Staphylococcus phage phi11
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 24 | Orf20 × 12 （Q9F0J8） MAGNESIUM ION × 6 NICKEL (II) ION × 15 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 21 water × 24 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q8SDV3_BPPHA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 23–191； UniProt 1–169 作者链 C； PDB构建体 23–191； UniProt 1–169 作者链 E； PDB构建体 23–191； UniProt 1–169 作者链 G； PDB构建体 23–191； UniProt 1–169 |
Staphylococcus aureus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 24 | dUTPase × 12 （Q8SDV3） MAGNESIUM ION × 6 NICKEL (II) ION × 15 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 21 water × 24 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q9F0J8_STAAU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 2–157； UniProt 1–156 作者链 D； PDB构建体 2–157； UniProt 1–156 作者链 F； PDB构建体 2–157； UniProt 1–156 作者链 H； PDB构建体 2–157； UniProt 1–156 |
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| 条目编号 entry_id | 6h4c |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-07-20 |
| 结构标题 title | A polyamorous repressor: deciphering the evolutionary strategy used by the phage-inducible chromosomal islands to spread in nature. |
| 关键词 keywords | SaPI, Repressor, Complex, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 54.73 Å |
| Rg（电子密度） | 53.75 Å |
| 总 Rg | 53.84 Å |
| 原子数 | 27384 |
| 残基数 | 3597 |
| 排除体积 | 485950 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6h4ca_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.4 — dUTPase-like |
| 家族 Family family | b.85.4.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6h4cc_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.4 — dUTPase-like |
| 家族 Family family | b.85.4.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6h4ce_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.4 — dUTPase-like |
| 家族 Family family | b.85.4.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6h4cg_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.85 — beta-clip |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.85.4 — dUTPase-like |
| 家族 Family family | b.85.4.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 6h4cA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 70 — Distorted Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Deoxyuridine triphosphatase (dUTPase) |
| 结构域编号 domain_id | 6h4cC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 70 — Distorted Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Deoxyuridine triphosphatase (dUTPase) |
| 结构域编号 domain_id | 6h4cE00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 70 — Distorted Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Deoxyuridine triphosphatase (dUTPase) |
| 结构域编号 domain_id | 6h4cG00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 70 — Distorted Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotidohydrolase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Deoxyuridine triphosphatase (dUTPase) |