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6m3i

Crystal structure of HPF1/PARP1 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 100.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone PARylation factor 1

Homo sapiens

UniProt Q9NWY4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–346 未记录 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 × 1 （P09874） UNU BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M Tris-pH 7.0, 0.2 M magnesium formate dehydrate, 20% w/v PEG 3350. 分辨率 1.98 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6M3I Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6M3G Crystal structure of human HPF1 提交 2020-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–346（346 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M Tris-pH 8.1, 0.2 M potassium acetate, 20% w/v Polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.57 Å R-free 0.205
6TX2 Human HPF1 提交 2020-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–346（310 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；33% glycerol ethoxylate, 0.23 M lithium citrate tribasic tetrahydrate
分辨率 2.09 Å R-free 0.207
6TX3 HPF1 bound to catalytic fragment of PARP2 提交 2020-01-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–346（310 aa）
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES pH 6, 25% v/v pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH)
分辨率 2.96 Å R-free 0.260
6X0L Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：heptameric
链 O 1–346（346 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6X0M Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 O 1–346（346 aa）
链 o 1–346（346 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.30 Å
6X0N Bridging of double-strand DNA break activates PARP2/HPF1 to modify chromatin 提交 2020-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：23-meric
链 O 1–346（346 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
9MJA PARP1 ART in complex with HPF1 and EB47 提交 2024-12-14 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–346（346 aa）
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HPF1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–346； UniProt 1–346

Poly [ADP-ribose] polymerase 1

Homo sapiens

UniProt P09874

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 788–1014 未记录 Histone PARylation factor 1 × 1 （Q9NWY4） UNU BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M Tris-pH 7.0, 0.2 M magnesium formate dehydrate, 20% w/v PEG 3350. 分辨率 1.98 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6M3I Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1UK0 Crystal structure of catalytic domain of human poly(ADP-ribose) polymerase with a novel inhibitor 提交 2003-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–1010（350 aa） 片段：catalytic domain
未记录 FRM 2-{3-[4-(4-FLUOROPHENYL)-3,6-DIHYDRO-1(2H)-PYRIDINYL]PROPYL}-8-METHYL-4(3H)-QUINAZOLINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG400, Ammonium sulphate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.246
1UK0 Crystal structure of catalytic domain of human poly(ADP-ribose) polymerase with a novel inhibitor 提交 2003-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–1010（350 aa） 片段：catalytic domain
未记录 FRM 2-{3-[4-(4-FLUOROPHENYL)-3,6-DIHYDRO-1(2H)-PYRIDINYL]PROPYL}-8-METHYL-4(3H)-QUINAZOLINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG400, Ammonium sulphate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.246
1UK1 Crystal structure of human poly(ADP-ribose) polymerase complexed with a potent inhibitor 提交 2003-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–1010（350 aa） 片段：catalytic domain
未记录 FRQ 5-FLUORO-1-[4-(4-PHENYL-3,6-DIHYDROPYRIDIN-1(2H)-YL)BUTYL]QUINAZOLINE-2,4(1H,3H)-DIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG400, Ammonium sulphate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
1UK1 Crystal structure of human poly(ADP-ribose) polymerase complexed with a potent inhibitor 提交 2003-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–1010（350 aa） 片段：catalytic domain
未记录 FRQ 5-FLUORO-1-[4-(4-PHENYL-3,6-DIHYDROPYRIDIN-1(2H)-YL)BUTYL]QUINAZOLINE-2,4(1H,3H)-DIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG400, Ammonium sulphate, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
1WOK Crystal structure of catalytic domain of human poly(ADP-ribose) polymerase complexed with a quinoxaline-type inhibitor 提交 2004-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 661–1010（350 aa） 片段：Catalytic Domain
链 B 661–1010（350 aa） 片段：Catalytic Domain
链 C 661–1010（350 aa） 片段：Catalytic Domain
链 D 661–1010（350 aa） 片段：Catalytic Domain
未记录 CNQ 3-(4-CHLOROPHENYL)QUINOXALINE-5-CARBOXAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.288
2COK Solution structure of BRCT domain of poly(ADP-ribose) polymerase-1 提交 2005-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 386–485（100 aa） 片段：BRCA1 C-turminus (BRCT) domain
突变：P101S 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 1.19mM BRCT domain U-13C,15N; 20mM TrisHCl, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2CR9 Solution structure of WGR domain of poly(ADP-ribose) polymerase-1 提交 2005-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 517–642（126 aa） 片段：WGR domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 1.15mM WGR domain U-13C,15N; 20mM TrisHCl, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2CS2 Solution structure of the second Zn-finger domain of poly(ADP-ribose) polymerase-1 提交 2005-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 102–222（121 aa） 片段：zf-parp
