6k61

Cryo-EM structure of the tetrameric photosystem I from a heterocyst-forming cyanobacterium Anabaena sp. PCC7120

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAA_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–752； UniProt 1–752 作者链 a； PDB构建体 1–752； UniProt 1–752

Photosystem I 4.8 kDa protein

物种未注明

UniProt P58566

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAX_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–44； UniProt 1–44 作者链 x； PDB构建体 1–44； UniProt 1–44

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1

物种未注明

UniProt P58565

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAB1_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–741； UniProt 1–741 作者链 b； PDB构建体 1–741； UniProt 1–741

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt P0A410

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81 作者链 c； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II

物种未注明

UniProt P58573

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAD_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 d； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Photosystem I reaction center subunit IV

物种未注明

UniProt P58575

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAE_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70 作者链 e； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

Photosystem I reaction center subunit III

物种未注明

UniProt P58564

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAF_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164 作者链 f； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt P58568

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAJ_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–49； UniProt 1–49 作者链 j； PDB构建体 1–49； UniProt 1–49

Photosystem I reaction center subunit PsaK 1

物种未注明

UniProt P58583

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAK1_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86 作者链 k； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt P58560

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAI_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46 作者链 i； PDB构建体 1–46； UniProt 1–46

Photosystem I reaction center subunit XI

物种未注明

UniProt P58577

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XII × 2 （Q8YNB0） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAL_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 l； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

Photosystem I reaction center subunit XII

物种未注明

UniProt Q8YNB0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 2 （P58576） Photosystem I 4.8 kDa protein × 2 （P58566） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1 × 2 （P58565） Photosystem I iron-sulfur center × 2 （P0A410） Photosystem I reaction center subunit II × 2 （P58573） Photosystem I reaction center subunit IV × 2 （P58575） Photosystem I reaction center subunit III × 2 （P58564） Photosystem I reaction center subunit IX × 2 （P58568） Photosystem I reaction center subunit PsaK 1 × 2 （P58583） Photosystem I reaction center subunit VIII × 2 （P58560） Photosystem I reaction center subunit XI × 2 （P58577） CHLOROPHYLL A ISOMER × 2 CHLOROPHYLL A × 188 PHYLLOQUINONE × 4 IRON/SULFUR CLUSTER × 6 BETA-CAROTENE × 46 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 6 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 4 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAM_NOSS1
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32 作者链 m； PDB构建体 1–32； UniProt 1–32

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6k61
沉积日期 deposition_date	2019-05-31
结构标题 title	Cryo-EM structure of the tetrameric photosystem I from a heterocyst-forming cyanobacterium Anabaena sp. PCC7120
关键词 keywords	Photosystem I, PSI, PCC7120, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6k61__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6k61__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6k61__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	63.78 Å
Rg（电子密度）	63.69 Å
总 Rg	63.66 Å
原子数	49283
残基数	4542
排除体积	922010 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6k61__assembly_1__model_1`	24-meric （24）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83289.7 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	49283

MTISPPEREEKKARVIVDKDPVPTSFEKWAQPGHFDRTLARGPKTTTWIWNLHALAHDFDTHTSDLEDISRKIFAAHFGHLAVVTIWLSGMIFHGAKFSNYEAWLSDPLNVRPSAQVVWPIVGQDILNGDVGGGFHGIQITSGLFQVWRGWGITNSFQLYCTAIGGLVLAGLFLFAGWFHYHKRAPKLEWFQNVESMLNHHLQVLLGCGSLGWAGHLIHVSAPINKLMDAGVAVKDIPLPHEFILNKSLLIDLFPGFAAGLTPFFTLNWGQYADFLTFKGGLNPVTGGLWMTDIAHHHLAIAVVFIIAGHQYRTNWGIGHSIKEILENHKGPFTGEGHKGLYENLTTSWHAQLATNLAFLGSLTIIIAHHMYAMPPYPYLATDYATQLCIFTHHIWIGGFLIVGGAAHAAIFMVRDYDPVVNQNNVLDRVIRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYIHNDTMRALGRPQDMFSDTAIQLQPVFAQWVQNLHTLAPGGTAPNALEPVSYAFGGGVLAVGGKVAMMPIALGTADFLIHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSGWDHVFLGLFWMYNSLSIVIFHFSWKMQSDVWGTVDAAGNVSHITGGNFAQSAITINGWLRDFLWAQASQVINSYGSALSAYGLMFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPAIQPRALSITQGRAVGVAHYLLGGIATTWAFFHAHILSVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I 4.8 kDa protein
分子量 formula_weight	4872.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

MAKAKISPVANTGAKPPYTFRTGWALLLLAVNFLVAAYYFHIIQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1
分子量 formula_weight	83457.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

