SAXSdb — 6j0a

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methionine aminopeptidase

Escherichia coli K-12

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Trigger factor × 1 （Q9WZF8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAP1_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264

Trigger factor

Thermotoga maritima MSB8

UniProt Q9WZF8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Methionine aminopeptidase × 1 （P0AE18）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIG_THEMA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6j0a
沉积日期 deposition_date	2018-12-22
结构标题 title	Crystal structure of E. coli methionine aminopeptidase enzyme and chaperone trigger factor fitted into the cryo-EM density map of the complex
关键词 keywords	E. coli 70S ribosome, Protein biogenesis, Chaperone, Methionine aminopeptidase, Trigger factor, Polypeptide exit tunnel, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6j0a__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6j0a__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6j0a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.45 Å
Rg（电子密度）	33.33 Å
总 Rg	33.46 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	94220 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6j0a__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Methionine aminopeptidase
分子量 formula_weight	29341.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.11.18
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P
原子数 atom_count	668

MAISIKTPEDIEKMRVAGRLAAEVLEMIEPYVKPGVSTGELDRICNDYIVNEQHAVSACLGYHGYPKSVCISINEVVCHGIPDDAKLLKDGDIVNIDVTVIKDGFHGDTSKMFIVGKPTIMGERLCRITQESLYLALRMVKPGINLREIGAAIQKFVEAEGFSVVREYCGHGIGQGFHEEPQVLHYDSRETNVVLKPGMTFTIEPMVNAGKKEIRTMKDGWTVKTKDRSLSAQYEHTIVVTDNGCEILTLRKDDTIPAIISHDE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Trigger factor
分子量 formula_weight	47961.5 kDa
EC 编号 ec_number	5.2.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MEVKELERDKNRVVLEYVFGAEEIAQAEDKAVRYLNQRVEIPGFRKGRIPKNVLKMKLGEEFQEYTLDFLMDLIPDTLKDRKLILSPIVTERELKDVTARVVVEVHEEPEVRIGDISKIEVEKVDEEKVLEKYVERRIEDLRESHALLEPKEGPAEAGDLVRVNMEVYNEEGKKLTSREYEYVISEDEDRPFVKDLVGKKKGDVVEIEREYEGKKYTYKLEVEEVYKRTLPEIGDELAKSVNNEFETLEQLKESLKKEGKEIYDVEMKESMREQLLEKLPEIVEIEISDRTLEILVNEAINRLKREGRYEQIVSSYESEEKFREELKERILDDIKRDRVIEVLAQEKGISVNDEELEKEAEELAPFWGISPDRAKSLVKARQDLREELRWAILKRKVLDLLLQEVE

来源 Source

来源生物 organism	Thermotoga maritima MSB8
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	243274
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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分辨率 resolution	14.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	19500

Crystal structure of E. coli methionine aminopeptidase enzyme and chaperone trigger factor fitted into the cryo-EM density map of the complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methionine aminopeptidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Trigger factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6j0a__assembly_1__model_1

6j0a__assembly_1__model_1 | I(q)

6j0a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of E. coli methionine aminopeptidase enzyme and chaperone trigger factor fitted into the cryo-EM density map of the complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methionine aminopeptidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Trigger factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6j0a__assembly_1__model_1

6j0a__assembly_1__model_1 | I(q)

6j0a__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)