SAXSdb — 6e2h

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protein dpy-30 homolog × 2 （Q9C005） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ASH2L_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 9–214； UniProt 380–622

Protein dpy-30 homolog

Homo sapiens

UniProt Q9C005

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2 × 1 （Q9UBL3） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DPY30_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 2–100； UniProt 1–99 作者链 F； PDB构建体 2–100； UniProt 1–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6e2h
沉积日期 deposition_date	2018-07-11
结构标题 title	Crystal structure of human Ash2L (SPRY domain and SDI motif) in complex with full length DPY-30
关键词 keywords	histone, epigenetics, SET1, MLL, lysine methylation, nucleosome, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6e2h__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6e2h__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6e2h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.50 Å
Rg（电子密度）	22.87 Å
总 Rg	23.68 Å
原子数	2445
残基数	311
排除体积	43832 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6e2h__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
分子量 formula_weight	23974.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	2663

ATYAMGSMRVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASHGVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDVLGFYINLPEDTISGRGSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTVSINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein dpy-30 homolog
分子量 formula_weight	11318.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

GMEPEQMLEGQTQVAENPHSEYGLTDNVERIVENEKINAEKSSKQKVDLQSLPTRAYLDQTVVPILLQGLAVLAKERPPNPIEFLASYLLKNKAQFEDRN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	188

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	6e2hD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	920 — SPRY domain

结构域编号 domain_id	6e2hE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	890 — cAMP-dependent Protein Kinase, Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit, dimerization-anchoring domain

结构域编号 domain_id	6e2hF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	890 — cAMP-dependent Protein Kinase, Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit, dimerization-anchoring domain

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晶胞边长 a length_a	103.011 Å
晶胞边长 b length_b	103.011 Å
晶胞边长 c length_c	129.138 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.236 Å
最低分辨率 resolution_low	63.443 Å
R 因子 r_factor	0.1780
R_work r_work	0.1768
R_free r_free	0.1997

Crystal structure of human Ash2L (SPRY domain and SDI motif) in complex with full length DPY-30

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein dpy-30 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6e2h__assembly_1__model_1

6e2h__assembly_1__model_1 | I(q)

6e2h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of human Ash2L (SPRY domain and SDI motif) in complex with full length DPY-30

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein dpy-30 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6e2h__assembly_1__model_1

6e2h__assembly_1__model_1 | I(q)

6e2h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)