6dw3

SAMHD1 Bound to Cytarabine-TP in the Catalytic Pocket

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 108.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 113–626 链 B； UniProt 113–626 链 C； UniProt 113–626 链 D； UniProt 113–626	突变：H206R, D207N	HF4 4-amino-1-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 2.20 Å R-free 0.228

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6DW3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2E8O Solution structure of the N-terminal SAM-domain of the SAM domain and HD domain containing protein 1 (Dendritic cell-derived IFNG-induced protein) (DCIP) (Monocyte protein 5) (MOP-5) 提交 2007-01-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–118（96 aa）片段：SAM domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.17mM SAM DOMAIN, 20mM d-TRIS-HCL, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3U1N Structure of the catalytic core of human SAMHD1 提交 2011-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 120–626（507 aa）片段：unp residues 120-626 链 D 120–626（507 aa）片段：unp residues 120-626	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.228
3U1N Structure of the catalytic core of human SAMHD1 提交 2011-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 120–626（507 aa）片段：unp residues 120-626 链 C 120–626（507 aa）片段：unp residues 120-626	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.10 Å R-free 0.228
4BZB Crystal structure of the tetrameric dGTP-bound SAMHD1 mutant catalytic core 提交 2013-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；100 MM SPG BUFFER, PH 7.4, 25% PEG 1500	分辨率 1.83 Å R-free 0.206
4BZC Crystal structure of the tetrameric dGTP-bound wild type SAMHD1 catalytic core 提交 2013-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：HD DOMAIN, RESIDUES 113-626	未记录	T8T 2'-deoxyguanosine-5'-O-(1-thiotriphosphate) × 12 MN MANGANESE (II) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.7；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 2.88 Å R-free 0.245
4CC9 Crystal structure of human SAMHD1 (amino acid residues 582-626) bound to Vpx isolated from sooty mangabey and human DCAF1 (amino acid residues 1058-1396) 提交 2013-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 582–626（45 aa）片段：RESIDUES 582-626	未记录	PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M HEPES PH 7.5, 15% PEG 400	分辨率 2.47 Å R-free 0.216
4MZ7 Structural insight into dGTP-dependent activation of tetrameric SAMHD1 deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase 提交 2013-09-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）片段：UNP residues 109-626 链 B 109–626（518 aa）片段：UNP residues 109-626	突变：C266Y 突变：C266Y	ZN ZINC ION × 4 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 MG MAGNESIUM ION × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1M MES (pH 6.5), 25%(w/v) polyethylene glycol monomethyle ether 550, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4Q7H Crystal structure of SAMHD1 catalytic core with GTP 提交 2014-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–626（518 aa）片段：HD-domain, UNP residues 109-626 链 B 109–626（518 aa）片段：HD-domain, UNP residues 109-626	突变：C266Y 突变：C266Y	ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2M Lithium citrate tribasic tetrahydrate, 24% PEG3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.59 Å R-free 0.248
4Q7H Crystal structure of SAMHD1 catalytic core with GTP 提交 2014-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 109–626（518 aa）片段：HD-domain, UNP residues 109-626 链 D 109–626（518 aa）片段：HD-domain, UNP residues 109-626	突变：C266Y 突变：C266Y	ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2M Lithium citrate tribasic tetrahydrate, 24% PEG3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.59 Å R-free 0.248
4QFX Crystal structure of the tetrameric dGTP/dATP-bound SAMHD1 (RN206) mutant catalytic core 提交 2014-05-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.270
4QFY Crystal structure of the tetrameric dGTP/dCTP-bound SAMHD1 (RN206) mutant catalytic core 提交 2014-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.269
4QFZ Crystal structure of the tetrameric dGTP/dTTP-bound SAMHD1 (RN206) mutant catalytic core 提交 2014-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
4QG0 Crystal structure of the tetrameric dGTP/dUTP-bound SAMHD1 (RN206) mutant catalytic core 提交 2014-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
4QG1 Crystal structure of the tetrameric GTP/dATP-bound SAMHD1 (RN206) mutant catalytic core 提交 2014-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.264
4QG2 Crystal structure of the tetrameric GTP/dATP/ATP-bound SAMHD1 (RN206) mutant catalytic core 提交 2014-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N 突变：H206R/D207N	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.25 Å R-free 0.271
4QG4 Crystal structure of the tetrameric GTP/dATP/ATP-bound SAMHD1 (H210A) mutant catalytic core 提交 2014-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	突变：H210A 突变：H210A 突变：H210A 突变：H210A	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M SPG, pH 6.5, 25% PEG1500, 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
4RXO The structure of GTP-bound SAMHD1 提交 2014-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.2 M sodium chloride, 0.1M Na/K phosphate, and 25% w/v polyethylene glycol 1000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.222
4RXO The structure of GTP-bound SAMHD1 提交 2014-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 109–626（518 aa）链 D 109–626（518 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.2 M sodium chloride, 0.1M Na/K phosphate, and 25% w/v polyethylene glycol 1000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.222
4RXP The structure of GTP-dATP-bound SAMHD1 提交 2014-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	未记录	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, and 20% w/v polyethylene glycol 1000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.208
4RXQ The structure of GTP-dUTP-bound SAMHD1 提交 2014-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DUT DEOXYURIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, and 20% w/v polyethylene glycol 1000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4RXR The structure of GTP-dCTP-bound SAMHD1 提交 2014-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, and 20% w/v polyethylene glycol 1000 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.12 Å R-free 0.213
4RXS The structure of GTP-dTTP-bound SAMHD1 提交 2014-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；0.1 M lithium sulfate monohydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, and 20% w/v polyethylene glycol 1000 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.222
4TNP Structural basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dCTP-cCTP complex 提交 2014-06-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.00 Å R-free 0.222
4TNQ Structural basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dTTP-dTTP complex 提交 2014-06-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.55 Å R-free 0.198
4TNR Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dATP-dATP complex 提交 2014-06-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 7 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.75 Å R-free 0.242
4TNX Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dGTP complex 提交 2014-06-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 3PO TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.31 Å R-free 0.226
4TNY Structural basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-dGTP-dATP-dGTP complex 提交 2014-06-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.60 Å R-free 0.244
4TNZ Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dATP-dTTP complex 提交 2014-06-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.38 Å R-free 0.243
4TO0 Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dATP-dCTP complex 提交 2014-06-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.222
4TO1 Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dATP/dCTP-dCTP complex 提交 2014-06-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.55 Å R-free 0.235
4TO2 Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-dGTP-dGTP-dGTP/dTTP complex 提交 2014-06-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 MG MAGNESIUM ION × 8 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.27 Å R-free 0.234
4TO3 Structural basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-dGTP-dGTP-dCTP complex 提交 2014-06-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.20 Å R-free 0.204
4TO4 Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dGTP-dCTP complex 提交 2014-06-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
4TO5 Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-GTP-dTTP-dCTP complex 提交 2014-06-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：UNP residues 113-626	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.80 Å R-free 0.285
4TO6 Structure basis of cellular dNTP regulation, SAMHD1-dGTP-dATP-dTTP/dGTP complex 提交 2014-06-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.33 Å R-free 0.244
4ZWE Crystal structure of the dGTP-bound catalytic core of SAMHD1 T592V mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.81 Å R-free 0.248
4ZWE Crystal structure of the dGTP-bound catalytic core of SAMHD1 T592V mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.81 Å R-free 0.248
4ZWE Crystal structure of the dGTP-bound catalytic core of SAMHD1 T592V mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.81 Å R-free 0.248
4ZWE Crystal structure of the dGTP-bound catalytic core of SAMHD1 T592V mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.81 Å R-free 0.248
4ZWE Crystal structure of the dGTP-bound catalytic core of SAMHD1 T592V mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592V 突变：H206R, D207N, T592V	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.81 Å R-free 0.248
4ZWG Crystal structure of the GTP-dATP-bound catalytic core of SAMHD1 phosphomimetic T592E mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 B 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592E 突变：H206R, D207N, T592E 突变：H206R, D207N, T592E 突变：H206R, D207N, T592E	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.246
4ZWG Crystal structure of the GTP-dATP-bound catalytic core of SAMHD1 phosphomimetic T592E mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 D 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592E 突变：H206R, D207N, T592E	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.246
4ZWG Crystal structure of the GTP-dATP-bound catalytic core of SAMHD1 phosphomimetic T592E mutant 提交 2015-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–626（514 aa）片段：residues 113-626 链 C 113–626（514 aa）片段：residues 113-626	突变：H206R, D207N, T592E 突变：H206R, D207N, T592E	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.4；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.246
5AO0 Crystal structure of human SAMHD1 (amino acid residues 41-583) bound to ddGTP 提交 2015-09-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–583（543 aa）片段：RESIDUES 41-583 链 B 41–583（543 aa）片段：RESIDUES 41-583	未记录	FE FE (III) ION × 4 DG3 2'-3'-DIDEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 160 MM SUCCINIC ACID, 11% PEG 3350, PH 7	分辨率 3.73 Å R-free 0.268
5AO1 Crystal structure of human SAMHD1 (amino acid residues 115-583) bound to ddGTP 提交 2015-09-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583 链 B 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583 链 C 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583 链 D 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583	未记录	FE FE (III) ION × 4 DG3 2'-3'-DIDEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 SO4 SULFATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM BIS TRIS PROPANE-HCL, 150 MM NA2SO4, 13.5% PEG 3350 PH 6.5	分辨率 2.54 Å R-free 0.220
5AO2 Crystal structure of human SAMHD1 (amino acid residues 115-583) R164A variant bound to dGTP 提交 2015-09-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583 链 B 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583 链 C 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583 链 D 115–583（469 aa）片段：UNP RESIDUES 115-583	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	FE FE (III) ION × 4 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M SODIUM CITRATE, 0.1 M BIS TRIS PROPANE-HCL, 20% PEG 3350, PH 8.5	分辨率 2.97 Å R-free 0.234
5AO3 Crystal structure of human SAMHD1 (amino acid residues 115-626) bound to GTP 提交 2015-09-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 115–626（512 aa）片段：UNP RESIDUES 115-626 链 B 115–626（512 aa）片段：UNP RESIDUES 115-626 链 C 115–626（512 aa）片段：UNP RESIDUES 115-626 链 D 115–626（512 aa）片段：UNP RESIDUES 115-626	未记录	FE FE (III) ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.247
5AO4 Crystal structure of in vitro phosphorylated human SAMHD1 (amino acid residues 115-626) bound to GTP 提交 2015-09-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 115–626（512 aa）片段：RESIDUES 115-626 链 B 115–626（512 aa）片段：RESIDUES 115-626 链 C 115–626（512 aa）片段：RESIDUES 115-626 链 D 115–626（512 aa）片段：RESIDUES 115-626	未记录	FE FE (III) ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2 M SODIUM FORMATE, 20% PEG 3350	分辨率 3.70 Å R-free 0.308
6CM2 SAMHD1 HD domain bound to decitabine triphosphate 提交 2018-03-02	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H94R, D95N 突变：H94R, D95N 突变：H94R, D95N 突变：H94R, D95N	F6G 6-amino-3-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-erythro-pentofuranosyl}-3,4-dihydro-1,3,5-triazin-2(1H)-one × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；SPG buffer, PEG 1500	分辨率 2.14 Å R-free 0.225
6DW4 SAMHD1 Bound to Cladribine-TP in the Catalytic Pocket and Allosteric Pocket 提交 2018-06-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N	HF7 2'-deoxy-2-methyladenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 1.99 Å R-free 0.202
6DW5 SAMHD1 Bound to Gemcitabine-TP in the Catalytic Pocket 提交 2018-06-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N	GTF 2'-deoxy-2',2'-difluorocytidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 1.93 Å R-free 0.205
6DW7 SAMHD1 without Catalytic Nucleotides 提交 2018-06-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 GLY GLYCINE × 2 NA SODIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 2.50 Å R-free 0.250
6DWD SAMHD1 Bound to Clofarabine-TP in the Catalytic Pocket and Allosteric Pocket 提交 2018-06-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N	HDV 9-{2-deoxy-2-fluoro-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-2-me thyl-9H-purin-6-amine × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 23 GLY GLYCINE × 7 SIN SUCCINIC ACID × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 1.70 Å R-free 0.202
6DWJ SAMHD1 Bound to Vidarabine-TP in the Catalytic Pocket 提交 2018-06-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N	HEJ 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 17 GLY GLYCINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 2.50 Å R-free 0.208
