SAXSdb — 6f9n

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–1443	未记录	;pre-mRNA 3' end processing protein WDR33 ; × 1 （Q9C0J8）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；11% w/v PEG3400 37.5 mM Ammonium Formate 112.5 mM Magnesium Formate	分辨率 2.50 Å R-free 0.263

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6F9N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6BLY Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33 complex at 3.36A resolution 提交 2017-11-12	实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
6BM0 Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33 complex at 3.8 A resolution 提交 2017-11-12	实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 300 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6DNH Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33-CPSF-30-PAS RNA complex at 3.4 A resolution 提交 2018-06-06	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6FUW Cryo-EM structure of the human CPSF160-WDR33-CPSF30 complex bound to the PAS AAUAAA motif at 3.1 Angstrom resolution 提交 2018-02-28	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；15 seconds wait time prior to blotting	分辨率 3.07 Å
6URG Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-CPSF100 PIM complex 提交 2019-10-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6URO Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-PAS RNA-CstF77 complex 提交 2019-10-23	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8E3I CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF IN COMPLEX WITH THE AUUAAA poly(A) signal 提交 2022-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8E3Q CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF 提交 2022-08-17	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
8R8R Cryo-EM structure of the human mPSF with PAPOA C-terminus peptide (PAPOAc) 提交 2023-11-29	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.79 Å
9OXE CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AGUAAA poly(A) signal 提交 2025-06-03	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
9OXS CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AAUAAU poly(A) signal 提交 2025-06-04	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
9T3X cryo-EM structure of CPSF160-WDR33-ZC3H18 提交 2025-10-30	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–1443（1443 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 5mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.10 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CPSF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1443； UniProt 1–1443

;pre-mRNA 3' end processing protein WDR33 ;

Homo sapiens

UniProt Q9C0J8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 35–410	未记录	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 × 1 （Q10570）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；11% w/v PEG3400 37.5 mM Ammonium Formate 112.5 mM Magnesium Formate	分辨率 2.50 Å R-free 0.263

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6F9N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6BLY Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33 complex at 3.36A resolution 提交 2017-11-12	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
6BM0 Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33 complex at 3.8 A resolution 提交 2017-11-12	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 300 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6DNH Cryo-EM structure of human CPSF-160-WDR33-CPSF-30-PAS RNA complex at 3.4 A resolution 提交 2018-06-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9；25 mM Tris-HCl, pH 7.9, 380 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
6FUW Cryo-EM structure of the human CPSF160-WDR33-CPSF30 complex bound to the PAS AAUAAA motif at 3.1 Angstrom resolution 提交 2018-02-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–410（410 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；15 seconds wait time prior to blotting	分辨率 3.07 Å
6URG Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-CPSF100 PIM complex 提交 2019-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6URO Cryo-EM structure of human CPSF160-WDR33-CPSF30-PAS RNA-CstF77 complex 提交 2019-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8E3I CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF IN COMPLEX WITH THE AUUAAA poly(A) signal 提交 2022-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
8E3Q CRYO-EM STRUCTURE OF the human MPSF 提交 2022-08-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–572（572 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris (pH 8.0), 150 mM NaCl, and 5 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å
8R8R Cryo-EM structure of the human mPSF with PAPOA C-terminus peptide (PAPOAc) 提交 2023-11-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 B 1–413（413 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.79 Å
9OXE CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AGUAAA poly(A) signal 提交 2025-06-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–572（571 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å
9OXS CRYO-EM STRUCTURE OF the human mPSF IN COMPLEX WITH THE AAUAAU poly(A) signal 提交 2025-06-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–572（571 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
9T3X cryo-EM structure of CPSF160-WDR33-ZC3H18 提交 2025-10-30	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–413（413 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES pH 7.5, 150mM NaCl, 5mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.10 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	WDR33_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–379； UniProt 35–410

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6f9n
沉积日期 deposition_date	2017-12-14
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN CPSF160-WDR33 COMPLEX
关键词 keywords	;Polyadenylation, mRNA, beta propeller, cpsf, 3' end processing, RNA BINDING PROTEIN ;; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.11 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.55 Å
零角强度 I(0) i0	437296000.00
分子量 molecular_weight	172710.0 kDa
排除体积 excluded_volume	217290 Å³
包络体积 envelope_volume	272330 Å³
水化壳体积 shell_volume	61152 Å³
包络直径 envelope_diameter	132.9 Å
壳层 Rg shell_rg	43.51 Å
包络 Rg envelope_rg	36.52 Å
形状 Rg shape_rg	36.55 Å
总 Rg total_rg	36.98 Å
总原子数 total_atoms	12162
残基数 n_residues	1537
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	122.6 Å
Rg (实空间) rg_real	37.14 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.95 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.3730e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.1860e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.12 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	437300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8613
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	42.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.430
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.124
角度范围 angular_range	— – 0.2150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	123200000.0000
实空间数据点数 n_real_points	44
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.842; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.670

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1
分子量 formula_weight	161074.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	12264

