6kmv

caspase-11 C254A P22/P10 in complex with mouse GSDMD-C domain

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Caspase-4

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
13	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
14	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
15	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
16	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gasdermin-D × 1 （Q9D8T2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CASP4_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1, 2, 5, 7, 8, 10, 11, 14, 15
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–161； UniProt 118–278 作者链 B； PDB构建体 1–167； UniProt 101–267 作者链 V； PDB构建体 1–167； UniProt 101–267 作者链 E； PDB构建体 1–166； UniProt 101–266 作者链 F； PDB构建体 1–166； UniProt 101–266 作者链 Z； PDB构建体 1–166； UniProt 101–266 作者链 d； PDB构建体 1–166； UniProt 101–266 作者链 I； PDB构建体 1–165； UniProt 102–266 作者链 M； PDB构建体 1–165； UniProt 102–266 作者链 N； PDB构建体 1–165； UniProt 102–266 作者链 Q； PDB构建体 1–165； UniProt 102–266 作者链 Y； PDB构建体 1–165； UniProt 102–266 作者链 J； PDB构建体 1–149； UniProt 118–266 作者链 R； PDB构建体 1–150； UniProt 118–267 作者链 c； PDB构建体 1–150； UniProt 118–267 作者链 U； PDB构建体 1–165； UniProt 101–265 作者链 g； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 h； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 i； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 j； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 k； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 l； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 m； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 n； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 o； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 p； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 q； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 r； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 t； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 u； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 v； PDB构建体 1–88； UniProt 286–373 作者链 s； PDB构建体 1–87； UniProt 287–373

Gasdermin-D

Mus musculus

UniProt Q9D8T2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
11	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
12	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
13	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
14	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
15	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
16	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Caspase-4 × 1 （P70343） Caspase-4 × 1 （P70343）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GSDMD_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3, 4, 6, 9, 12, 13
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–198； UniProt 287–484 作者链 G； PDB构建体 1–198； UniProt 287–484 作者链 O； PDB构建体 1–198； UniProt 287–484 作者链 D； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 K； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 S； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 T； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 W； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 b； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 f； PDB构建体 1–197； UniProt 288–484 作者链 H； PDB构建体 1–191； UniProt 294–484 作者链 L； PDB构建体 1–214； UniProt 271–484 作者链 P； PDB构建体 1–214； UniProt 271–484 作者链 e； PDB构建体 1–214； UniProt 271–484 作者链 X； PDB构建体 1–199； UniProt 286–484 作者链 a； PDB构建体 1–196； UniProt 289–484

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6kmv
沉积日期 deposition_date	2019-08-01
结构标题 title	caspase-11 C254A P22/P10 in complex with mouse GSDMD-C domain
关键词 keywords	pyroptosis, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6kmv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6kmv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6kmv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.49 Å
Rg（电子密度）	30.04 Å
总 Rg	30.57 Å
原子数	3490
残基数	447
排除体积	62445 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6kmv__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6kmv__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`6kmv__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`6kmv__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`6kmv__assembly_5__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`6kmv__assembly_6__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`6kmv__assembly_7__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`6kmv__assembly_8__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`6kmv__assembly_9__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`6kmv__assembly_10__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`6kmv__assembly_11__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`6kmv__assembly_12__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
13	1	`6kmv__assembly_13__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
14	1	`6kmv__assembly_14__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
15	1	`6kmv__assembly_15__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
16	1	`6kmv__assembly_16__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	18030.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	56064

TQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIRESSKPQLCRGVDL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	18870.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,V

TLKLCSPEEFTRLCREKTQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIRES

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Gasdermin-D
分子量 formula_weight	21497.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,G,O

ADFQGLYAEVKACSSELESLEMELRQQILVNIGKILQDQPSMEALEASLGQGLCSGGQVEPLDGPAGCILECLVLDSGELVPELAAPIFYLLGALAVLSETQQQLLAKALETTVLSKQLELVKHVLEQSTPWQEQSSVSLPTVLLGDCWDEKNPTWVLLEECGLRLQVESPQVHWEPTSLIPTSALYASLFLLSSLGQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Gasdermin-D
分子量 formula_weight	21426.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,K,S,T,W,b,f

DFQGLYAEVKACSSELESLEMELRQQILVNIGKILQDQPSMEALEASLGQGLCSGGQVEPLDGPAGCILECLVLDSGELVPELAAPIFYLLGALAVLSETQQQLLAKALETTVLSKQLELVKHVLEQSTPWQEQSSVSLPTVLLGDCWDEKNPTWVLLEECGLRLQVESPQVHWEPTSLIPTSALYASLFLLSSLGQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	18783.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,Z,d

TLKLCSPEEFTRLCREKTQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIRE

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Gasdermin-D
分子量 formula_weight	20702.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

AEVKACSSELESLEMELRQQILVNIGKILQDQPSMEALEASLGQGLCSGGQVEPLDGPAGCILECLVLDSGELVPELAAPIFYLLGALAVLSETQQQLLAKALETTVLSKQLELVKHVLEQSTPWQEQSSVSLPTVLLGDCWDEKNPTWVLLEECGLRLQVESPQVHWEPTSLIPTSALYASLFLLSSLGQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	18682.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,M,N,Q,Y

LKLCSPEEFTRLCREKTQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIRE

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	16744.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

TQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIRE

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Gasdermin-D
分子量 formula_weight	23225.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,P,e

LSLLSDGIDEEELIEAADFQGLYAEVKACSSELESLEMELRQQILVNIGKILQDQPSMEALEASLGQGLCSGGQVEPLDGPAGCILECLVLDSGELVPELAAPIFYLLGALAVLSETQQQLLAKALETTVLSKQLELVKHVLEQSTPWQEQSSVSLPTVLLGDCWDEKNPTWVLLEECGLRLQVESPQVHWEPTSLIPTSALYASLFLLSSLGQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	16831.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,c

TQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIRES

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	18654.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
突变 mutation	C254A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

TLKLCSPEEFTRLCREKTQEIYPIKEANGRTRKALIICNTEFKHLSLRYGANFDIIGMKGLLEDLGYDVVVKEELTAEGMESEMKDFAALSEHQTSDSTFLVLMSHGTLHGICGTMHSEKTPDVLQYDTIYQIFNNCHCPGLRDKPKVIIVQAARGGNSGEMWIR

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Gasdermin-D
分子量 formula_weight	21568.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

AADFQGLYAEVKACSSELESLEMELRQQILVNIGKILQDQPSMEALEASLGQGLCSGGQVEPLDGPAGCILECLVLDSGELVPELAAPIFYLLGALAVLSETQQQLLAKALETTVLSKQLELVKHVLEQSTPWQEQSSVSLPTVLLGDCWDEKNPTWVLLEECGLRLQVESPQVHWEPTSLIPTSALYASLFLLSSLGQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Gasdermin-D
分子量 formula_weight	21311.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

FQGLYAEVKACSSELESLEMELRQQILVNIGKILQDQPSMEALEASLGQGLCSGGQVEPLDGPAGCILECLVLDSGELVPELAAPIFYLLGALAVLSETQQQLLAKALETTVLSKQLELVKHVLEQSTPWQEQSSVSLPTVLLGDCWDEKNPTWVLLEECGLRLQVESPQVHWEPTSLIPTSALYASLFLLSSLGQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	10283.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	15

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,t,u,v

AVKLSHVEKDFIAFYSTTPHHLSYRDKTGGSYFITRLISCFRKHACSCHLFDIFLKVQQSFEKASIHSQMPTIDRATLTRYFYLFPGN

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Caspase-4
分子量 formula_weight	10212.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.64
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s

VKLSHVEKDFIAFYSTTPHHLSYRDKTGGSYFITRLISCFRKHACSCHLFDIFLKVQQSFEKASIHSQMPTIDRATLTRYFYLFPGN

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 31 domains

CATH v4.4 (31 domains)

结构域编号 domain_id	6kmvA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvM01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvU01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvV01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvY01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvZ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvc01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvd01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1460 —

结构域编号 domain_id	6kmvg00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvh00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvi00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvj00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvk00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvl00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvm00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvn00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvo00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvp00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvq00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvr00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvs00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvt00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvu00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

结构域编号 domain_id	6kmvv00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1470 — Caspase-like

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晶胞边长 a length_a	89.798 Å
晶胞边长 b length_b	139.207 Å
晶胞边长 c length_c	175.942 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	92.43 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.06 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	96.35 °
晶胞分子数 Z z_pdb	15

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.350 Å
最低分辨率 resolution_low	37.442 Å
R 因子 r_factor	0.2194
R_work r_work	0.2188
R_free r_free	0.2520

caspase-11 C254A P22/P10 in complex with mouse GSDMD-C domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Caspase-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gasdermin-D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6kmv__assembly_1__model_1

6kmv__assembly_1__model_1 | I(q)

6kmv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 12 Entity 12 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 13 Entity 13 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 14 Entity 14 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 15 Entity 15 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 31 domains

CATH v4.4 (31 domains)

7. 引用文献 (1)