MATKFPKFSQDLAQDPTTRRIWYAMAMGNDFESHDGMTEENLYQKIFATHFGHLAIIFLWASSLLFHVAWQGNFEQWIKDPLHVRPIAHAIWDPHFGKPAIEAFTQAGANGPVNIAYSGVYHWWYTIGMRTNTELYTGSVFLLLFASLFLFAGWLHLQPKFRPSLAWFKSAESRLNHHLAGLFGVSSLAWAGHLIHVAIPESRGQHVGWDNFLSTAPHPAGLQPFFTGNWGVYAQNPDTAGHIFSTSQGAGTAILTFLGGFHPQTESLWLTDMAHHHLAIAVLFIVAGHMYRTNFGIGHSIKEMMNAKTFFGKPVEGPFNMPHQGIYDTYNNSLHFQLGWHLACLGVVTSWVAQHMYSLPSYAFIAKDYTTQAALYTHHQYIAIFLMVGAFAHGAIFLVRDYDPEQNKGNVLERVLQHKEAIISHLSWVSLFLGFHTLGLYVHNDVVVAFGTPEKQILIEPVFAQFIQAAHGKVLYGLDTLLSNPDSVAYTAYPNYANVWLPGWLDAINSGTNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYAFPCDGPGRGGTCDISAWDSFYLSLFWALNTVGWVTFYWHWKHLGIWQGNVAQFNENSTYLMGWFRDYLWANSAQLINGYNPYGVNNLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPIANLVRWKDKPVALSIVQARVVGLAHFTVGYVLTYAAFLIASTAGKFG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8825.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

MSHTVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMVPWDGCKAAQVASSPRTEDCVGCKRCETACPTDFLSIRVYLGAETTRSMGLAY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	15176.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

MAETLSGKTPLFAGSTGGLLTKAVEEEKYAITWTSPKAQVFELPTGGAATMHEGENLLYIARKEYGIALGGQLRKFKITNYKIYRILPSGETTFIHPADGVFPEKVNAGREKVRFNARSIGENPNPSQVKFSGKATYDA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	7897.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MVQRGSKVRILRPESYWFQDVGTVASVDQSGIKYPVIVRFDKVNYAGINTNNFAVDELIEVEAPKAKAKK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	17850.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MRRLFALILVICLSFSFAPPAKALGADLTPCAENPAFQALAKNARNTTADPQSGQKRFERYSQALCGPEGYPHLIVDGRLDRAGDFLIPSILFLYIAGWIGWVGRAYLQAIKKDSDTEQKEIQLDLGIALPIIATGFAWPAAAVKELLSGELTAKDSEITVSPR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	5499.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,j

MADKADQSSYLIKFISTAPVAATIWLTITAGILIEFNRFFPDLLFHPLP

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit PsaK 1
分子量 formula_weight	8852.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

MLTSTLLAAATTPLEWSPTVGIIMVIANVIAITFGRQTIKYPSAEPALPSAKFFGGFGAPALLATTAFGHILGVGLVLGLHNLGRI

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	5066.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MATAFLPSILADASFLSSIFVPVIGWVVPIATFSFLFLYIEREDVA

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	18130.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MAQAVDASKNLPSDPRNREVVFPAGRDPQWGNLETPVNASPLVKWFINNLPAYRPGLTPFRRGLEVGMAHGYFLFGPFAKLGPLRDAANANLAGLLGAIGLVVLFTLALSLYANSNPPTALASVTVPNPPDAFQSKEGWNNFASAFLIGGIGGAVVAYFLTSNLALIQGLVG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3538.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

MSSISDTQVYIALVVALIPGLLAWRLATELYK

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A ISOMER
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	188

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	46

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

SCOP 2.08 (9 domains)

结构域编号 domain_id	d6k61a_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6k61b_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.29 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
超家族 Superfamily superfamily	f.29.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB
家族 Family family	f.29.1.1 — Photosystem I subunits PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	d6k61c_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.1 — 4Fe-4S ferredoxins
家族 Family family	d.58.1.2 — 7-Fe ferredoxin

结构域编号 domain_id	d6k61d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.187 — Photosystem I subunit PsaD
超家族 Superfamily superfamily	d.187.1 — Photosystem I subunit PsaD
家族 Family family	d.187.1.1 — Photosystem I subunit PsaD

结构域编号 domain_id	d6k61e_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamily	b.34.4 — Electron transport accessory proteins
家族 Family family	b.34.4.2 — Photosystem I accessory protein E (PsaE)

结构域编号 domain_id	d6k61f_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.16 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF
家族 Family family	f.23.16.1 — Subunit III of photosystem I reaction centre, PsaF

结构域编号 domain_id	d6k61j_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.18 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ
家族 Family family	f.23.18.1 — Subunit IX of photosystem I reaction centre, PsaJ

结构域编号 domain_id	d6k61l_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.31 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
超家族 Superfamily superfamily	f.31.1 — Photosystem I reaction center subunit XI, PsaL
家族 Family family	f.31.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6k61m_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.23 — Single transmembrane helix
超家族 Superfamily superfamily	f.23.19 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM
家族 Family family	f.23.19.1 — Subunit XII of photosystem I reaction centre, PsaM

CATH v4.4 (14 domains)

结构域编号 domain_id	6k61A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	6k61B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	6k61C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6k61D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1470 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Ii; Chain: D;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaD, reaction center subunit II

结构域编号 domain_id	6k61E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	6k61F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Photosystem I, reaction centre, subunit PsaF

结构域编号 domain_id	6k61J00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	510 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	6k61a00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	6k61b00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	6k61c00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6k61d00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1470 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Ii; Chain: D;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaD, reaction center subunit II

结构域编号 domain_id	6k61e00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	6k61f00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Photosystem I, reaction centre, subunit PsaF

结构域编号 domain_id	6k61j00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	510 — Single helix bin

▶

分辨率 resolution	2.37 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	71600

Cryo-EM structure of the tetrameric photosystem I from a heterocyst-forming cyanobacterium Anabaena sp. PCC7120

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I 4.8 kDa protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit PsaK 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体