SAXSdb — 6hlt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Golgi resident protein GCP60

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Genome polyprotein × 1 （P03303）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Genome polyprotein × 1 （P03303）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCP60_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–166； UniProt 364–528 作者链 C； PDB构建体 2–166； UniProt 364–528

Genome polyprotein

Human rhinovirus 14

UniProt P03303

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Golgi resident protein GCP60 × 1 （Q9H3P7）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Golgi resident protein GCP60 × 1 （Q9H3P7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_HRV14
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–59； UniProt 1430–1485 作者链 D； PDB构建体 4–59； UniProt 1430–1485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6hlt
沉积日期 deposition_date	2018-09-11
结构标题 title	Crystal structure of human ACBD3 GOLD domain in complex with 3A protein of rhinovirus-14 (HRV14)
关键词 keywords	complex, Golgi, enterovirus, picornavirus, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6hlt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6hlt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6hlt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.76 Å
Rg（电子密度）	15.63 Å
总 Rg	16.88 Å
原子数	1374
残基数	166
排除体积	24495 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6hlt__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6hlt__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Golgi resident protein GCP60
分子量 formula_weight	19261.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	2748

MESLPVIAAPSMWTRPQIKDFKEKIQQDADSVITVGRGEVVTVRVPTHEEGSYLFWEFATDNYDIGFGVYFEWTDSPNTAVSVHVSESSDDDEEEEENIGCEEKAKKNANKPLLDEIVPVYRRDCHEEVYAGSHQYPGRGVYLLKFDNSYSLWRSKSVYYRVYYTR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	6784.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

GAMGPVYKDLEIDVCNTPPPECINDLLKSVDSEEIREYCKKKKWIIPEIPTNIERAMNQ

来源 Source

来源生物 organism	Human rhinovirus 14
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12131
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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晶胞边长 a length_a	54.429 Å
晶胞边长 b length_b	78.955 Å
晶胞边长 c length_c	70.587 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.38 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.815 Å
最低分辨率 resolution_low	42.440 Å
R 因子 r_factor	0.2118
R_work r_work	0.2104
R_free r_free	0.2394

Crystal structure of human ACBD3 GOLD domain in complex with 3A protein of rhinovirus-14 (HRV14)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Golgi resident protein GCP60

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6hlt__assembly_1__model_1

6hlt__assembly_1__model_1 | I(q)

6hlt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of human ACBD3 GOLD domain in complex with 3A protein of rhinovirus-14 (HRV14)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Golgi resident protein GCP60

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6hlt__assembly_1__model_1

6hlt__assembly_1__model_1 | I(q)

6hlt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)