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 1mM zf-PARP domain U-13C,15N; 20mM TrisHCl, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.02% NaN3, 0.1mM ZnCl2; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2JVN Domain C of human PARP-1 提交 2007-09-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 233–358（126 aa） 片段：Unp residues 233-358
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）260；压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PARP, 250 mM sodium chloride, 10 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2L30 Human PARP-1 zinc finger 1 提交 2010-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–108（108 aa） 片段：Finger_1 (UNP residues 1-108)
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.201；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM [U-99% 2H] TRIS-1, 200 mM sodium chloride-2, 150 uM zinc sulfate-3, 4 mM [U-99% 2H] DTT-4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2L31 Human PARP-1 zinc finger 2 提交 2010-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 103–214（112 aa） 片段：Finger_2 (UNP residues 103-214)
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.201；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM [U-99% 2H] TRIS-1, 200 mM sodium chloride-2, 150 uM zinc sulfate-3, 4 mM [U-99% 2H] DTT-4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2N8A 1H, 13C and 15N chemical shift assignments and solution structure for PARP-1 F1F2 domains in complex with a DNA single-strand break 提交 2015-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–214（214 aa） 片段：residues 1-214
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0004；压力 ambient
NMR测量条件 pH 7.2；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0004；压力 ambient
NMR测量条件 pH 7.2；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 Sample 1: 0.2 mM [U-15N; U-13C; U-2H] PARP-1 1, 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 9: 0.2 MM PARP-1 1-214, Sortase ligated, block-labelled sample. (N.B. residues 103 and 104 of WT sequence deleted, additional residues LPETGGG inserted between residues 102 and 105; this sample was not used for making any assignments of residues in this region, which is in the flexible linker between domains). Labelling for residues 1-102 (and LPET of insertion): [2H,15N,13C] back-labeled with Ile, Leu and Val methyl groups labeled as in sample 4a and [1H,13C,15N] Arg residues. Labelling for residues 105-214 (and GGG of insertion): uniform [1H,12C,15N]. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 10: 0.2 MM PARP-1 1-214, Sortase ligated, block-labelled sample. (N.B. residues 103 and 104 of WT sequence deleted, additional residues LPETGGG inserted between residues 102 and 105; this sample was not used for making any assignments of residues in this region, which is in the flexible linker between domains). Labelling for residues 1-102 (and LPET of insertion): [2H,15N,13C] back-labeled with Ile, Leu and Val methyl groups labeled as in sample 4a and [1H,13C,15N] Phe residues. Labelling for residues 105-214 (and GGG of insertion): uniform [1H,12C,15N]. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 11: 0.2 mM see Sample details section PARP-1 1, 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 12: 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 13: 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 14: 0.2 mM [U-15N; U-13C; U-2H] PARP-1 1, 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 15: 0.2 mM [U-15N; U-13C; U-2H] PARP-1 1, 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 uM ZnSO4, 200 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 16: 0.2 mM [U-15N; U-13C; U-2H] PARP-1 1, 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 uM ZnSO4, 200 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 2: 0.2 mM [U-15N; U-13C; U-70% 2H] PARP-1 1, 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 3: 0.2 mM [U-98% 2H; U-98% 15N] PARP-1 1, 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 4a: 0.2 MM PARP-1 1-214, Uniform [2H,15N,13C], back-labeled with [1H,13C] in the delta-methyl groups of Ile and all methyl groups of Leu and Val residues, using sodium [4-13C, 3,3-2H2] alpha-ketobutyrate and sodium [3- 2H, 4,4'-13C2] alpha-ketoisovalerate as precursors to maximize protonation of methyl groups, for use in NOE experiments; sodium [3-2H, 4,4'-13C2] alpha-ketoisovalerate was prepared from sodium [4,4'-13C2] alpha-ketoisovalerate by exchange with 2H2O at pH 12.5 and 45 C for 3 hrs. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 Sample 4b: 0.2 MM PARP-1 1-214, Uniform [2H,15N,13C], back-labeled with [1H,13C] in the delta-methyl groups of Ile and all methyl groups of Leu and Val residues, using sodium [3,3-2H2,13C4] alpha-ketobutyrate and sodium [3- 2H,13C5] alpha-ketoisovalerate as precursors to produce linear chains of 13C in the sidechains of Val and Leu, for use in assignment experiments to link methyl signals to C-alpha signals. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 5: 0.2 MM PARP-1 1-214, Uniform [2H,15N,13C], back-labeled with [1H,13C] in the methyl groups of Met residues in addition to Ile, Leu and Val methyl groups as in sample 4a. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 6: 0.2 MM PARP-1 1-214, Uniform [2H,15N,13C]; back-labeled with [1H,13C] in the methyl groups of Ile, Leu and Val methyl groups as in sample 4a and [1H,13C,15N] Phe residues. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 7: 0.2 MM PARP-1 1-214, Sortase ligated, block-labelled sample. (N.B. residues 103 and 104 of WT sequence deleted, additional residues LPETGGG inserted between residues 102 and 105; this sample was not used for making any assignments of residues in this region, which is in the flexible linker between domains). Labelling for residues 1-102 (and LPET of insertion): uniform [1H,12C,15N]. Labelling for residues 105-214 (and GGG of insertion): [2H,15N,13C] back-labeled with [1H,13C] Ile, Leu Val and Met methyl groups labeled as in sample 5. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Sample 8: 0.2 MM PARP-1 1-214, Sortase ligated, block-labelled sample. (N.B. residues 103 and 104 of WT sequence deleted, additional residues LPETGGG inserted between residues 102 and 105; this sample was not used for making any assignments of residues in this region, which is in the flexible linker between domains). Labelling for residues 1-102 (and LPET of insertion): uniform [1H,12C,15N]. Labelling for residues 105-214 (and GGG of insertion): [2H,15N,13C] back labeled with [1H,13C] Met methyl groups as in sample 5 and [13C,15N,1H] Arg residues. 0.2 mM DNA (45-MER), 50 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.1 mM ZnSO4, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2RCW PARP complexed with A620223 提交 2007-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：PARP alpha-helical and PARP catalytic domains
未记录 AAI trans-4-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)-1-propylpiperidinium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；protein 60mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 mM DTT PH 7.5; Well solution contains 1.3 M Ammonium Sulfate, 1.3 M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.80 Å R-free 0.317
2RD6 PARP complexed with A861695 提交 2007-09-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 78P (2R)-2-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)-2-methylpyrrolidinium × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；protein 60 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 mM DTT, pH 7.5, 2mM A861146. Well solution: 0.8 M NaCl, 1.8 M Ammonium Sulfate. Crystals are soaked in well solution containing 1mM A861695 from 0.1M DMSO stock. Cryoprotectant: 1.2 M NaCl, 1.6 M Ammonium Sulfate, 20 % Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.30 Å R-free 0.308
2RIQ Crystal Structure of the Third Zinc-binding domain of human PARP-1 提交 2007-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 216–366（151 aa） 片段：Third Zinc-binding domain
未记录 ZN ZINC ION × 2 EOH ETHANOL × 2 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20% ethanol, 100 mM Tris-HCl pH 8.5, 25 mM NaCl, and 0.5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
3GJW PARP complexed with A968427 提交 2009-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：PARP alpha-helical and catalytic domains
突变：V101A GJW 7-(pyrrolidin-1-ylmethyl)pyrrolo[1,2-a]quinoxalin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；Protein Solution: PARP 60 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 mM DTT PH 7.5, 2mM A861146, well solution: 0.8 M NaCl, 1.8 M Ammonium Sulfate, Crystals are soaked in well solution containing 1mM A968427 from 0.1 M DMSO stock, Cryoprotectant: 1.2 M NaCl, 1.6 M Ammonium Sulfate, 20 % Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.30 Å R-free 0.276
3GN7 PARP complexed with A861696 提交 2009-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：PARP alpha-helical and catalytic domains
突变：V101A 3GN 2-[(2S)-2-methylpyrrolidin-2-yl]-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；Protein Solution: PARP 60 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 MM DTT PH 7.5, 2mM A861146, Well Solution: 0.8 M NaCl, 1.8 M Ammonium Sulfate, Crystals are soaked in well solution containing 1mM A861696 from 0.1 M DMSO stock, Cryoprotectant: 1.2 M NaCl, 1.6 M Ammonium Sulfate, 20 % Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.50 Å R-free 0.271
3L3L PARP complexed with A906894 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：residues 662-1011
突变：V762A L3L 3-oxo-2-piperidin-4-yl-2,3-dihydro-1H-isoindole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；Protein Solution : PARP 60 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 mM DTT PH 7.5, 2mM A861146 Well Solution : 0.8 M NaCl, 1.8 M Ammonium Sulfate Crystals are soaked in well solution containing 1mM A906894 from 0.1 M DMSO stock Cryoprotectant : 1.2 M NaCl, 1.6 M Ammonium Sulfate, 20 % Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.50 Å R-free 0.285
3L3L PARP complexed with A906894 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：residues 662-1011
突变：V762A L3L 3-oxo-2-piperidin-4-yl-2,3-dihydro-1H-isoindole-4-carboxamide × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；Protein Solution : PARP 60 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 mM DTT PH 7.5, 2mM A861146 Well Solution : 0.8 M NaCl, 1.8 M Ammonium Sulfate Crystals are soaked in well solution containing 1mM A906894 from 0.1 M DMSO stock Cryoprotectant : 1.2 M NaCl, 1.6 M Ammonium Sulfate, 20 % Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.50 Å R-free 0.285
3L3M PARP complexed with A927929 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：residues 662-1011
