G4C5I6 -> V ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9FJS Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B undocked conformation 提交 2024-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 c 6–1178（1173 aa）
突变：L2E3G4C5I6 -> V ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9JI2 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with unphosphated PhoP 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9JI3 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9JI4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9JI5 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9KET Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules(composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9KEU Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9KEV Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9M98 Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 C 7–1178（1172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9M9D Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9M9E Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9MRQ Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase elongation complex bound to inhibitor N-aroyl-N-aryl-phenylalanine amide (AAP)-SO2 提交 2025-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1178（1178 aa）
未记录 A1BNV N-[2-(1,1-dioxo-1lambda~6~-thiomorpholin-4-yl)phenyl]-Nalpha-(2-fluorobenzoyl)-D-phenylalaninamide × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å

共 53 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOB_MYCTU
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–1178； UniProt 1–1178

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)

UniProt P9WGY7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–1316 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P9WGZ1） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P9WGY9） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P9WGY5） ECF RNA polymerase sigma factor SigL × 1 （P9WGH5） ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*CP*CP*GP*TP*GP*AP*GP*TP*CP*GP*AP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*CP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*CP*GP*GP*AP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(*CP*UP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000 分辨率 3.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6DVC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5UH5 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3 nt of RNA 提交 2017-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；400 ul 50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.75 Å R-free 0.248
5UH6 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2ntRNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.84 Å R-free 0.264
5UH7 Crystal structure of beta'MtbSI of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase 提交 2017-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–271（148 aa）
链 B 124–271（148 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, and 22% PEG1000
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
5UH9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.40 Å R-free 0.332
5UHA Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.91 Å R-free 0.279
5UHB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.29 Å R-free 0.267
5UHC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.80 Å R-free 0.267
5UHD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.01 Å R-free 0.264
5UHE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.04 Å R-free 0.259
5UHF Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-IX336 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88D N-(2-methylphenyl)-Nalpha-(selenophene-2-carbonyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.4, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.34 Å R-free 0.267
5UHG Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 and Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.97 Å R-free 0.260
5ZX2 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 7nt RNA 提交 2018-05-17 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；2% Tacsimate pH 5.0, 0.1 M Sodium citrate pH5.6, 16 % PEG3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
5ZX3 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme with ECF sigma factor sigma H 提交 2018-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M NaAc, 0.1 M sodium citrate pH5.5, 10% PEG4000
分辨率 2.75 Å R-free 0.258
6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.232
6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.241
6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.90 Å R-free 0.246
6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.81 Å R-free 0.248
6FBV Single particle cryo em structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase in complex with Fidaxomicin 提交 2017-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 FI8 Fidaxomicin × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；3.5 microliter 1 microM Mtb RNAP-Lpm and 50 microMolar Lpm in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM dithiothreitol, and 0.1% n-octyl-beta-D-glucopyranoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å R-free 0.331
6JCX Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 6nt RNA 提交 2019-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08M Magnesium acetate, 0.05M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.256
6JCY Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation open complex with a chimeric ECF sigma factor sigH/E 提交 2019-01-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2M sodium acetate, 0.1M sodium citrate pH 5.5, 10% PEG4000
分辨率 3.11 Å R-free 0.238
6KON Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 5 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 10% PEG 400
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
6KOO Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 7 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
6KOP Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 9 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.008 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH6.5, 14% PEG 400
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
6KOQ Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 10 nt 提交 2019-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylated pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 3.35 Å R-free 0.260
7PP4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme comprising sigma factor SigB 提交 2021-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 d 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7Q4U Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme octamer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 CA 4–1316（1313 aa）
链 D 4–1316（1313 aa）
链 IA 4–1316（1313 aa）
链 J 4–1316（1313 aa）
链 OA 4–1316（1313 aa）
链 P 4–1316（1313 aa）
链 UA 4–1316（1313 aa）
链 W 4–1316（1313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.39 Å
7Q59 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme dimer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 4–1316（1313 aa）
链 d 4–1316（1313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
7Z8Q Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase core 提交 2022-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 d 4–1316（1313 aa）
突变：contains C-terminal 6xHis-tag ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
7ZF2 Protomeric substructure from an octameric assembly of M. tuberculosis RNA polymerase in complex with sigma-b initiation factor 提交 2022-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 4–1316（1313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
8EHQ Mycobacterium tuberculosis paused transcription complex with Bacillus subtilis NusG 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.00 Å
8EJ3 M. tuberculosis RNAP pause escaped complex with Bacillus subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-09-16 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.13 Å
8EOE Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_LG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8EOF Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_PG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EOS M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG and CMPCPP 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.10 Å
8EOT M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EXY M. tuberculosis RNAP paused complex with B. subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-10-26 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8HIH Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with transcription factor GlnR 提交 2022-11-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9FJP Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo 提交 2024-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 d 4–1316（1313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9FJR Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B docked conformation 提交 2024-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 d 4–1316（1313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9FJS Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B undocked conformation 提交 2024-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 d 4–1316（1313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9JI2 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with unphosphated PhoP 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9JI3 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9JI4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9JI5 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules 提交 2024-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9KET Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules(composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9KEU Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9KEV Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9M98 Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 D 2–1316（1315 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9M9D Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9M9E Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9MRQ Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase elongation complex bound to inhibitor N-aroyl-N-aryl-phenylalanine amide (AAP)-SO2 提交 2025-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1316（1316 aa）
未记录 A1BNV N-[2-(1,1-dioxo-1lambda~6~-thiomorpholin-4-yl)phenyl]-Nalpha-(2-fluorobenzoyl)-D-phenylalaninamide × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å

