6et5

Reaction centre light harvesting complex 1 from Blc. virids

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Reaction center protein L chain × 1 （P06009） Reaction center protein M chain × 1 （P06010） Reaction center protein H chain × 1 （P06008） Light-harvesting protein B-1015 alpha chain × 17 （P04123） Light-harvesting protein B-1015 beta chain × 17 （P04124） Light-harvesting protein B-1015 gamma chain × 16 （P04126） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CYCR_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–333； UniProt 21–353

Reaction center protein L chain

物种未注明

UniProt P06009

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit × 1 （P07173） Reaction center protein M chain × 1 （P06010） Reaction center protein H chain × 1 （P06008） Light-harvesting protein B-1015 alpha chain × 17 （P04123） Light-harvesting protein B-1015 beta chain × 17 （P04124） Light-harvesting protein B-1015 gamma chain × 16 （P04126） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RCEL_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–274； UniProt 1–274

Reaction center protein M chain

物种未注明

UniProt P06010

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit × 1 （P07173） Reaction center protein L chain × 1 （P06009） Reaction center protein H chain × 1 （P06008） Light-harvesting protein B-1015 alpha chain × 17 （P04123） Light-harvesting protein B-1015 beta chain × 17 （P04124） Light-harvesting protein B-1015 gamma chain × 16 （P04126） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RCEM_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–323； UniProt 2–324

Reaction center protein H chain

物种未注明

UniProt P06008

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit × 1 （P07173） Reaction center protein L chain × 1 （P06009） Reaction center protein M chain × 1 （P06010） Light-harvesting protein B-1015 alpha chain × 17 （P04123） Light-harvesting protein B-1015 beta chain × 17 （P04124） Light-harvesting protein B-1015 gamma chain × 16 （P04126） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RCEH_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258

Light-harvesting protein B-1015 alpha chain

物种未注明

UniProt P04123

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit × 1 （P07173） Reaction center protein L chain × 1 （P06009） Reaction center protein M chain × 1 （P06010） Reaction center protein H chain × 1 （P06008） Light-harvesting protein B-1015 beta chain × 17 （P04124） Light-harvesting protein B-1015 gamma chain × 16 （P04126） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LHA_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 6； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 F； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 K； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 P； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 S； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 V； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 Y； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 b； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 e； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 h； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 k； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 n； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 q； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 t； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 w； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59 作者链 z； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59

Light-harvesting protein B-1015 beta chain

物种未注明

UniProt P04124

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit × 1 （P07173） Reaction center protein L chain × 1 （P06009） Reaction center protein M chain × 1 （P06010） Reaction center protein H chain × 1 （P06008） Light-harvesting protein B-1015 alpha chain × 17 （P04123） Light-harvesting protein B-1015 gamma chain × 16 （P04126） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LHB_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 4； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 7； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 G； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 N； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 Q； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 T； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 W； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 Z； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 c； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 f； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 i； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 l； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 o； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 r； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 u； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56 作者链 x； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56

Light-harvesting protein B-1015 gamma chain

物种未注明

UniProt P04126

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit × 1 （P07173） Reaction center protein L chain × 1 （P06009） Reaction center protein M chain × 1 （P06010） Reaction center protein H chain × 1 （P06008） Light-harvesting protein B-1015 alpha chain × 17 （P04123） Light-harvesting protein B-1015 beta chain × 17 （P04124） HEME C × 4 BACTERIOCHLOROPHYLL B × 38 BACTERIOPHEOPHYTIN B × 2 Ubiquinone-9 × 2 FE (III) ION × 1 SULFATE ION × 7 LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 MENAQUINONE-9 × 1 15-cis-1,2-dihydroneurosporene × 1 all-trans-1,2-dihydroneurosporene × 17	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LHG_BLAVI
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 5； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 I； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 O； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 R； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 U； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 X； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 a； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 d； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 g； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 j； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 m； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 p； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 s； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 v； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36 作者链 y； PDB构建体 1–24； UniProt 13–36