突变：V762A A92 2-{2-fluoro-4-[(2S)-piperidin-2-yl]phenyl}-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；Protein Solution : PARP 60 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 1.5 mM DTT PH 7.5, 2 mM A861146 Well Solution : 0.8 M NaCl, 1.8M Ammonium Sulfate Crystals are soaked in well solution containing 1 mM A927929 from 0.1 M DMSO stock Cryoprotectant : 1.2 M NaCl, 1.6 M Ammonium Sulfate, 20 % Ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
3OD8 Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 B 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.241
3OD8 Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 D 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.241
3OD8 Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 F 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.241
3OD8 Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 G 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 H 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.241
3ODA Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 B 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
3ODA Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 D 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
3ODA Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 F 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
3ODA Human PARP-1 zinc finger 1 (Zn1) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 G 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
链 H 2–96（95 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 1, Zn1, UNP residues 2-96
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；30% PEG 3350, 100 mM NaAcetate, 100 mM Tris pH 8.5, 0.1 mM TCEP, 20% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
3ODC Human PARP-1 zinc finger 2 (Zn2) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 105–206（102 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 2, Zn2, UNP residues 105-206
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；1.36-1.42 M sodium citrate pH 6.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.240
3ODC Human PARP-1 zinc finger 2 (Zn2) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 105–206（102 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 2, Zn2, UNP residues 105-206
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；1.36-1.42 M sodium citrate pH 6.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.240
3ODE Human PARP-1 zinc finger 2 (Zn2) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 105–206（102 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 2, Zn2, UNP residues 105-206
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；1.36-1.42 M sodium citrate pH 6.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.95 Å R-free 0.244
3ODE Human PARP-1 zinc finger 2 (Zn2) bound to DNA 提交 2010-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 105–206（102 aa） 片段：PARP-1 zinc finger 2, Zn2, UNP residues 105-206
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；1.36-1.42 M sodium citrate pH 6.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 2.95 Å R-free 0.244
4AV1 Crystal structure of the human PARP-1 DNA binding domain in complex with DNA 提交 2012-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 5–202（198 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 5-202
链 B 5–202（198 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 5-202
链 C 5–202（198 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 5-202
链 D 5–202（198 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN, RESIDUES 5-202
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 50 MM MES PH 6.5, 6% W/V PEG 1500, 5 MM DTT
分辨率 3.10 Å R-free 0.249
4DQY Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break 提交 2012-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 A 1–96（96 aa） 片段：Zinc Finger 1 (Zn1)
链 B 216–366（151 aa） 片段：Zinc Finger 3 (Zn3)
链 C 518–1014（497 aa） 片段：WGR-CAT fragment
未记录 ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；7% Peg 3350, 10% ethylene glycol, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.304
4DQY Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break 提交 2012-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 D 1–96（96 aa） 片段：Zinc Finger 1 (Zn1)
链 E 216–366（151 aa） 片段：Zinc Finger 3 (Zn3)
链 F 518–1014（497 aa） 片段：WGR-CAT fragment
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；7% Peg 3350, 10% ethylene glycol, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.304
4GV7 Human ARTD1 (PARP1) - Catalytic domain in complex with inhibitor ME0328 提交 2012-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：;Catalytic domain, UNP residues 662-1011' ;
未记录 MEW 2-methylquinazolin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M Bis-tris-propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.286
4GV7 Human ARTD1 (PARP1) - Catalytic domain in complex with inhibitor ME0328 提交 2012-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：;Catalytic domain, UNP residues 662-1011' ;
未记录 MEW 2-methylquinazolin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M Bis-tris-propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.286
4GV7 Human ARTD1 (PARP1) - Catalytic domain in complex with inhibitor ME0328 提交 2012-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa） 片段：;Catalytic domain, UNP residues 662-1011' ;
未记录 MEW 2-methylquinazolin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M Bis-tris-propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.286
4GV7 Human ARTD1 (PARP1) - Catalytic domain in complex with inhibitor ME0328 提交 2012-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa） 片段：;Catalytic domain, UNP residues 662-1011' ;
未记录 MEW 2-methylquinazolin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M Bis-tris-propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.286
4HHY Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15R (9aR)-1-[(1-{2-fluoro-5-[(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)methyl]benzoyl}piperidin-4-yl)carbonyl]-1,2,3,8,9,9a-hexahydro-7H-benzo[de][1,7]naphthyridin-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.299
4HHY Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15R (9aR)-1-[(1-{2-fluoro-5-[(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)methyl]benzoyl}piperidin-4-yl)carbonyl]-1,2,3,8,9,9a-hexahydro-7H-benzo[de][1,7]naphthyridin-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.299
4HHY Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15R (9aR)-1-[(1-{2-fluoro-5-[(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)methyl]benzoyl}piperidin-4-yl)carbonyl]-1,2,3,8,9,9a-hexahydro-7H-benzo[de][1,7]naphthyridin-7-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.299
4HHY Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15R (9aR)-1-[(1-{2-fluoro-5-[(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)methyl]benzoyl}piperidin-4-yl)carbonyl]-1,2,3,8,9,9a-hexahydro-7H-benzo[de][1,7]naphthyridin-7-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.299
4HHZ Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15S N-{(2S)-1-[4-(4-fluorophenyl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]-1-oxopropan-2-yl}-2-[(9aR)-7-oxo-2,3,7,8,9,9a-hexahydro-1H-benzo[de][1,7]naphthyridin-1-yl]acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.72 Å R-free 0.275
4HHZ Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15S N-{(2S)-1-[4-(4-fluorophenyl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]-1-oxopropan-2-yl}-2-[(9aR)-7-oxo-2,3,7,8,9,9a-hexahydro-1H-benzo[de][1,7]naphthyridin-1-yl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.72 Å R-free 0.275
4HHZ Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15S N-{(2S)-1-[4-(4-fluorophenyl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]-1-oxopropan-2-yl}-2-[(9aR)-7-oxo-2,3,7,8,9,9a-hexahydro-1H-benzo[de][1,7]naphthyridin-1-yl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.72 Å R-free 0.275
4HHZ Crystal structure of PARP catalytic domain in complex with novel inhibitors 提交 2012-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 660–1011（352 aa） 片段：UNP Residues 660-1101
未记录 15S N-{(2S)-1-[4-(4-fluorophenyl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]-1-oxopropan-2-yl}-2-[(9aR)-7-oxo-2,3,7,8,9,9a-hexahydro-1H-benzo[de][1,7]naphthyridin-1-yl]acetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M TRIS pH 8.0, 1% PEG400, 1.9M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.72 Å R-free 0.275
4L6S PARP complexed with benzo[1,4]oxazin-3-one inhibitor 提交 2013-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：unp residues 662-1011
突变：V762A 1WQ (2S)-6-{[4-(4-chlorophenyl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]methyl}-2-methyl-2H-1,4-benzoxazin-3(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.4M tri-sodium citrate, 0.1M HEPES , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
4L6S PARP complexed with benzo[1,4]oxazin-3-one inhibitor 提交 2013-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：unp residues 662-1011
突变：V762A 1WQ (2S)-6-{[4-(4-chlorophenyl)-3,6-dihydropyridin-1(2H)-yl]methyl}-2-methyl-2H-1,4-benzoxazin-3(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.4M tri-sodium citrate, 0.1M HEPES , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
4OPX Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break in complex with (2R)-5-fluoro-2-methyl-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide 提交 2014-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–97（97 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 A 207–366（160 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 C 518–1014（497 aa） 片段：C-terminus (WGR-CAT, UNP residues 518-1014)
未记录 ZN ZINC ION × 2 2UR (2R)-5-fluoro-2-methyl-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 0.1 mM TCEP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.31 Å R-free 0.325
4OPX Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break in complex with (2R)-5-fluoro-2-methyl-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide 提交 2014-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–97（97 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 D 207–366（160 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 F 518–1014（497 aa） 片段：C-terminus (WGR-CAT, UNP residues 518-1014)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 0.1 mM TCEP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.31 Å R-free 0.325
4OQA Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break in complex with (2Z)-2-(2,4-dihydroxybenzylidene)-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide 提交 2014-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–97（97 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 A 207–366（160 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 C 518–1014（497 aa） 片段：C-terminus (WGR-CAT, UNP residues 518-1014)