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UniProt名称 RPOC_MYCTU
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–1316； UniProt 1–1316

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)

UniProt P9WGY5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–110 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P9WGZ1） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P9WGY9） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P9WGY7） ECF RNA polymerase sigma factor SigL × 1 （P9WGH5） ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*CP*CP*GP*TP*GP*AP*GP*TP*CP*GP*AP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*CP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*CP*GP*GP*AP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(*CP*UP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000 分辨率 3.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6DVC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5UH5 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3 nt of RNA 提交 2017-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；400 ul 50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.75 Å R-free 0.248
5UH6 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2ntRNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.84 Å R-free 0.264
5UH8 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.18 Å R-free 0.257
5UH9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 2nt RNA 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.40 Å R-free 0.332
5UHA Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.91 Å R-free 0.279
5UHB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.29 Å R-free 0.267
5UHC Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 3nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.80 Å R-free 0.267
5UHD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex containing 4nt RNA in complex with Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.01 Å R-free 0.264
5UHE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.3, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.04 Å R-free 0.259
5UHF Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-IX336 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88D N-(2-methylphenyl)-Nalpha-(selenophene-2-carbonyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.4, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 4.34 Å R-free 0.267
5UHG Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex in complex with D-AAP1 and Rifampin 提交 2017-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 88G Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；295 K；50 mM Tris-HCl, pH 8.2, 200 mM KCl, 50 mM MgCl2, and 10% PEG3350
分辨率 3.97 Å R-free 0.260
5ZX2 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 7nt RNA 提交 2018-05-17 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；2% Tacsimate pH 5.0, 0.1 M Sodium citrate pH5.6, 16 % PEG3350
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
5ZX3 Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme with ECF sigma factor sigma H 提交 2018-05-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M NaAc, 0.1 M sodium citrate pH5.5, 10% PEG4000
分辨率 2.75 Å R-free 0.258
6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.232
6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.241
6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.90 Å R-free 0.246
6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.81 Å R-free 0.248
6FBV Single particle cryo em structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase in complex with Fidaxomicin 提交 2017-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 FI8 Fidaxomicin × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；3.5 microliter 1 microM Mtb RNAP-Lpm and 50 microMolar Lpm in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5 mM dithiothreitol, and 0.1% n-octyl-beta-D-glucopyranoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å R-free 0.331
6JCX Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with ECF sigma factor sigma H and 6nt RNA 提交 2019-01-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08M Magnesium acetate, 0.05M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.256
6JCY Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase transcription initiation open complex with a chimeric ECF sigma factor sigH/E 提交 2019-01-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.2M sodium acetate, 0.1M sodium citrate pH 5.5, 10% PEG4000
分辨率 3.11 Å R-free 0.238
6KON Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 5 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 10% PEG 400
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
6KOO Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 7 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M Magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 2.80 Å R-free 0.248
6KOP Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 9 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.008 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylate pH6.5, 14% PEG 400
分辨率 3.30 Å R-free 0.255
6KOQ Mycobacterium tuberculosis initial transcription complex comprising sigma H and 5'-OH RNA of 10 nt 提交 2019-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.08 M magnesium acetate, 0.05 M sodium cacodylated pH 6.5, 15% PEG 400
分辨率 3.35 Å R-free 0.260
7PP4 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme comprising sigma factor SigB 提交 2021-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 e 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
7Q4U Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme octamer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 DA 1–110（110 aa）
链 E 1–110（110 aa）
链 JA 1–110（110 aa）
链 K 1–110（110 aa）
链 PA 1–110（110 aa）
链 Q 1–110（110 aa）
链 VA 1–110（110 aa）
链 X 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.39 Å
7Q59 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme dimer comprising sigma factor SigB 提交 2021-11-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–110（110 aa）
链 e 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
7Z8Q Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase core 提交 2022-03-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 e 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
8EHQ Mycobacterium tuberculosis paused transcription complex with Bacillus subtilis NusG 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.00 Å
8EJ3 M. tuberculosis RNAP pause escaped complex with Bacillus subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-09-16 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.13 Å
8EOE Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_LG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8EOF Mycobacterium tuberculosis transcription elongation complex with Bacillus subtilis NusG (EC_PG) 提交 2022-10-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EOS M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG and CMPCPP 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.10 Å
8EOT M. tuberculosis RNAP elongation complex with NusG 提交 2022-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.30 Å
8EXY M. tuberculosis RNAP paused complex with B. subtilis NusG and GMPCPP 提交 2022-10-26 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4-5 seconds before plunging in liquid ethane
分辨率 3.20 Å
8HIH Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex with transcription factor GlnR 提交 2022-11-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9FJP Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo 提交 2024-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 e 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9FJR Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B docked conformation 提交 2024-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 e 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9FJS Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis sigma-B RNA polymerase bound to -10 promoter element ssDNA oligo - sigma-B undocked conformation 提交 2024-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 e 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9；8 mM CHAPSO added before vitrificaion
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9KET Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with two PhoP molecules(composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
9KEU Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with four PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9KEV Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis transcription activation complex with six PhoP molecules (composite map) 提交 2024-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9M98 Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9M9D Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9M9E Structural Basis of Pausing During Transcription Initiation in Mycobacterium tuberculosis 提交 2025-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9MRQ Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase elongation complex bound to inhibitor N-aroyl-N-aryl-phenylalanine amide (AAP)-SO2 提交 2025-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–110（110 aa）
未记录 A1BNV N-[2-(1,1-dioxo-1lambda~6~-thiomorpholin-4-yl)phenyl]-Nalpha-(2-fluorobenzoyl)-D-phenylalaninamide × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å

