Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ZINC ION × 2 CALCIUM ION × 3 (2~{S})-2-[2-[4-(4-methoxyphenyl)phenyl]sulfanylphenyl]pentanedioic acid × 1 piperazine × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | MMP9_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–107； UniProt 110–216 作者链 A； PDB构建体 108–160； UniProt 392–444 |
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| 条目编号 entry_id | 6esm |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-10-23 |
| 结构标题 title | Crystal structure of MMP9 in complex with inhibitor BE4. |
| 关键词 keywords | metzincin, carboxylate inhibitor alternative zinc-binding groups, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.74 Å |
| Rg（电子密度） | 14.52 Å |
| 总 Rg | 15.72 Å |
| 原子数 | 1294 |
| 残基数 | 158 |
| 排除体积 | 22897 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6esma_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.92 — Zincin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain |
| 家族 Family family | d.92.1.11 — Matrix metalloproteases, catalytic domain |
| 结构域编号 domain_id | 6esmA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 390 — Collagenase (Catalytic Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Collagenase (Catalytic Domain) |