6DWK SAMHD1 Bound to Fludarabine-TP in the Catalytic Pocket 提交 2018-06-26	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N 突变：H206R, D207N	HFD 2-fluoro-9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-a mine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 23 GLY GLYCINE × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 MM BIS-TRIS PH 6.7 AND 25% (W/V) PEG1500	分辨率 2.30 Å R-free 0.212
6TX0 Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dAMPNPP and Mg 提交 2020-01-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 DZ4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine × 8 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 16% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.01 Å R-free 0.228
6TXA Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dGMPNPP and Mg 提交 2020-01-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）链 C 109–626（518 aa）链 D 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 XG4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine × 8 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.85 Å R-free 0.212
6TXA Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dGMPNPP and Mg 提交 2020-01-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 109–626（518 aa）链 F 109–626（518 aa）链 G 109–626（518 aa）链 H 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 XG4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine × 8 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.85 Å R-free 0.212
6TXA Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dGMPNPP and Mg 提交 2020-01-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 109–626（518 aa）链 J 109–626（518 aa）链 K 109–626（518 aa）链 L 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 XG4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine × 8 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.85 Å R-free 0.212
6TXA Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dGMPNPP and Mg 提交 2020-01-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 109–626（518 aa）链 N 109–626（518 aa）链 O 109–626（518 aa）链 P 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 XG4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine × 8 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.85 Å R-free 0.212
6TXC Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dCMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）链 C 109–626（518 aa）链 D 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 0KX 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCL pH 6, 17% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.84 Å R-free 0.249
6TXC Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dCMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 109–626（518 aa）链 F 109–626（518 aa）链 G 109–626（518 aa）链 H 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 9 0KX 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCL pH 6, 17% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.84 Å R-free 0.249
6TXC Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dCMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 109–626（518 aa）链 J 109–626（518 aa）链 K 109–626（518 aa）链 L 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 11 0KX 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 3 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCL pH 6, 17% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.84 Å R-free 0.249
6TXC Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dCMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 109–626（518 aa）链 N 109–626（518 aa）链 O 109–626（518 aa）链 P 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 0KX 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCL pH 6, 17% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4.	分辨率 2.84 Å R-free 0.249
6TXE Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dTMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）链 C 109–626（518 aa）链 D 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 1FZ 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 19% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4	分辨率 3.19 Å R-free 0.252
6TXE Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dTMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 109–626（518 aa）链 F 109–626（518 aa）链 G 109–626（518 aa）链 H 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 1FZ 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 19% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4	分辨率 3.19 Å R-free 0.252
6TXE Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dTMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 109–626（518 aa）链 J 109–626（518 aa）链 K 109–626（518 aa）链 L 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 1FZ 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 19% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4	分辨率 3.19 Å R-free 0.252
