SAXSdb — 6jlz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PHOSPHATE ION × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EI2BA_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341 作者链 B； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt Q9UT76

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PHOSPHATE ION × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EI2BB_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 7–399； UniProt 1–393 作者链 D； PDB构建体 7–399； UniProt 1–393

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt P56288

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PHOSPHATE ION × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EI2BG_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 F； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt Q09924

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PHOSPHATE ION × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EI2BD_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467 作者链 H； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt P56287

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha × 2 （P20459） PHOSPHATE ION × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EI2BE_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–678； UniProt 1–678 作者链 J； PDB构建体 1–678； UniProt 1–678

Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P20459

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 （Q9USP0） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 （Q9UT76） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 （P56288） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 （Q09924） Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 （P56287） PHOSPHATE ION × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IF2A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304 作者链 M； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6jlz
沉积日期 deposition_date	2019-03-07
结构标题 title	P-eIF2a - eIF2B complex
关键词 keywords	Translation Initiation, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6jlz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6jlz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6jlz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.99 Å
Rg（电子密度）	55.45 Å
总 Rg	55.57 Å
原子数	31826
残基数	4037
排除体积	569650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6jlz__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha
分子量 formula_weight	37817.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	31826

MVESDSSGIVRHSQGEFDIVQVYKKFLQDDPEITMPVAAIEALVQLLSRSQAKTISEFMDILQNGSNTLKEGVQNNISLSAGCDIFQRFVTRSLHDVGDFEQCKRHLVENGKLFIQRARACRQRIAHLGYPLIRDGSVILTHGFSRGVAAVLLAAAKRHVRFKVFVTESRPSGSGCLMTRTLKNACIPTCMVLDSAVSFTMNRVDLVLVGAEGVVENGGLINQIGTFQLAVFAKHAHKPFYAVAESHKFVRMFPLSQYDIPFSRPILEFDDPSPETVHPEPEPIPTPSDAIHNELIMNEEQIRNNPTLDVTPPEFVSGLITDLGIIDSKSGVSEELIKLYL

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta
分子量 formula_weight	43897.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

GPISEFMSTINVEHTYPAVSSLIADLKSRKVQGPFAVAVETALVMRQVISQTRWSTVDQLIDTVRAVGSTLVKAQPTEFSCGNIIRRILRLIREEYQELLKTADENEKLIVSSSNSSSPSQKRDIPSNEKLVQSHEPVSVQMYSSMLNLLGRPTLESPTHSKTVGDSRVTGGMDMRAVIISGIQDVIDELDKINTDIEVQSMDHLHSNEIILTQGCSKTVEAFLRFAAKKRKFSVIVAEGFPNNQKGSHAMAKRLAQAGIDTTVISDATIFAIMSRVNKVILGTHAILGNGGLVTYSGAQLVAQAARHHATPVVVCSGIYKLSPVYPYDLESIIQLSSPDKIMSFNEGDLISRAEILNPYYDYIPPDLVDLFITNLGGYPPSYLYRIMNDTYDASDTIL

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma
分子量 formula_weight	50551.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MSLYEHAALPLASSPSILGPISGGRNRGNIQLQSIPIEFQAVVFAGFGNSLYPLTGSDALPKALLPIGNKPMLHYPLYWLEAAGFTSAILICMEEAEAHINAWLRSGYEGHMRIHVEAPTILDDSKSSADALRAVSHLIKNDFVCLSCDSIVGLPPYTVLDKFRLDNPSALAVYSPVLKYEHITSQSKEIDAKQLIGIEEKTSRLLYAKSSADVGSDFTFRMSLLWKHPRVTLNTNLSDAHIFVFKHWVIDLIREKESISSIRGDLIPYLVKCQYQKSFTVRENIQRFLSSPNNIDNYDGGLSSQEIKINALIAKDGIICSRANNLPNYFELNKCIAKLTPEQRLVDVTVSERALVGADCMVNEGTTIKDNSNIKKSIIGKNCVIGKGVVVSNSILMDNIVVEDGVRLESCIVASGAQIGAKSKLRECEIGVDHRVEAGRIARGERLVDMEKIETDMD

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta
分子量 formula_weight	51652.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

