Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 1,2-ETHANEDIOL × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 (S)-5-(1-acetyl-2-cyclopropyl-4-(2-(hydroxymethyl)benzyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-6-yl)pyrimidine-2-carboxamide × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | BRD2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–115； UniProt 344–455 |
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| 条目编号 entry_id | 6fff |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-01-07 |
| 结构标题 title | Human BRD2 C-terminal bromodomain with (S)-5-(1-acetyl-2-cyclopropyl-4-(2-(hydroxymethyl)benzyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-6-yl)pyrimidine-2-carboxamide |
| 关键词 keywords | INHIBITOR, HISTONE, EPIGENETIC READER, BROMODOMAIN, BRD4, BROMODOMAIN CONTAINING PROTEIN 4, ANTAGONIST, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.69 Å |
| Rg（电子密度） | 14.45 Å |
| 总 Rg | 15.57 Å |
| 原子数 | 978 |
| 残基数 | 113 |
| 排除体积 | 17411 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6fffa1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.29 — Bromodomain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.29.2 — Bromodomain |
| 家族 Family family | a.29.2.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6fffa2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 6fffA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 920 — Histone Acetyltransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bromodomain-like |