|
1KI1
Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42
提交 2001-12-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1229–1581(353 aa)
片段:Dbl homology and Pleckstrin homology domains (residues 1229-1580)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.247
|
|
1KI1
Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42
提交 2001-12-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1229–1581(353 aa)
片段:Dbl homology and Pleckstrin homology domains (residues 1229-1580)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.247
|
|
2KGR
Solution structure of protein ITSN1 from Homo sapiens. Northeast Structural Genomics Consortium target HR5524A
提交 2009-03-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
210–312(103 aa)
片段:residues 210-312
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.2;压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-5% 13C; U-99% 15N] protein-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
2KHN
NMR solution structure of the EH 1 domain from human intersectin-1 protein. Northeast Structural Genomics Consortium target HR3646E.
提交 2009-04-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–111(111 aa)
片段:UNP residues 1-111
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)430;压力 ambient
NMR样品组成
0.87 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] HR3646E-1, 20 mM MES-2, 200 mM sodium chloride-3, 5 mM calcium chloride-4, 10 mM DTT-5, 0.02 % sodium azide-6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.81 mM [U-5% 13C; U-98% 15N] HR3646E-7, 20 mM MES-8, 200 mM sodium chloride-9, 5 mM calcium chloride-10, 10 mM DTT-11, 0.02 % sodium azide-12, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
3FIA
Crystal structure of the EH 1 domain from human intersectin-1 protein. Northeast Structural Genomics Consortium target HR3646e.
提交 2008-12-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1–111(111 aa)
片段:residues 1-111
|
突变:M1V, I14T
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
CA CALCIUM ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
microbatch under oil;pH 8.5;277 K;1.5M ammonium sulfate, 12% glycerol, 0.1M TrisHCl, pH 8.5, microbatch under oil , temperature 277K
|
分辨率 1.45 Å
R-free 0.176
|
|
3QBV
Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin
提交 2011-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1229–1579(351 aa)
片段:DH AND PH DOMAINS (UNP Residues 1229-1571)
|
突变:S1373E
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.284
|
|
3QBV
Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin
提交 2011-01-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1229–1579(351 aa)
片段:DH AND PH DOMAINS (UNP Residues 1229-1571)
|
突变:S1373E
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;295 K;100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.284
|
|
4IIM
Crystal structure of the Second SH3 Domain of ITSN1 bound with a synthetic peptide
提交 2012-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
916–970(55 aa)
链 B
916–970(55 aa)
|
未记录
|
UNX UNKNOWN LIGAND × 11
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;1.2 M NaCitrate and 0.1 M Tris, pH 8.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.243
|
|
4IIM
Crystal structure of the Second SH3 Domain of ITSN1 bound with a synthetic peptide
提交 2012-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
916–970(55 aa)
链 B
916–970(55 aa)
|
未记录
|
UNX UNKNOWN LIGAND × 11
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;1.2 M NaCitrate and 0.1 M Tris, pH 8.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.243
|
|
5HZI
Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing C450M mutant LOV2 domain
提交 2016-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1230–1308(79 aa)
链 A
1238–1509(272 aa)
|
未记录
|
FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.285
|
|
5HZI
Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing C450M mutant LOV2 domain
提交 2016-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1230–1308(79 aa)
链 B
1238–1509(272 aa)
|
未记录
|
FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.285
|
|
5HZJ
Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain
提交 2016-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1230–1308(79 aa)
链 A
1309–1580(272 aa)
|
未记录
|
FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.281
|
|
5HZJ
Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain
提交 2016-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
信息不足
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1230–1308(79 aa)
链 B
1309–1580(272 aa)
|
未记录
|
FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.281
|
|
5HZK
Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42
提交 2016-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1230–1308(79 aa)
链 B
1309–1580(272 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.257
|
|
5HZK
Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42
提交 2016-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
信息不足
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1230–1308(79 aa)
链 D
1309–1580(272 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;293 K;0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.257
|
|
6H5T
Intersectin SH3A short isoform
提交 2018-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
741–835(95 aa)
|
未记录
|
7PG 2,5,8,11,14,17,20,23-OCTAOXAPENTACOSAN-25-OL × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;25% (v/v) polyethylene glycol 550 mono-methyl ether, 100 mM MES-NaOH at pH 6.5, and 10 mM ZnSO4
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.191
|
|
6H5T
Intersectin SH3A short isoform
提交 2018-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
741–835(95 aa)
|
未记录
|
7PG 2,5,8,11,14,17,20,23-OCTAOXAPENTACOSAN-25-OL × 1
ZN ZINC ION × 1
ACT ACETATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;25% (v/v) polyethylene glycol 550 mono-methyl ether, 100 mM MES-NaOH at pH 6.5, and 10 mM ZnSO4
|
分辨率 1.69 Å
R-free 0.191
|