SAXSdb — 6h8q

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cohesin subunit SCC3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 2	Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 （Q12158） ;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAPA)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAPA)-3') ; × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 2	Sister chromatid cohesion protein 1 × 1 （Q12158） ;DNA (5'-D(PTPTPTPTPTPCPAPAPGPGPAPAPAPCPGPAPAPAPG)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAPA)-3') ; × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SCC3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1150； UniProt 1–1150 作者链 B； PDB构建体 1–1150； UniProt 1–1150

Sister chromatid cohesion protein 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12158

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 2	Cohesin subunit SCC3 × 1 （P40541） ;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAPA)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAPA)-3') ; × 1	与全部聚合物一致
2	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 2	Cohesin subunit SCC3 × 1 （P40541） ;DNA (5'-D(PTPTPTPTPTPCPAPAPGPGPAPAPAPCPGPAPAPAPG)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAPA)-3') ; × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SCC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–100； UniProt 301–400 作者链 H； PDB构建体 1–100； UniProt 301–400

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6h8q
沉积日期 deposition_date	2018-08-03
结构标题 title	Structural basis for Scc3-dependent cohesin recruitment to chromatin
关键词 keywords	Cohesin cell proliferation Scc3 DNA binding, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6h8q__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6h8q__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6h8q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.70 Å
Rg（电子密度）	39.27 Å
总 Rg	39.40 Å
原子数	8209
残基数	947
排除体积	145820 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6h8q__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6h8q__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cohesin subunit SCC3
分子量 formula_weight	133172.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	16363

MTAVRRSTRIRTKSQVIEEDYDDEQNTSAQHVESDKITAKTQHEEEEEQDTGESEESSSEDDYEDQDDDDYVDTATAKRKSRKRKPKSASNTSSKRQKKKPTSAQKSAVSHAPAYHRSKKDQDQYLEIAKDFQPTELFDILSTSEDVSIEELLREWLETYSENRDKFLQEFINLLLNCCGSVARVEDHDVHSNESSNETIGEIQLLFQRQKLHEFYLLISKENKKRKNFKMGPLYQNFAEFMTKLLEVANDLQLLYVESDEDDTQIVTGNLVLDLLTWLSSFSVCKIRCFRYISTLTLYLFQDYLTQQAVNLEKNYLAKLSKQLSLEEKKKRPNNKTLEKLESTIAETQGSKVVIDSIIDNIVKLCFVHRYKDVSDLIRSESMLHLSIWIKNYPEYFLKVTFLKYFGWLLSDNSVSVRLQVTKILPHLIIQNHNSKSTDNSAIRQVFERFKTKILEVAIRDVNLDVRIHSIQVLTEASSLGYLDDSEILIISSLMFDEEFDPFKTSSFNKRSKFLSTVAKFLARVIKEKFDEFIKTHEDLPKEVDGLEVGPVVQVGIFIKILNDSLIYHLKDCAEVDSRTKIRMLTQAAEFLSPYISTHLKTICNLLISDTESNELIQKLQNSANNNSDDEDVDDEELDITPLFPIDRNSTILYLNVFHGLCAGANNPKIQTKDSVKEIVLPLFYDLLNAASIESADILCPLLESFITFSLDDWISIGYETELKKITDKTIKAFMDSTIGNSKVDMKYDIFAKFIHHIHHFEKKELQEKFLNQIATLKIHLKKFLQEKMDPNNSRDDYKDLTCSLYELYINKLTILGRDYPIEVDEELLQLFLNNFVSRIPIMFQDFDDSTAQEINFKMLVLLATWNLEKWREIIEKVRDYENSISKDLRSVWKPIAAIIGRLNTLVISLAATNETFENINSLFYLKWSACTSLMDIIVAIKIFELKLPADATTWRYSMSEQFPFYLHDNASKVLLKIFLYLESLFAKQVDVQLERVADEDANLNDLPETGFFENIETEFLLFTVKLKGLMKLNILDERFASRVALNKEKLGPLFKKIVDDTIMENPEPNKKNIQKAKSNQTQREKAPLQPNSERETDHANTENNDPDIPMTIDLEPIEESSQNNSELAPIEEHPTVVDAIDNSDEITQD

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Sister chromatid cohesion protein 1
分子量 formula_weight	11583.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

TDAMTESQPKQTGTRRNSKLLNTKSIQIDEETENSESIASSNTYKEERSNNLLTPQPTNFTTKRLWSEITESMSYLPDPILKNFLSYESLKKRKIHNGRE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	5861.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	E

TTTTCAAGGAAACGAAACG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	5785.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	F

CGTTTCGTTTCCTTGAAAA

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PTPTPTPTPTPCPAPAPGPGPAPAPAPCPGPAPAPAP*G)-3') ;
分子量 formula_weight	5876.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C

TTTTTCAAGGAAACGAAAG

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(PCPTPTPTPCPGPTPTPTPCPCPTPTPGPAPAPAPAP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	5769.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

CTTTCGTTTCCTTGAAAAA

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晶胞边长 a length_a	296.240 Å
晶胞边长 b length_b	110.020 Å
晶胞边长 c length_c	115.160 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.631 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2854
R_work r_work	0.2835
R_free r_free	0.3185

Structural basis for Scc3-dependent cohesin recruitment to chromatin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cohesin subunit SCC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Sister chromatid cohesion protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6h8q__assembly_1__model_1

6h8q__assembly_1__model_1 | I(q)

6h8q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Structural basis for Scc3-dependent cohesin recruitment to chromatin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cohesin subunit SCC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Sister chromatid cohesion protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6h8q__assembly_1__model_1

6h8q__assembly_1__model_1 | I(q)

6h8q__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)