MYAVYKQAHPPTGLEFSMYCNFFNNSERNLVVAGTSQLYVYRLNRDAEALTKNDRSTEGKAHREKLELAASFSFFGNVMSMASVQLAGAKRDALLLSFKDAKLSVVEYDPGTHDLKTLSLHYFEEPELRDGFVQNVHTPRVRVDPDGRCAAMLVYGTRLVVLPFRRESLAEEHEGLVGEGQRSSFLPSYIIDVRALDEKLLNIIDLQFLHGYYEPTLLILFEPNQTWPGRVAVRQDTCSIVAISLNITQKVHPVIWSLTSLPFDCTQALAVPKPIGGVVVFAVNSLLYLNQSVPPYGVALNSLTTGTTAFPLRTQEGVRITLDCAQATFISYDKMVISLKGGEIYVLTLITDGMRSVRAFHFDKAAASVLTTSMVTMEPGYLFLGSRLGNSLLLKYTEKLQEPPASAVREAADKEEPPSKKKRVDATAGWSAAGKSVPQDEVDEIEVYGSEAQSGTQLATYSFEVCDSILNIGPCANAAVGEPAFLSEEFQNSPEPDLEIVVCSGHGKNGALSVLQKSIRPQVVTTFELPGCYDMWTVIAPVRKEEEDNPKGEGTEQEPSTTPEADDDGRRHGFLILSREDSTMILQTGQEIMELDTSGFATQGPTVFAGNIGDNRYIVQVSPLGIRLLEGVNQLHFIPVDLGAPIVQCAVADPYVVIMSAEGHVTMFLLKSDSYGGRHHRLALHKPPLHHQSKVITLCLYRDLSGMFTTESRLGGARDELGGRSGPEAEGLGSETSPTVDDEEEMLYGDSGSLFSPSKEEARRSSQPPADRDPAPFRAEPTHWCLLVRENGTMEIYQLPDWRLVFLVKNFPVGQRVLVDSSFGQPTTQGEARREEATRQGELPLVKEVLLVALGSRQSRPYLLVHVDQELLIYEAFPHDSQLGQGNLKVRFKKVPHNINFREKKPKPSKKKAEGGGAEEGAGARGRVARFRYFEDIYGYSGVFICGPSPHWLLVTGRGALRLHPMAIDGPVDSFAPFHNVNCPRGFLYFNRQGELRISVLPAYLSYDAPWPVRKIPLRCTAHYVAYHVESKVYAVATSTNTPCARIPRMTGEEKEFETIERDERYIHPQQEAFSIQLISPVSWEAIPNARIELQEWEHVTCMKTVSLRSEETVSGLKGYVAAGTCLMQGEEVTCRGRILIMDVIEVVPEPGQPLTKNKFKVLYEKEQKGPVTALCHCNGHLVSAIGQKIFLWSLRASELTGMAFIDTQLYIHQMISVKNFILAADVMKSISLLRYQEESKTLSLVSRDAKPLEVYSVDFMVDNAQLGFLVSDRDRNLMVYMYLPEAKESFGGMRLLRRADFHVGAHVNTFWRTPCRGATEGLSKKSVVWENKHITWFATLDGGIGLLLPMQEKTYRRLLMLQNALTTMLPHHAGLNPRAFRMLHVDRRTLQNAVRNVLDGELLNRYLYLSTMERSELAKKIGTTPDIILDDLLETDRVTAHF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 2 RZ-2014

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;pre-mRNA 3' end processing protein WDR33 ;
分子量 formula_weight	43326.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SNAQQAMQQLTFDGKRMRKAVNRKTIDYNPSVIKYLENRIWQRDQRDMRAIQPDAGYYNDLVPPIGMLNNPMNAVTTKFVRTSTNKVKCPVFVVRWTPEGRRLVTGASSGEFTLWNGLTFNFETILQAHDSPVRAMTWSHNDMWMLTADHGGYVKYWQSNMNNVKMFQAHKEAIREASFSPTDNKFATCSDDGTVRIWDFLRCHEERILRGHGADVKCVDWHPTKGLVVSGSKDSQQPIKFWDPKTGQSLATLHAHKNTVMEVKLNLNGNWLLTASRDHLCKLFDIRNLKEELQVFRGHKKEATAVAWHPVHEGLFASGGSDGSLLFWHVGVEKEVGGMEMAHEGMIWSLAWHPLGHILCSGSNDHTSKFWTRNRPGDK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 2 RZ-2014

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	102

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6f9nA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	67.910 Å
晶胞边长 b length_b	77.400 Å
晶胞边长 c length_c	104.020 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	87.56 °
晶胞夹角 β angle_beta	76.41 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	67.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	47.312 Å
R 因子 r_factor	0.2292
R_work r_work	0.2275
R_free r_free	0.2627

fit	/app/data/saxs_computation/f9/6f9n/6f9n.fit
pddf	/app/data/pr_computation/f9/6f9n/6f9n.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/f9/6f9n/6f9n.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN CPSF160-WDR33 COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

;pre-mRNA 3' end processing protein WDR33 ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)