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6et5
沉积日期 deposition_date	2017-10-25
结构标题 title	Reaction centre light harvesting complex 1 from Blc. virids
关键词 keywords	Reaction centre light harvesting complex 1 Blc. viridis Cryo-EM RC-LH1 Photosynthesis, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6et5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6et5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6et5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.80 Å
Rg（电子密度）	47.65 Å
总 Rg	48.17 Å
原子数	31994
残基数	3491
排除体积	593080 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6et5__assembly_1__model_1`	54-meric （54）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit
分子量 formula_weight	37179.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	31994

CFEPPPATTTQTGFRGLSMGEVLHPATVKAKKERDAQYPPALAAVKAEGPPVSQVYKNVKVLGNLTEAEFLRTMTAITEWVSPQEGCTYCHDENNLASEAKYPYVVARRMLEMTRAINTNWTQHVAQTGVTCYTCHRGTPLPPYVRYLEPTLPLNNRETPTHVERVETRSGYVVRLAKYTAYSALNYDPFTMFLANDKRQVRVVPQTALPLVGVSRGKERRPLSDAYATFALMMSISDSLGTNCTFCHNAQTFESWGKKSTPQRAIAWWGIRMVRDLNMNYLAPLNASLPASRLGRQGEAPQADCRTCHQGVTKPLFGASRLKDYPELGPIKA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Reaction center protein L chain
分子量 formula_weight	30600.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MALLSFERKYRVRGGTLIGGDLFDFWVGPYFVGFFGVSAIFFIFLGVSLIGYAASQGPTWDPFAISINPPDLKYGLGAAPLLEGGFWQAITVCALGAFISWMLREVEISRKLGIGWHVPLAFCVPIFMFCVLQVFRPLLLGSWGHAFPYGILSHLDWVNNFGYQYLNWHYNPGHMSSVSFLFVNAMALGLHGGLILSVANPGDGDKVKTAEHENQYFRDVVGYSIGALSIHRLGLFLASNIFLTGAFGTIASGPFWTRGWPEWWGWWLDIPFWS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Reaction center protein M chain
分子量 formula_weight	35932.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

ADYQTIYTQIQARGPHITVSGEWGDNDRVGKPFYSYWLGKIGDAQIGPIYLGASGIAAFAFGSTAILIILFNMAAEVHFDPLQFFRQFFWLGLYPPKAQYGMGIPPLHDGGWWLMAGLFMTLSLGSWWIRVYSRARALGLGTHIAWNFAAAIFFVLCIGCIHPTLVGSWSEGVPFGIWPHIDWLTAFSIRYGNFYYCPWHGFSIGFAYGCGLLFAAHGATILAVARFGGDREIEQITDRGTAVERAALFWRWTIGFNATIESVHRWGWFFSLMVMVSASVGILLTGTFVDNWYLWCVKHGAAPDYPAYLPATPDPASLPGAPK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Reaction center protein H chain
分子量 formula_weight	28557.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MYHGALAQHLDIAQLVWYAQWLVIWTVVLLYLRREDRREGYPLVEPLGLVKLAPEDGQVYELPYPKTFVLPHGGTVTVPRRRPETRELKLAQTDGFEGAPLQPTGNPLVDAVGPASYAERAEVVDATVDGKAKIVPLRVATDFSIAEGDVDPRGLPVVAADGVEAGTVTDLWVDRSEHYFRYLELSVAGSARTALIPLGFCDVKKDKIVVTSILSEQFANVPRLQSRDQITLREEDKVSAYYAGGLLYATPERAESLL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Light-harvesting protein B-1015 alpha chain
分子量 formula_weight	6984.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	17

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	z,F,K,P,S,V,Y,b,e,h,k,n,q,t,w,3,6

MATEYRTASWKLWLILDPRRVLTALFVYLTVIALLIHFGLLSTDRLNWWEFQRGLPKAA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Light-harvesting protein B-1015 beta chain
分子量 formula_weight	6274.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	17

