SAXSdb — 6he5

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha

Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Proteasome subunit beta × 7 （Q9P996） Proteasome-activating nucleotidase × 6 （O28303）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA_ARCFU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246 作者链 B； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246 作者链 C； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246 作者链 D； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246 作者链 E； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246 作者链 F； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246 作者链 G； PDB构建体 3–247； UniProt 2–246

Proteasome subunit beta

Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)

UniProt Q9P996

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Proteasome subunit alpha × 7 （O29760） Proteasome-activating nucleotidase × 6 （O28303）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSB_ARCFU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213 作者链 2； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213 作者链 3； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213 作者链 4； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213 作者链 5； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213 作者链 6； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213 作者链 7； PDB构建体 2–204； UniProt 11–213

Proteasome-activating nucleotidase

Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)

UniProt O28303

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Proteasome subunit alpha × 7 （O29760） Proteasome subunit beta × 7 （Q9P996）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAN_ARCFU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 5–401； UniProt 2–398 作者链 I； PDB构建体 5–401； UniProt 2–398 作者链 J； PDB构建体 5–401； UniProt 2–398 作者链 K； PDB构建体 5–401； UniProt 2–398 作者链 L； PDB构建体 5–401； UniProt 2–398 作者链 M； PDB构建体 5–401； UniProt 2–398

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6he5
沉积日期 deposition_date	2018-08-20
结构标题 title	20S core particle of PAN-proteasomes
关键词 keywords	PAN, Proteasome, AAA-ATPase, Archaea, hydrolase; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6he5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6he5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6he5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.70 Å
Rg（电子密度）	44.74 Å
总 Rg	45.21 Å
原子数	24633
残基数	3162
排除体积	442600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6he5__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha
分子量 formula_weight	27692.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
突变 mutation	0
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G
原子数 atom_count	24633

MGHLPQMGYDRAITVFSPDGRLFQVEYAREAVKRGATAIGIKCKEGVILIADKRVGSKLLEADTIEKIYKIDEHICAATSGLVADARVLIDRARIEAQINRLTYDEPITVKELAKKICDFKQQYTQYGGVRPFGVSLLIAGVDEVPKLYETDPSGALLEYKATAIGMGRNAVTEFFEKEYRDDLSFDDAMVLGLVAMGLSIESELVPENIEVGYVKVDDRTFKEVSPEELKPYVERANERIRELLKK

来源 Source

来源生物 organism	Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	224325
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta
分子量 formula_weight	23149.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,2,3,4,5,6,7

MGTTTVGLVCKDGVVMATEKRATMGNFIASKAAKKIYQIADRMAMTTAGSVGDAQFLARIIKIEANLYEIRRERKPTVRAIATLTSNLLNSYRYFPYLVQLLIGGIDSEGKSIYSIDPIGGAIEEKDIVATGSGSLTAYGVLEDRFTPEIGVDEAVELAVRAIYSAMKRDSASGDGIDVVKITEDEFYQYSPEEVEQILAKFRKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	224325
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Proteasome-activating nucleotidase
分子量 formula_weight	45279.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I,K,L,M,J

GHMGGDSEIQYLLEKLKKLEEDYYKLRELYRRLEDEKKFIESERIRYEREVRRLRSEVERLRSPPLLVGVVSDILEDGRVVVKSSTGPKFVVNTSQYINEEELKPGARVALNQQTLAIVNVLPTSKDPMVYGFEVEEKPEVSYEDIGGLDVQIEEIREAVELPLLKPELFAEVGIEPPKGVLLYGPPGTGKTLLAKAVANQTRATFIRVVGSEFVQKYIGEGARLVREVFQLAKEKAPSIIFIDELDAIAARRTNSDTSGDREVQRTMMQLLAELDGFDPRGDVKVIGATNRIDILDPAILRPGRFDRIIEVPLPTFEGRIQIFKIHTRKMKLAEDVDFKELARITEGASGADIKAICTEAGMFAIREERAKVTMLDFTKAIEKVLKKTTPIPDLKGVMFV

来源 Source

来源生物 organism	Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	224325
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.12 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	182989

20S core particle of PAN-proteasomes

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Proteasome subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Proteasome-activating nucleotidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6he5__assembly_1__model_1

6he5__assembly_1__model_1 | I(q)

6he5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

20S core particle of PAN-proteasomes

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome-activating nucleotidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6he5__assembly_1__model_1

6he5__assembly_1__model_1 | I(q)

6he5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)