Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 1,2-ETHANEDIOL × 2 ;8-[[(1~{S},2~{R},3~{R},5~{R})-2-[2-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]ethyl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]amino]-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1~{H}-quinolin-2-one ; × 1 SULFATE ION × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | ATAD2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–130； UniProt 981–1108 |
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| 条目编号 entry_id | 6hdo |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-08-18 |
| 结构标题 title | Crystal structure of human ATAD2 bromodomain in complex with 8-(((1R,2R,3R,5S)-2-(2-(1,1-dioxidotetrahydro-2H-thiopyran-4-yl)ethyl)-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)quinolin-2(1H)-one |
| 关键词 keywords | INHIBITOR, ATAD2, BROMODOMAIN, EPIGENETICS, ATPase family AAA domain-containing protein 2, transcription; TRANSCRIPTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.36 Å |
| Rg（电子密度） | 16.24 Å |
| 总 Rg | 17.13 Å |
| 原子数 | 1133 |
| 残基数 | 130 |
| 排除体积 | 20086 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 6hdoA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 920 — Histone Acetyltransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bromodomain-like |