6TXE Crystal structure of tetrameric human wt-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dATP, dTMPNPP and Mg 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 109–626（518 aa）链 N 109–626（518 aa）链 O 109–626（518 aa）链 P 109–626（518 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 1FZ 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 19% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4	分辨率 3.19 Å R-free 0.252
6TXF Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dAMPNPP and Mn 提交 2020-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 DZ4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine × 8 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 14% (w/v) PEG 3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.239
6U6X Human SAMHD1 bound to deoxyribo(CGCCT)-oligonucleotide 提交 2019-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 114–626（513 aa）链 D 114–626（513 aa）	突变：D311A 突变：D311A	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% polyethylene glycol 3350	分辨率 2.58 Å R-free 0.236
6U6X Human SAMHD1 bound to deoxyribo(CGCCT)-oligonucleotide 提交 2019-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 114–626（513 aa）链 C 114–626（513 aa）	突变：D311A 突变：D311A	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% polyethylene glycol 3350	分辨率 2.58 Å R-free 0.236
6U6Y Human SAMHD1 bound to ribo(CGCCU)-oligonucleotide 提交 2019-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 114–626（513 aa）链 D 114–626（513 aa）	突变：D311A 突变：D311A	ZN ZINC ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG 4000, 0.6 M NaCl, 0.1 M MES:NaOH pH 6.5	分辨率 2.47 Å R-free 0.235
6U6Y Human SAMHD1 bound to ribo(CGCCU)-oligonucleotide 提交 2019-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 114–626（513 aa）链 C 114–626（513 aa）	突变：D311A 突变：D311A	ZN ZINC ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；20% PEG 4000, 0.6 M NaCl, 0.1 M MES:NaOH pH 6.5	分辨率 2.47 Å R-free 0.235
6U6Z Human SAMHD1 bound to deoxyribo(TG*TTCA)-oligonucleotide 提交 2019-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 116–626（511 aa）链 D 116–626（511 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.26 M sodium malonate, 20% polyethylene glycol 3350, 0.1 M bis-Tris propane pH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6U6Z Human SAMHD1 bound to deoxyribo(TG*TTCA)-oligonucleotide 提交 2019-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 116–626（511 aa）链 C 116–626（511 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.26 M sodium malonate, 20% polyethylene glycol 3350, 0.1 M bis-Tris propane pH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.206
6XU1 Crystal structure of tetrameric human H215A-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dAMPNPP and Mg 提交 2020-01-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）链 C 109–626（518 aa）链 D 109–626（518 aa）	突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 13 DZ4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.20 Å R-free 0.202
6XU1 Crystal structure of tetrameric human H215A-SAMHD1 (residues 109-626) with GTP, dAMPNPP and Mg 提交 2020-01-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 109–626（518 aa）链 F 109–626（518 aa）链 G 109–626（518 aa）链 H 109–626（518 aa）	突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 DZ4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.1 M MgCl2	分辨率 2.20 Å R-free 0.202
6YOM Crystal structure of tetrameric human D137N-SAMHD1 (residues 109-626) with XTP, dATP, dCMPNPP, Mn and Mg 提交 2020-04-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）	突变：D137N 突变：D137N	FE FE (III) ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 0KX 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine × 4 CZF [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.05 M MgCl2	分辨率 3.25 Å R-free 0.236
7A5Y Crystal structure of tetrameric human H215A-SAMHD1 (residues 109-626) with Rp-dGTP-alphaS (T8T) and Mg 提交 2020-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 109–626（518 aa）链 B 109–626（518 aa）链 C 109–626（518 aa）链 D 109–626（518 aa）	突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 T8T 2'-deoxyguanosine-5'-O-(1-thiotriphosphate) × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4	分辨率 2.29 Å R-free 0.240
7A5Y Crystal structure of tetrameric human H215A-SAMHD1 (residues 109-626) with Rp-dGTP-alphaS (T8T) and Mg 提交 2020-08-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 109–626（518 aa）链 F 109–626（518 aa）链 G 109–626（518 aa）链 H 109–626（518 aa）	突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A 突变：H215A	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 T8T 2'-deoxyguanosine-5'-O-(1-thiotriphosphate) × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bistris methane-HCl pH 6, 15% (w/v) PEG 3350, 0.15 M Li2SO4	分辨率 2.29 Å R-free 0.240
7LTT SAMHD1(113-626) H206R D207N R366C 提交 2021-02-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N, R366C 突变：H206R, D207N, R366C 突变：H206R, D207N, R366C 突变：H206R, D207N, R366C	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8.2；293 K；PEG 1500, dGTP, SPG buffer, sodium chloride, magnesium chloride, TCEP	分辨率 1.90 Å R-free 0.212
7LU5 SAMHD1(113-626) H206R D207N R366H 提交 2021-02-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 9；293 K；PEG 1500, dGTP, SPG buffer, sodium chloride, magnesium chloride	分辨率 3.57 Å R-free 0.274