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,G,N,Q,T,W,Z,c,f,i,l,o,r,u,x,4,7

MADLKPSLTGLTEEEAKEFHGIFVTSTVLYLATAVIVHYLVWTARPWIAPIPKGWV

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Light-harvesting protein B-1015 gamma chain
分子量 formula_weight	2799.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	16

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2,I,O,R,U,X,a,d,g,j,m,p,s,v,y,5

SDWNLWVPLGILGIPTIWIALTYR

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	BACTERIOCHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	909.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	38

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	BACTERIOPHEOPHYTIN B
分子量 formula_weight	887.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	Ubiquinone-9
分子量 formula_weight	795.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	FE (III) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE
分子量 formula_weight	229.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MENAQUINONE-9
分子量 formula_weight	785.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	15-cis-1,2-dihydroneurosporene
分子量 formula_weight	540.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	all-trans-1,2-dihydroneurosporene
分子量 formula_weight	540.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 54 domains

SCOP 2.08 (29 domains)

结构域编号 domain_id	d6et51_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et53_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et54_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et56_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et57_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5b_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5c_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.138 — Multiheme cytochromes
超家族 Superfamily superfamily	a.138.1 — Multiheme cytochromes
家族 Family family	a.138.1.2 — Photosynthetic reaction centre (cytochrome subunit)

结构域编号 domain_id	d6et5e_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5f_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5g_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5h1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.10 — Photosystem II reaction centre subunit H, transmembrane region
家族 Family family	f.23.10.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5h2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.41 — PRC-barrel domain
超家族 Superfamily superfamily	b.41.1 — PRC-barrel domain
家族 Family family	b.41.1.1 — Photosynthetic reaction centre, H-chain, cytoplasmic domain

结构域编号 domain_id	d6et5i_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5k_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5l_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5m_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.26 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.26.1 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits
家族 Family family	f.26.1.1 — Bacterial photosystem II reaction centre, L and M subunits

结构域编号 domain_id	d6et5n_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5o_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5p_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5q_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5r_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5s_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5t_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5u_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5v_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5w_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5x_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5y_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6et5z_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.3 — Light-harvesting complex subunits
超家族 Superfamily superfamily	f.3.1 — Light-harvesting complex subunits
家族 Family family	f.3.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (25 domains)

结构域编号 domain_id	6et5300
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5600
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	468 — Photosynthetic Reaction Center, subunit C; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosynthetic Reaction Center, subunit C, domain 2

结构域编号 domain_id	6et5C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	468 — Photosynthetic Reaction Center, subunit C; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosynthetic Reaction Center, subunit C, domain 2

结构域编号 domain_id	6et5F00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5H01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	540 — Photosynthetic Reaction Center; Chain H, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosynthetic reaction centre, H subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6et5H02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	50 — Photosynthetic Reaction Center; Chain H, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosynthetic Reaction Center, subunit H, domain 2

结构域编号 domain_id	6et5K00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5L01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	6et5L02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	6et5M01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	6et5M02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	85 — Photosynthetic Reaction Center, subunit M; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem II protein D1-like

结构域编号 domain_id	6et5P00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5S00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5V00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5Y00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5b00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5e00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5h00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5k00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5n00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5q00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5t00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5w00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

结构域编号 domain_id	6et5z00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	220 — Light-harvesting Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Light-harvesting complex

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.870 Å
最低分辨率 resolution_low	2.870 Å
R 因子 r_factor	0.3520
R_work r_work	0.3520
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.87 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	267726

Reaction centre light harvesting complex 1 from Blc. virids

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosynthetic reaction center cytochrome c subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Reaction center protein L chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Reaction center protein M chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Reaction center protein H chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Light-harvesting protein B-1015 alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Light-harvesting protein B-1015 beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Light-harvesting protein B-1015 gamma chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6et5__assembly_1__model_1

6et5__assembly_1__model_1 | I(q)

6et5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer