SAXSdb — 6lo8

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54 × 1 （P47045） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial × 1 （P33421） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18 × 1 （Q08749） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 × 3 （O74700） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12 × 1 （P32830） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 × 2 （P87108）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM22_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54

物种未注明

UniProt P47045

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 × 1 （Q12328） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial × 1 （P33421） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18 × 1 （Q08749） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 × 3 （O74700） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12 × 1 （P32830） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 × 2 （P87108）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TIM54_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–478； UniProt 1–478

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial

物种未注明

UniProt P33421

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 × 1 （Q12328） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54 × 1 （P47045） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18 × 1 （Q08749） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 × 3 （O74700） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12 × 1 （P32830） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 × 2 （P87108）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SDH3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18

物种未注明

UniProt Q08749

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 × 1 （Q12328） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54 × 1 （P47045） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial × 1 （P33421） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 × 3 （O74700） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12 × 1 （P32830） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 × 2 （P87108）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TIM18_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–192； UniProt 1–192

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9

物种未注明

UniProt O74700

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 × 1 （Q12328） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54 × 1 （P47045） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial × 1 （P33421） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18 × 1 （Q08749） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12 × 1 （P32830） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 × 2 （P87108）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TIM9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87 作者链 G； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87 作者链 I； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12

物种未注明

UniProt P32830

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 × 1 （Q12328） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54 × 1 （P47045） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial × 1 （P33421） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18 × 1 （Q08749） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 × 3 （O74700） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 × 2 （P87108）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TIM12_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10

物种未注明

UniProt P87108

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 × 1 （Q12328） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54 × 1 （P47045） Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial × 1 （P33421） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18 × 1 （Q08749） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 × 3 （O74700） Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12 × 1 （P32830）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIM10_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–93； UniProt 1–93 作者链 J； PDB构建体 1–93； UniProt 1–93

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6lo8
沉积日期 deposition_date	2020-01-04
结构标题 title	Cryo-EM structure of the TIM22 complex from yeast
关键词 keywords	mitochondrial import, Tim22, protein translocation, membrane protein insertion, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6lo8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6lo8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6lo8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.20 Å
Rg（电子密度）	36.31 Å
总 Rg	36.68 Å
原子数	7972
残基数	997
排除体积	142560 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6lo8__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22
分子量 formula_weight	21751.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7972

MVYTGFGLEQISPAQKKPYNELTPEEQGERGAEMIMNFMTSCPGKSVVSGVTGFALGGVLGLFMASMAYDTPLHTPTPANTAATATAGNIGVGGISRTVQQISDLPFRQQMKLQFTDMGKKSYSSAKNFGYIGMIYAGVECVIESLRAKNDIYNGVTAGFFTGAGLAYKAGPQAALMGGAGFAAFSAAIDLYMKSEDGRPPQNDFK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54
分子量 formula_weight	54252.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSSESGKPIAKPIRKPGYTNPALKALGIPALRLPSRNWMIFWSVLTVSIGGIAYDKYKQRQILSHATDLVKPLAEESMEVDKVPRKITVFIAPPPNDYLESSLKVWRRYVKPVLYYAGLDYELVQEDRQGIIRTNVANRIRELRKEILASTDGQPVKEPNQTVAKPSGSSTSKISSLLPFNKIIQDPAEEDDSFDPEIGKKFKENFDWRNVIGIFYTMPKPKHIISEDALTKDPILSGGVICLGRGAYKEYIAGIHEGLLGPIEKTEKTGSTEPKMTGVVEANQIESKVSESGATELVDAEKETALEEAKVQDDLKVDEENSSEDSQKFLKPFISSDQYPDLQIASELQTPNGEFIRNPNTNIPLLINQPLLVIPIPNLIGFTTIPRRIHRFYQKRFYVEDVCSSVVNCVRQTRIRPFDIAKDIDLAKDEEKDWPQNWVKQGKEKNSEWTQELVCDPRITKHMFVYEKPPKEEPESDI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	22095.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSAMMVKLGLNKSALLLKPSAFSRAAALSSSRRLLFNTARTNFLSTSPLKNVASEMNTKAAIAEEQILNKQRAKRPISPHLTIYQPQLTWYLSSLHRISLVLMGLGFYLFTILFGVSGLLGLGLTTEKVSNWYHQKFSKITEWSIKGSFAYLFAIHYGGAIRHLIWDTAKELTLKGVYRTGYALIGFTAVLGTYLLTL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18
分子量 formula_weight	21994.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MLLFPGLKPVLNASTVIVNPVRAVFPGLVLSTKRSFYSINRLNAENKINDIANTSKEASSSVQMFKPPEFSQFKDSYQKDYERIAKYTLIPLTMVPFYASFTGGVINPLLDASLSSIFLIYLQYGFTSCIIDYIPKEKYPRWHKLALYCLYGGSMLSLYGIYELETKNNGFVDLVKKLWNENDDHLYIFGRN

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9
分子量 formula_weight	10216.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,G,I

MDALNSKEQQEFQKVVEQKQMKDFMRLYSNLVERCFTDCVNDFTTSKLTNKEQTCIMKCSEKFLKHSERVGQRFQEQNAALGQGLGR

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12
分子量 formula_weight	12300.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSFFLNSLRGNQEVSQEKLDVAGVQFDAMCSTFNNILSTCLEKCIPHEGFGEPDLTKGEQCCIDRCVAKMHYSNRLIGGFVQTRGFGPENQLRHYSRFVAKEIADDSKK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10
分子量 formula_weight	10313.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,J

MSFLGFGGGQPQLSSQQKIQAAEAELDLVTDMFNKLVNNCYKKCINTSYSEGELNKNESSCLDRCVAKYFETNVQVGENMQKMGQSFNAAGKF

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6lo8E01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 — Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains

结构域编号 domain_id	6lo8F01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 — Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains

结构域编号 domain_id	6lo8G01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 — Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains

结构域编号 domain_id	6lo8I01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	810 — Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.83 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	251984

Cryo-EM structure of the TIM22 complex from yeast

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM54

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b subunit, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6lo8__assembly_1__model_1

6lo8__assembly_1__model_1 | I(q)

6lo8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer