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6lwg

Crystal structure of human NEIL1(P2G, E3Q, R242) bound to duplex DNA containing guanidinohydantoin (Gh)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endonuclease 8-like 1

Homo sapiens

UniProt Q96FI4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*TP*CP*CP*AP*(DGH)P*GP*TP*CP*TP*AP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*AP*GP*AP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*CP*GP*G)-3') ; × 1 GLYCEROL × 1 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*TP*CP*CP*AP*(DGH)P*GP*TP*CP*TP*AP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*AP*GP*AP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*CP*GP*G)-3') ; × 1 GLYCEROL × 2 water × 3 与全部聚合物一致
3 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*CP*GP*TP*CP*CP*AP*(DGH)P*GP*TP*CP*TP*AP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*TP*AP*GP*AP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*CP*GP*G)-3') ; × 1 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1tdh 4nrv 5itq

共 3 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
5itr 5itr 5itr 5itt 5itt 5itt 5itu 5itu 5itu 5itx 5itx 5itx

共 65 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NEIL1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295 作者链 D； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295 作者链 G； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6lwg
沉积日期 deposition_date2020-02-07
结构标题 titleCrystal structure of human NEIL1(P2G, E3Q, R242) bound to duplex DNA containing guanidinohydantoin (Gh)
关键词 keywordsBase lesion, Oxidative DNA damage, DNA repair, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6lwg__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6lwg__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6lwg__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）21.54 Å
Rg（电子密度）20.74 Å
总 Rg21.57 Å
原子数2604
残基数287
排除体积44554 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6lwg__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6lwg__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 6lwg__assembly_3__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)