共 46 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOZ_MYCTU
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

ECF RNA polymerase sigma factor SigL

Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)

UniProt P9WGH5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 6 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–177 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P9WGZ1） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P9WGY9） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P9WGY7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P9WGY5） ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*CP*CP*GP*TP*GP*AP*GP*TP*CP*GP*AP*GP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*CP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*GP*TP*AP*GP*TP*GP*TP*CP*AP*CP*GP*GP*AP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(*CP*UP*CP*GP*A)-3') ; × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.0, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000 分辨率 3.30 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6DVC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6DV9 Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 4nt spacer 提交 2018-06-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 1–177（177 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.232
6DVB Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 5nt spacer 提交 2018-06-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 1–177（177 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.7, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.241
6DVD Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) with 6 nt spacer and bromine labelled in position "-11 提交 2018-06-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 F 1–177（177 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 6.2, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.90 Å R-free 0.246
6DVE Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF selenomethionine-labelled sigma factor L) with 6 nt spacer 提交 2018-06-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 F 1–177（177 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.5, 200 mM sodium acetate, and 10% PEG4000
分辨率 3.81 Å R-free 0.248

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SIGL_MYCTU
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–177； UniProt 1–177

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6dvc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6dvc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6dvc
沉积日期 deposition_date2018-06-23
结构标题 titleCrystal structure of Mycobacterium tuberculosis transcription initiation complex(ECF sigma factor L) containing 5nt RNA with 6nt spacer
关键词 keywordsMycobacterium tuberculosis, RNA polymerase, ECF sigma factor, TRANSFERASE, TRANSFERASE-DNA-RNA complex; TRANSFERASE/DNA/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier46.83 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron46.52 Å
零角强度 I(0) i01974460000.00
分子量 molecular_weight356020.0 kDa
排除体积 excluded_volume440450 ų
包络体积 envelope_volume615490 ų
水化壳体积 shell_volume105190 ų
包络直径 envelope_diameter181.7 Å
壳层 Rg shell_rg54.42 Å
包络 Rg envelope_rg46.52 Å
形状 Rg shape_rg46.54 Å
总 Rg total_rg46.73 Å
总原子数 total_atoms24983
残基数 n_residues3148
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax170.9 Å
Rg (实空间) rg_real46.73 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.70 Å
I(0) (实空间) i0_real1.9740e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.2030e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal46.83 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1975000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8254
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary55.3 Å
偏度 Skewness skewness0.400
峰度 Kurtosis kurtosis0.092
角度范围 angular_range— – 0.1700 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha503800000.0000
实空间数据点数 n_real_points35
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.597; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.945
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id6dvcA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id6dvcA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain
结构域编号 domain_id6dvcB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id6dvcB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain
结构域编号 domain_id6dvcD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3
结构域编号 domain_id6dvcD02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)