SAXSdb — 6fzw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Collagen alpha-1(III) chain

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Procollagen C-endopeptidase enhancer 1 × 1 （Q15113） CALCIUM ION × 5 CITRATE ANION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CO3A1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 12–293； UniProt 1185–1466 作者链 B； PDB构建体 12–293； UniProt 1185–1466 作者链 C； PDB构建体 12–293； UniProt 1185–1466

Procollagen C-endopeptidase enhancer 1

Homo sapiens

UniProt Q15113

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Collagen alpha-1(III) chain × 3 （P02461） CALCIUM ION × 5 CITRATE ANION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PCOC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 5–257； UniProt 26–278

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6fzw
沉积日期 deposition_date	2018-03-15
结构标题 title	Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (long)
关键词 keywords	Collagen, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6fzw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6fzw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6fzw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.45 Å
Rg（电子密度）	34.03 Å
总 Rg	34.23 Å
原子数	13459
残基数	886
排除体积	122090 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6fzw__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Collagen alpha-1(III) chain
分子量 formula_weight	31997.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	13459

ETGHHHHHHSAGPPGPPGAPGPCCGGVGAAAIAGIGGEKAGGFAPYYGDEPMDFKINTDEIMTSLKSVNGQIESLISPDGSRKNPARNCRDLKFCHPELKSGEYWVDPNQGCKLDAIKVFCNMETGETCISANPLNVPRKHWWTDSSAEKKHVWFGESMDGGFQFSYGNPELPEDVLDVQLAFLRLLSSRASQQITYHCKNSIAYMDQASGNVKKALKLMGSNEGEFKAEGNSKFTYTVLEDGCTKHTGEWSKTVFEYRTRKAVRLPIVDIAPYDIGGPDQEFGVDVGPVCFL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Procollagen C-endopeptidase enhancer 1
分子量 formula_weight	28696.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

APLAQTPNYTRPVFLCGGDVKGESGYVASEGFPNLYPPNKECIWTITVPEGQTVSLSFRVFDLELHPACRYDALEVFAGSGTSGQRLGRFCGTFRPAPLVAPGNQVTLRMTTDEGTGGRGFLLWYSGRATSGTEHQFCGGRLEKAQGTLTTPNWPESDYPPGISCSWHIIAPPDQVIALTFEKFDLEPDTYCRYDSVSVFNGAVSDDSRRLGKFCGDAVPGSISSEGNELLVQFVSDLSVTADGFSASYKTLPRGTAAAHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CITRATE ANION
分子量 formula_weight	189.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d6fzwd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.23 — CUB-like
超家族 Superfamily superfamily	b.23.1 — Spermadhesin, CUB domain
家族 Family family	b.23.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6fzwA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1000 —

结构域编号 domain_id	6fzwB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1000 —

结构域编号 domain_id	6fzwC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1000 —

结构域编号 domain_id	6fzwD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	290 — Spermadhesin, CUB domain

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晶胞边长 a length_a	88.880 Å
晶胞边长 b length_b	143.650 Å
晶胞边长 c length_c	156.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.780 Å
最低分辨率 resolution_low	68.787 Å
R 因子 r_factor	0.2486
R_work r_work	0.2474
R_free r_free	0.2712

Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (long)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Collagen alpha-1(III) chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Procollagen C-endopeptidase enhancer 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6fzw__assembly_1__model_1

6fzw__assembly_1__model_1 | I(q)

6fzw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the metalloproteinase enhancer PCPE-1 bound to the procollagen C propeptide trimer (long)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Collagen alpha-1(III) chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Procollagen C-endopeptidase enhancer 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6fzw__assembly_1__model_1

6fzw__assembly_1__model_1 | I(q)

6fzw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)