SAXSdb — 6jfi

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

strutural protein M

Zika virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 600	ZIKV structural protein E × 180 FabZK2B10 heavy chain × 120 FabZK2B10 light chain × 120	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	ZIKV structural protein E × 3 FabZK2B10 heavy chain × 2 FabZK2B10 light chain × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	ZIKV structural protein E × 15 FabZK2B10 heavy chain × 10 FabZK2B10 light chain × 10	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	ZIKV structural protein E × 18 FabZK2B10 heavy chain × 12 FabZK2B10 light chain × 12	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	ZIKV structural protein E × 3 FabZK2B10 heavy chain × 2 FabZK2B10 light chain × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A024B7W1_ZIKV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–75； UniProt 216–290 作者链 D； PDB构建体 1–75； UniProt 216–290 作者链 F； PDB构建体 1–75； UniProt 216–290

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6jfi
沉积日期 deposition_date	2019-02-08
结构标题 title	The symmetric-reconstructed cryo-EM structure of Zika virus-FabZK2B10 complex
关键词 keywords	ZIKV, antibody, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6jfi__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6jfi__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6jfi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	227.70 Å
总 Rg	227.70 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	20780000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6jfi__assembly_1__model_1`	600-meric （600）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6jfi__assembly_2__model_1`	decameric （10）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`6jfi__assembly_3__model_1`	50-meric （50）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`6jfi__assembly_4__model_1`	60-meric （60）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`6jfi__assembly_5__model_1`	decameric （10）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ZIKV structural protein E
分子量 formula_weight	54186.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	2626

IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTA

来源 Source

来源生物 organism	Zika virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	64320
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	strutural protein M
分子量 formula_weight	8496.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.91,3.6.1.15,3.6.4.13,2.1.1.56,2.1.1.57,2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F

AVTLPSHSTRKLQTRSQTWLESREYTKHLIRVENWIFRNPGFALAAAAIAWLLGSSTSQKVIYLVMILLIAPAYS

来源 Source

来源生物 organism	Zika virus
通用名 common_name	ZIKV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	64320
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	FabZK2B10 heavy chain
分子量 formula_weight	25383.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,K

EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSGHTFPSYDINWVRQATGQGLEWMGWMNPNRGNTGYAQKFQGRVTMTRNTSINTAYMELSSLRSEDTAVYYCARVRSGTNYGSYYYYYYGMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	FabZK2B10 light chain
分子量 formula_weight	22782.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,L

SYELTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGNNYVHWYQQLPGSAPKLLIYRNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSGSLAISGLRSEDEADYYCASWDDSLSGHWVFGGGTKVTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	11.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	684

The symmetric-reconstructed cryo-EM structure of Zika virus-FabZK2B10 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

strutural protein M

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jfi__assembly_1__model_1

6jfi__assembly_1__model_1 | I(q)

6jfi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

The symmetric-reconstructed cryo-EM structure of Zika virus-FabZK2B10 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

strutural protein M

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jfi__assembly_1__model_1

6jfi__assembly_1__model_1 | I(q)

6jfi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)