MGFSAEQAKKDGKDQSPVSESSSVGGTSPATASSVVSPNEPKLSGKEAKALKKARKQASRRAKAEAAAANNPPGVSEEKKVAIPNKNSNQQKKASKQNPQNSPETDANLQEKKIFEEKQVSIFSHLDWRRRRTTENIPKDIHPAVIRLGLKLANYKIFGSNQRCIDLLKTFKIVIQDYQTPYGTTLSRHLTTHINSQIAYLVSTRPLSISMGNAIRFLKLEISVLDIDLTDDEGKELLLEKIDSYIRDRIIIAGQVIVQAATEKIQDGDVILTYLHSSTVNDVLIHAKNVGKKFRVVVVDSRPEFEGRVCLKLLTEHGIECTYVMISALSYIMQEVTKIFLGGHAMLSNGALYSRAGTSLISLLGHESNVPVIACCESYKFTERIQLDSLVYNELAPGDQLVNMGVDDFEEKPGVLANWKSVKNLKLLSLKYDVTPPRLITVCVCEMGLLPSTSVPAIINEFKQVYA

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon
分子量 formula_weight	76413.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J

MPPSKGLNGKLEKPKHALQAIVLSDSYNYRFRPLTLDKPRCLLPLANTPLIEYTFEFLALAGVQEVYVFCCAHAGQIREYIEKSKWNLPSSPFSVNTIVSRESLSVGDALRELDSKQLITSDFILVSGDVVSNVPLNEVLKEHRKRREDDKNAIMTMVVREASPFHRTRARTESSVFVIDKKTSQCVHYQANERGKHYVSMDPEIFNEHEELEVRNDLIDCQIDICSNDVPALFTENFDYQDIRKDFVYGVLTSDLLGKKIHCHVAKENYAARVRSLQTYDAISKDVLSRWVYPFVPDSNLLNQTFSYQRHQIYKEEDVVLARSCIIKARTLIGAYTKVGDASVVANTIIGRNCTIGSNCSIDSAFLWEDVVIGDNCRIGKAILANSVKIGNNCSIEDGAIVAAGVVIGDNTIIEKNKRLTTFESHSQGTLNDPSLVGIGGRGQEYHAEEDSDDEGEFMEASGLIESTNELHLSDSESSETSSSSEEDMEFIPFSARRDSANTINSEDFDEGDFNKEAQQSLERAFEENHQIDIAALELNTLRMAMNANYHEVRSAIVLALLRRIMHLDVSPKEALAKVMTRWGPLLAKLTFSHEEQVDNVLTLQKYCVRLSMTRHFLQLLGYFYQLEIAEENAIQEWYSDPRSSEGELAALRDAGGKQFVDWLNTAESESESEEGSE

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha
分子量 formula_weight	34843.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

MSTSHCRFYENKYPEIDDIVMVNVQQIAEMGAYVKLLEYDNIEGMILLSELSRRRIRSIQKLIRVGKNDVAVVLRVDKEKGYIDLSKRRVSSEDIIKCEEKYQKSKTVHSILRYCAEKFQIPLEELYKTIAWPLSRKFGHAYEAFKLSIIDETVWEGIEPPSKDVLDELKNYISKRLTPQAVKIRADVEVSCFSYEGIDAIKDALKSAEDMSTEQMQVKVKLVAAPLYVLTTQALDKQKGIEQLESAIEKITEVITKYGGVCNITMPPKAVTATEDAELQALLESKELDNRSDSEDDEDESDDE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6jlzA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1070 — Translation initiation factor eIF-2B, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6jlzA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10470 — Translation initiation factor eif-2b; domain 2

结构域编号 domain_id	6jlzB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1070 — Translation initiation factor eIF-2B, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	6jlzB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10470 — Translation initiation factor eif-2b; domain 2

结构域编号 domain_id	6jlzL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6jlzL02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — Translation initiation factor 2; subunit 1; domain 2

结构域编号 domain_id	6jlzM01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6jlzM02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — Translation initiation factor 2; subunit 1; domain 2

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晶胞边长 a length_a	155.578 Å
晶胞边长 b length_b	207.712 Å
晶胞边长 c length_c	155.744 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	96.96 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.350 Å
最低分辨率 resolution_low	49.313 Å
R 因子 r_factor	0.2211
R_work r_work	0.2206
R_free r_free	0.2526

P-eIF2a - eIF2B complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit gamma

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit delta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jlz__assembly_1__model_1

6jlz__assembly_1__model_1 | I(q)

6jlz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer