6emw

Structure of S.aureus ClpC in complex with MecA

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit

Staphylococcus aureus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4P9AXU9） Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily × 6 （A0A0U1MEM2） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （W8U1E4） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） Adapter protein MecA × 6 （A0A077UK83）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A4V1GG18_STAAU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–82； UniProt 713–794 作者链 G； PDB构建体 1–82； UniProt 713–794 作者链 M； PDB构建体 1–82； UniProt 713–794 作者链 S； PDB构建体 1–82； UniProt 713–794 作者链 Y； PDB构建体 1–82； UniProt 713–794 作者链 k； PDB构建体 1–82； UniProt 713–794

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit

Staphylococcus aureus

UniProt A0A4P9AXU9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4V1GG18） Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily × 6 （A0A0U1MEM2） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （W8U1E4） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） Adapter protein MecA × 6 （A0A077UK83）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A4P9AXU9_STAAU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–225； UniProt 488–712 作者链 H； PDB构建体 1–225； UniProt 488–712 作者链 N； PDB构建体 1–225； UniProt 488–712 作者链 T； PDB构建体 1–225； UniProt 488–712 作者链 Z； PDB构建体 1–225； UniProt 488–712 作者链 l； PDB构建体 1–225； UniProt 488–712

Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily

Staphylococcus aureus

UniProt A0A0U1MEM2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4V1GG18） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4P9AXU9） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （W8U1E4） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） Adapter protein MecA × 6 （A0A077UK83）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1MEM2_STAAU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–55； UniProt 411–465 作者链 I； PDB构建体 1–55； UniProt 411–465 作者链 O； PDB构建体 1–55； UniProt 411–465 作者链 U； PDB构建体 1–55； UniProt 411–465 作者链 a； PDB构建体 1–55； UniProt 411–465 作者链 m； PDB构建体 1–55； UniProt 411–465

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC

Staphylococcus aureus

UniProt W8U1E4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4V1GG18） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4P9AXU9） Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily × 6 （A0A0U1MEM2） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） Adapter protein MecA × 6 （A0A077UK83）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	W8U1E4_STAAU
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–145； UniProt 343–487 作者链 J； PDB构建体 1–145； UniProt 343–487 作者链 P； PDB构建体 1–145； UniProt 343–487 作者链 V； PDB构建体 1–145； UniProt 343–487 作者链 b； PDB构建体 1–145； UniProt 343–487 作者链 n； PDB构建体 1–145； UniProt 343–487

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC

Staphylococcus aureus (strain bovine RF122 / ET3-1)

UniProt Q2YSD6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4V1GG18） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4P9AXU9） Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily × 6 （A0A0U1MEM2） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （W8U1E4） Adapter protein MecA × 6 （A0A077UK83）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPC_STAAB
Isoform	—
PDB实体	5, 6
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–181； UniProt 162–342 作者链 K； PDB构建体 1–181； UniProt 162–342 作者链 Q； PDB构建体 1–181； UniProt 162–342 作者链 W； PDB构建体 1–181； UniProt 162–342 作者链 c； PDB构建体 1–181； UniProt 162–342 作者链 o； PDB构建体 1–181； UniProt 162–342 作者链 F； PDB构建体 1–157； UniProt 5–161 作者链 L； PDB构建体 1–157； UniProt 5–161 作者链 R； PDB构建体 1–157； UniProt 5–161 作者链 X； PDB构建体 1–157； UniProt 5–161 作者链 d； PDB构建体 1–157； UniProt 5–161 作者链 p； PDB构建体 1–157； UniProt 5–161

Adapter protein MecA

Staphylococcus aureus

UniProt A0A077UK83

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 42	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4V1GG18） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit × 6 （A0A4P9AXU9） Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily × 6 （A0A0U1MEM2） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （W8U1E4） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6） ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC × 6 （Q2YSD6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A077UK83_STAAU
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 f； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 g； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 h； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 i； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90 作者链 j； PDB构建体 1–90； UniProt 1–90

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6emw
沉积日期 deposition_date	2017-10-03
结构标题 title	Structure of S.aureus ClpC in complex with MecA
关键词 keywords	Chaperone, AAA+ protein, unfoldase; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6emw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6emw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6emw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.13 Å
Rg（电子密度）	58.60 Å
总 Rg	58.78 Å
原子数	15210
残基数	5070
排除体积	233190 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6emw__assembly_1__model_1`	42-meric （42）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit
分子量 formula_weight	9325.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,G,M,S,Y,k
原子数 atom_count	15210

KLTKEELKEIVTMMVNKLTNRLSEQNINIIVTDKAKDKIAEEGYDPEYGARPLIRAIQKTIEDNLSELILDGNQIEGKKVTV

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit
分子量 formula_weight	25183.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,H,N,T,Z,l

LTKINETESEKLLSLEDTLHERVIGQKDAVNSISKAVRRARAGLKDPKRPIGSFIFLGPTGVGKTELARALAESMFGDDDAMIRVDMSEFMEKHAVSRLVGAPPGYVGHDDGGQLTEKVRRKPYSVILFDEIEKAHPDVFNILLQVLDDGHLTDTKGRTVDFRNTIIIMTSNVGAQELQDQRFAGFGGSSDGQDYETIRKTMLKELKNSFRPEFLNRVDDIIVFH

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily
分子量 formula_weight	6539.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,I,O,U,a,m

NNLKEIEQEIEKVKNEKDAAVHAQEFENAANLRDKQTKLEKQYEEAKNEWKNAQN

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
分子量 formula_weight	16426.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,J,P,V,b,n

SVVDTVAILKGLRDRYEAHHRINISDEAIEAAVKLSNRYVSDRFLPDKAIDLIDEASSKVRLKSHTTPNNLKEIEQEIEKVKNEKDAAVHAQEFENAANLRDKQTKLEKQYEEAKNEWKNAQNGMSTSLSEEDIAEVIAGWTGIP

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
分子量 formula_weight	19699.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,K,Q,W,c,o

TLDSLARDLTVIAKDGTLDPVIGRDKEITRVIEVLSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIAEGLAQAIVNNEVPETLKDKRVMSLDMGTVVAGTKYRGEFEERLKKVMEEIQQAGNVILFIDELHTLVGAGGAEGAIDASNILKPALARGELQCIGATTLDEYRKNIEKDAALERRFQPVQVDEP

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus (strain bovine RF122 / ET3-1)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	273036
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
分子量 formula_weight	17446.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,L,R,X,d,p

RLTERAQRVLAHAQEEAIRLNHSNIGTEHLLLGLMKEPEGIAAKVLESFNITEDKVIEEVEKLIGHGQDHVGTLHYTPRAKKVIELSMDEARKLHHNFVGTEHILLGLIRENEGVAARVFANLDLNITKARAQVVKALGNPEMSNKNAQASKSNNTP

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus (strain bovine RF122 / ET3-1)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	273036
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Adapter protein MecA
分子量 formula_weight	10758.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e,f,g,h,i,j

MRIERVDDTTVKLFITYSDIEARGFSREDLWTNRKRGEEFFWSMMDEINEEEDFVVEGPLWIQVHAFEKGVEVTISKSKNEDMMNMSDDD

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1280
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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分辨率 resolution	11.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	11.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	26000

Structure of S.aureus ClpC in complex with MecA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Class III stress response-related ATPase, AAA+ superfamily

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Adapter protein MecA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6emw__assembly_1__model_1

6emw__assembly_1__model_1 | I(q)

6emw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source