未记录 ZN ZINC ION × 2 2US (2Z)-2-(2,4-dihydroxybenzylidene)-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 0.1 mM TCEP, 6.8% PEG3350, 2% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.334
4OQA Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break in complex with (2Z)-2-(2,4-dihydroxybenzylidene)-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide 提交 2014-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–97（97 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 D 207–366（160 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 F 518–1014（497 aa） 片段：C-terminus (WGR-CAT, UNP residues 518-1014)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 0.1 mM TCEP, 6.8% PEG3350, 2% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.334
4OQB Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break in complex with (2Z)-2-{4-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]benzylidene}-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide 提交 2014-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–97（97 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 A 207–366（160 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 C 518–1014（497 aa） 片段：C-terminus (WGR-CAT, UNP residues 518-1014)
未记录 ZN ZINC ION × 2 2UT (2Z)-2-{4-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]benzylidene}-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 0.1 mM TCEP, 6.8% PEG3350, 2% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.36 Å R-free 0.349
4OQB Structure of Human PARP-1 bound to a DNA double strand break in complex with (2Z)-2-{4-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]benzylidene}-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide 提交 2014-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–97（97 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 D 207–366（160 aa） 片段：N-terminus (Zn1-Zn3, SEE REMARK 999)
链 F 518–1014（497 aa） 片段：C-terminus (WGR-CAT, UNP residues 518-1014)
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 0.1 mM TCEP, 6.8% PEG3350, 2% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.36 Å R-free 0.349
4PJT Structure of PARP1 catalytic domain bound to inhibitor BMN 673 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：PARP1 HELICAL AND CATALYTIC DOMAINS (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；2.1 M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS, PH 7.2
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4PJT Structure of PARP1 catalytic domain bound to inhibitor BMN 673 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：PARP1 HELICAL AND CATALYTIC DOMAINS (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；2.1 M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS, PH 7.2
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4PJT Structure of PARP1 catalytic domain bound to inhibitor BMN 673 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa） 片段：PARP1 HELICAL AND CATALYTIC DOMAINS (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；2.1 M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS, PH 7.2
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4PJT Structure of PARP1 catalytic domain bound to inhibitor BMN 673 提交 2014-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa） 片段：PARP1 HELICAL AND CATALYTIC DOMAINS (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；2.1 M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS, PH 7.2
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4R5W Human artd1 (parp1) - catalytic domain in complex with inhibitor xav939 提交 2014-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：Catalytic Domain (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 XAV 2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-7,8-dihydro-5H-thiopyrano[4,3-d]pyrimidin-4-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；21% PEG-3350, 0.17M Ammonium Sulfate, 0.09M Bis-Tris, 1mM XAV939, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.84 Å R-free 0.245
4R5W Human artd1 (parp1) - catalytic domain in complex with inhibitor xav939 提交 2014-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：Catalytic Domain (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 XAV 2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-7,8-dihydro-5H-thiopyrano[4,3-d]pyrimidin-4-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；21% PEG-3350, 0.17M Ammonium Sulfate, 0.09M Bis-Tris, 1mM XAV939, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.84 Å R-free 0.245
4R6E Human artd1 (parp1) - catalytic domain in complex with inhibitor niraparib 提交 2014-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP residues 662-1011)
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG-3350, 0.16M Ammonium Sulfate, 0.08M Bis-Tris, 0.001M Niraparib, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.218
4R6E Human artd1 (parp1) - catalytic domain in complex with inhibitor niraparib 提交 2014-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP residues 662-1011)
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG-3350, 0.16M Ammonium Sulfate, 0.08M Bis-Tris, 0.001M Niraparib, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.218
4R6E Human artd1 (parp1) - catalytic domain in complex with inhibitor niraparib 提交 2014-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP residues 662-1011)
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG-3350, 0.16M Ammonium Sulfate, 0.08M Bis-Tris, 0.001M Niraparib, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.218
