6kh8

Solution structure of Zn free Bovine Pancreatic Insulin in 20% acetic acid-d4 (pH 1.9)

Method: SOLUTION NMR Dmax: 38.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin A Chain

物种未注明

UniProt P01317

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 85–105 链 B; UniProt 25–54 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 1.9;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20% ACETIC ACID;压力 1 NMR样品组成:350 uM Bovine insulin Chain A, 350 uM Bovine Insulin chain B, 20% acetic acid-D4 | 20% acetic acid-D4 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 39 个其他 PDB 条目、86 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INS_BOVIN
Isoform
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–21; UniProt 85–105 作者链 B; PDB构建体 1–30; UniProt 25–54

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6kh8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6kh8
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6kh8
沉积日期 deposition_date2019-07-14
结构标题 titleSolution structure of Zn free Bovine Pancreatic Insulin in 20% acetic acid-d4 (pH 1.9)
关键词 keywordsInsulin, Fibrillation, Amyloid, HORMONE; HORMONE
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier10.83
回转半径 Rg (电子) rg_electron10.67
零角强度 I(0) i049804900.00
分子量 molecular_weight57376.0 kDa
排除体积 excluded_volume71109 ų
包络体积 envelope_volume10844 ų
水化壳体积 shell_volume8361 ų
包络直径 envelope_diameter41.2
壳层 Rg shell_rg16.77
包络 Rg envelope_rg11.96
形状 Rg shape_rg10.68
总 Rg total_rg10.91
总原子数 total_atoms7750
残基数 n_residues510
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax38.1
Rg (实空间) rg_real10.80
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36
I(0) (实空间) i0_real4.9800e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.2260e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal10.81
I(0) (倒空间) i0_reciprocal49800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8721
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary13.0
偏度 Skewness skewness0.178
峰度 Kurtosis kurtosis-0.369
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha29970.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.807; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.949; Smooth: 0.964

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)