7LU5 SAMHD1(113-626) H206R D207N R366H 提交 2021-02-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 113–626（514 aa）链 F 113–626（514 aa）链 G 113–626（514 aa）链 H 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 9；293 K；PEG 1500, dGTP, SPG buffer, sodium chloride, magnesium chloride	分辨率 3.57 Å R-free 0.274
7LU5 SAMHD1(113-626) H206R D207N R366H 提交 2021-02-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 113–626（514 aa）链 J 113–626（514 aa）链 K 113–626（514 aa）链 L 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 9；293 K；PEG 1500, dGTP, SPG buffer, sodium chloride, magnesium chloride	分辨率 3.57 Å R-free 0.274
7LU5 SAMHD1(113-626) H206R D207N R366H 提交 2021-02-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 113–626（514 aa）链 N 113–626（514 aa）链 O 113–626（514 aa）链 P 113–626（514 aa）	突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H 突变：H206R, D207N, R366H	DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 9；293 K；PEG 1500, dGTP, SPG buffer, sodium chloride, magnesium chloride	分辨率 3.57 Å R-free 0.274
7S2Y SAMHD1 HD domain bound to CNDAC 提交 2021-09-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	85T 4-amino-1-{2-cyano-2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；100 mM succinate phosphate glycine buffer pH 7.4, 25% PEG 1500	分辨率 2.80 Å R-free 0.232
7UJN Structure of Human SAMHD1 with Non-Hydrolysable dGTP Analog 提交 2022-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	T8T 2'-deoxyguanosine-5'-O-(1-thiotriphosphate) × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8D94 SAMHD1-DNA complex 提交 2022-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM CaCl2, 20% PEG 3350, and 4% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD)	分辨率 2.44 Å R-free 0.243
8D94 SAMHD1-DNA complex 提交 2022-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM CaCl2, 20% PEG 3350, and 4% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD)	分辨率 2.44 Å R-free 0.243
8D9J SAMHD1-DNA complex 提交 2022-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM CaCl2, 20% PEG 3350, and 4% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD)	分辨率 2.82 Å R-free 0.242
8D9J SAMHD1-DNA complex 提交 2022-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM CaCl2, 20% PEG 3350, and 4% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD)	分辨率 2.82 Å R-free 0.242
8GB1 Crystal structure of SAMHD1 dimer bound to deoxyguanosine linked inhibitor 提交 2023-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）	未记录	YWI 5'-O-[(R)-(3-{[(1M)-3'-bromo[1,1'-biphenyl]-3-carbonyl]amino}propoxy)(hydroxy)phosphoryl]-2'-deoxyguanosine × 2 FE FE (III) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；17% PEG3350, 0.15 M Ammonium citrate pH 7.3, 293 K, 5 mg/mL, 1 uL protein + 2 uL ML. Soak 1 uL of 1 mM compound	分辨率 2.46 Å R-free 0.236
8GB1 Crystal structure of SAMHD1 dimer bound to deoxyguanosine linked inhibitor 提交 2023-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	YWI 5'-O-[(R)-(3-{[(1M)-3'-bromo[1,1'-biphenyl]-3-carbonyl]amino}propoxy)(hydroxy)phosphoryl]-2'-deoxyguanosine × 2 FE FE (III) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；17% PEG3350, 0.15 M Ammonium citrate pH 7.3, 293 K, 5 mg/mL, 1 uL protein + 2 uL ML. Soak 1 uL of 1 mM compound	分辨率 2.46 Å R-free 0.236
8GB2 Crystal structure of Apo-SAMHD1 提交 2023-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；17% PEG3350, 0.15 M Ammonium citrate pH 7.3, 293 K, 5 mg/mL, 1 uL protein + 2 uL ML.	分辨率 3.07 Å R-free 0.250
8GB2 Crystal structure of Apo-SAMHD1 提交 2023-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；17% PEG3350, 0.15 M Ammonium citrate pH 7.3, 293 K, 5 mg/mL, 1 uL protein + 2 uL ML.	分辨率 3.07 Å R-free 0.250
8QXJ Cryo-EM structure of tetrameric human SAMHD1 with dApNHpp 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	DZ4 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine × 8 FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.65 Å
8QXK Cryo-EM structure of tetrameric human SAMHD1 State I - Tense 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 12 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.66 Å
8QXL Cryo-EM structure of tetrameric human SAMHD1 State II - Hemi-relaxed 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 DCZ 2'-DEOXYCYTIDINE × 2 3PO TRIPHOSPHATE × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.82 Å
8QXM Cryo-EM structure of tetrameric human SAMHD1 State III - Relaxed 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
8QXN Cryo-EM structure of tetrameric human SAMHD1 State IV - Depleted relaxed 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 4 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
8QXO Cryo-EM structure of tetrameric human SAMHD1 State V - Depleted relaxed 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 C 1–626（626 aa）链 D 1–626（626 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 FE FE (III) ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
8TDV ssRNA bound SAMHD1 T closed 提交 2023-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 E 1–626（626 aa）链 F 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8TDW ssRNA bound SAMHD1 T open 提交 2023-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–626（626 aa）链 B 1–626（626 aa）链 E 1–626（626 aa）链 F 1–626（626 aa）	未记录	FE FE (III) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
9EC2 Crystal structure of SAMHD1 dimer bound to an inhibitor obtained from high-throughput chemical tethering to the guanine antiviral acyclovir 提交 2024-11-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 113–626（514 aa）链 B 113–626（514 aa）链 C 113–626（514 aa）链 D 113–626（514 aa）	未记录	A1BHL N-[5-({2-[(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)methoxy]ethyl}amino)-5-oxopentyl]-4,7-dibromo-3-hydroxynaphthalene-2-carboxamide × 4 FE FE (III) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；Apo DELTA 112- SAMHD1 crystals were obtained by the hanging drop method using 1 micro L of 5 mg/mL Delta 112-SAMHD1 (10 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM NaCl, 4 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP) and 2 L 17% PEG3350, 0.15 M Ammonium citrate pH 7.3. Drops were placed in 20 degrees C for over a week, and large crystal rods and plates were observed	分辨率 2.72 Å R-free 0.234
9HIW Cryo-EM structure of CDK2-cyclin A bound to a SAMHD1 peptide 提交 2024-11-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 614–626（13 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	SAMH1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 37–550； UniProt 113–626 作者链 B； PDB构建体 37–550； UniProt 113–626 作者链 C； PDB构建体 37–550； UniProt 113–626 作者链 D； PDB构建体 37–550； UniProt 113–626

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6dw3
沉积日期 deposition_date	2018-06-26
结构标题 title	SAMHD1 Bound to Cytarabine-TP in the Catalytic Pocket
关键词 keywords	;Complex, deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase, dNTPase, nucleotide analogue, cytarabine-TP, HYDROLASE, hydrolase inhibitor, hydrolase-hydrolase inhibitor complex ;; hydrolase/hydrolase inhibitor
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	36.18 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	35.74 Å
零角强度 I(0) i0	803307000.00
分子量 molecular_weight	228780.0 kDa
排除体积 excluded_volume	285120 Å³
包络体积 envelope_volume	352880 Å³
水化壳体积 shell_volume	75585 Å³
包络直径 envelope_diameter	110.3 Å
壳层 Rg shell_rg	46.19 Å
包络 Rg envelope_rg	35.88 Å
形状 Rg shape_rg	35.72 Å
总 Rg total_rg	36.40 Å
总原子数 total_atoms	16062
残基数 n_residues	1919
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	108.9 Å
Rg (实空间) rg_real	35.90 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.43 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.0330e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1560e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	36.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	803400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8967
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	47.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.085
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.515
角度范围 angular_range	— – 0.2200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	579700000.0000
实空间数据点数 n_real_points	45
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.922; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.961; Smooth: 0.926

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1
分子量 formula_weight	63426.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.5.-
突变 mutation	H206R, D207N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,C,B,A
原子数 atom_count	16399

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASMTGGQQMGRDPNSDTMKVINDPIHGHIELHPLLVRIIDTPQFQRLRYIKQLGGGYYVFPGASHNRFEHSLGVGYLAGCLVHALGEKQPELQISERDVLCVQIAGLCRNLGHGPFSHMFDGRFIPLARPEVKWTHEQGSVMMFEHLINSNGIKPVMEQYGLIPEEDICFIKEQIVGPLESPVEDSLWPYKGRPENKSFLYEIVSNKRNGIDVDKWDYFARDCHHLGIQNNFDYKRFIKFARVCEVDNELRICARDKEVGNLYDMFHTRNSLHRRAYQHKVGNIIDTMITDAFLKADDYIEITGAGGKKYRISTAIDDMEAYTKLTDNIFLEILYSTDPKLKDAREILKQIEYRNLFKYVGETQPTGQIKIKREDYESLPKEVASAKPKVLLDVKLKAEDFIVDVINMDYGMQEKNPIDHVSFYCKTAPNRAIRITKNQVSQLLPEKFAEQLIRVYCKKVDRKSLYAARQYFVQWCADRNFTKPQDGDVIAPLITPQKKEWNDSTSVQNPTRLREASKSRVQLFKDDPM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	4-amino-1-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one
分子量 formula_weight	483.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	;2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE ;
分子量 formula_weight	491.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	295

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	87.340 Å
晶胞边长 b length_b	147.325 Å
晶胞边长 c length_c	98.537 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	114.64 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.1920
R_work r_work	0.1901
R_free r_free	0.2280

fit	/app/data/saxs_computation/dw/6dw3/6dw3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dw/6dw3/6dw3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dw/6dw3/6dw3.dat