4R6E Human artd1 (parp1) - catalytic domain in complex with inhibitor niraparib 提交 2014-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP residues 662-1011)
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG-3350, 0.16M Ammonium Sulfate, 0.08M Bis-Tris, 0.001M Niraparib, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.218
4RV6 Human ARTD1 (PARP1) catalytic domain in complex with inhibitor Rucaparib 提交 2014-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：Catalytic PARP domain (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 RPB Rucaparib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；277 K；27% PEG3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, 1mM Rucaparib, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.19 Å R-free 0.212
4RV6 Human ARTD1 (PARP1) catalytic domain in complex with inhibitor Rucaparib 提交 2014-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：Catalytic PARP domain (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 RPB Rucaparib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；277 K；27% PEG3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, 1mM Rucaparib, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.19 Å R-free 0.212
4RV6 Human ARTD1 (PARP1) catalytic domain in complex with inhibitor Rucaparib 提交 2014-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa） 片段：Catalytic PARP domain (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；277 K；27% PEG3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, 1mM Rucaparib, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.19 Å R-free 0.212
4RV6 Human ARTD1 (PARP1) catalytic domain in complex with inhibitor Rucaparib 提交 2014-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa） 片段：Catalytic PARP domain (UNP residues 662-1011)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；277 K；27% PEG3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, 1mM Rucaparib, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.19 Å R-free 0.212
4UND HUMAN ARTD1 (PARP1) - CATALYTIC DOMAIN IN COMPLEX WITH INHIBITOR TALAZOPARIB 提交 2014-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 662-1011
未记录 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.6；39% PEGMME2000, 0.2M KSCN, 0.1M HEPES, pH 6.6
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
4UND HUMAN ARTD1 (PARP1) - CATALYTIC DOMAIN IN COMPLEX WITH INHIBITOR TALAZOPARIB 提交 2014-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 662-1011
未记录 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.6；39% PEGMME2000, 0.2M KSCN, 0.1M HEPES, pH 6.6
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
4UXB Human ARTD1 (PARP1) - Catalytic domain in complex with inhibitor PJ34 提交 2014-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 662-1011
未记录 P34 N~2~,N~2~-DIMETHYL-N~1~-(6-OXO-5,6-DIHYDROPHENANTHRIDIN-2-YL)GLYCINAMIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；25% PEG3350 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M BIS-TRIS PH 5.5, 1MM PJ34
分辨率 3.22 Å R-free 0.273
4UXB Human ARTD1 (PARP1) - Catalytic domain in complex with inhibitor PJ34 提交 2014-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 662-1011
未记录 P34 N~2~,N~2~-DIMETHYL-N~1~-(6-OXO-5,6-DIHYDROPHENANTHRIDIN-2-YL)GLYCINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；25% PEG3350 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M BIS-TRIS PH 5.5, 1MM PJ34
分辨率 3.22 Å R-free 0.273
4XHU The complex structure of Timeless_PAB and PARP-1_catalytic domain 提交 2015-01-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 661–1014（354 aa） 片段：UNP RESIDUES 661-1014
未记录 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；200mM sodium acetate 100mM calcium cacodylate 15% PEG8000
分辨率 2.09 Å R-free 0.210
4XHU The complex structure of Timeless_PAB and PARP-1_catalytic domain 提交 2015-01-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 661–1014（354 aa） 片段：UNP RESIDUES 661-1014
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；200mM sodium acetate 100mM calcium cacodylate 15% PEG8000
分辨率 2.09 Å R-free 0.210
4ZZZ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to an isoindolinone inhibitor 提交 2015-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 655–1014（360 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 665-1014
链 B 655–1014（360 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 665-1014
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 FSU 2-(3-methoxypropyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；2M AMMONIUM SULFATE, 2% PEG400 0.1 M TRIS PH 8.0, TEMPERATURE 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.265
5A00 Structure of human PARP1 catalytic domain bound to an isoindolinone inhibitor 提交 2015-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 655–1014（360 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 665-1014
未记录 D7N 2-[1-(4,4-Difluorocyclohexyl)-piperidin-4-yl]-6-fluoro-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；2M AMMONIUM SULFATE, 2% PEG400 0.1 M TRIS PH 8.0 TEMPERATURE 277K -
分辨率 2.75 Å R-free 0.280
5DS3 Crystal structure of constitutively active PARP-1 提交 2015-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 788-1012)
未记录 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 09L 4-(3-{[4-(cyclopropylcarbonyl)piperazin-1-yl]carbonyl}-4-fluorobenzyl)phthalazin-1(2H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.251
5HA9 Crystal structure-based design and disovery of a novel PARP1 antiagonist (BL-PA10) that induces apoptosis and inhibits metastasis in triple negative breast cancer 提交 2015-12-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：UNP RESIDUES 662-1011
链 B 662–1011（350 aa） 片段：UNP RESIDUES 662-1011
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 6 TP0 Amitriptyline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；2.1 M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 4.01 Å R-free 0.358
5KPN Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6WX 1-[[4-fluoranyl-3-(3-oxidanylidene-4-propyl-piperazin-1-yl)carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.30 Å R-free 0.293
5KPN Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6WX 1-[[4-fluoranyl-3-(3-oxidanylidene-4-propyl-piperazin-1-yl)carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.30 Å R-free 0.293
5KPO Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6WY 1-[[3-(4-ethyl-3-oxidanylidene-piperazin-1-yl)carbonyl-4-fluoranyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.65 Å R-free 0.303
5KPO Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6WY 1-[[3-(4-ethyl-3-oxidanylidene-piperazin-1-yl)carbonyl-4-fluoranyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.65 Å R-free 0.303
5KPP Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6WZ 1-[[4-fluoranyl-3-[(3R)-3-methyl-4-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]piperazin-1-yl]carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.33 Å R-free 0.284
5KPP Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6WZ 1-[[4-fluoranyl-3-[(3R)-3-methyl-4-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]piperazin-1-yl]carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.33 Å R-free 0.284
5KPQ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6X2 1-[[4-fluoranyl-3-[(3R)-3-methyl-4-propyl-piperazin-1-yl]carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.55 Å R-free 0.282
5KPQ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 6X2 1-[[4-fluoranyl-3-[(3R)-3-methyl-4-propyl-piperazin-1-yl]carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.55 Å R-free 0.282
5WRQ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7TX 5-[[2,4-bis(oxidanylidene)quinazolin-1-yl]methyl]-2-fluoranyl-N-[(3R)-1-(3-methylbutyl)pyrrolidin-3-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.65 Å R-free 0.297
5WRQ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7TX 5-[[2,4-bis(oxidanylidene)quinazolin-1-yl]methyl]-2-fluoranyl-N-[(3R)-1-(3-methylbutyl)pyrrolidin-3-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.65 Å R-free 0.297
5WRY Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 4YR N-[(3R)-1-(cyclopropylmethyl)pyrrolidin-3-yl]-5-[(2,4-dioxo-3,4-dihydroquinazolin-1(2H)-yl)methyl]-2-fluorobenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.30 Å R-free 0.275
5WRY Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 4YR N-[(3R)-1-(cyclopropylmethyl)pyrrolidin-3-yl]-5-[(2,4-dioxo-3,4-dihydroquinazolin-1(2H)-yl)methyl]-2-fluorobenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.30 Å R-free 0.275
5WRZ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a phthalazinone inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7U3 7-fluoranyl-4-[[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methoxy]-2H-phthalazin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.20 Å R-free 0.280
5WRZ Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a phthalazinone inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7U3 7-fluoranyl-4-[[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methoxy]-2H-phthalazin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.20 Å R-free 0.280
5WS0 Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a benzoimidazole inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7U6 2-piperazin-1-ylcarbonyl-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.60 Å R-free 0.277
5WS0 Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a benzoimidazole inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7U6 2-piperazin-1-ylcarbonyl-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.60 Å R-free 0.277
5WS1 Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a benzoimidazole inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7U9 2-[(3R)-3-azanylpyrrolidin-1-yl]carbonyl-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 1.90 Å R-free 0.273
5WS1 Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a benzoimidazole inhibitor 提交 2016-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7U9 2-[(3R)-3-azanylpyrrolidin-1-yl]carbonyl-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 1.90 Å R-free 0.273
5WTC Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7UL 1-[[4-fluoranyl-3-[4-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]piperazin-1-yl]carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
5WTC Structure of human PARP1 catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2016-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 662-1011
突变：V762A 7UL 1-[[4-fluoranyl-3-[4-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]piperazin-1-yl]carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.5M AMMONIUM SULFATE, 100mM TRIS
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
5XSR novel orally efficacious inhibitors complexed with PARP1 提交 2017-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：UNP residues 660-1011
未记录 8EC 6-fluoranyl-2-(4,5,6,7-tetrahydrothieno[2,3-c]pyridin-2-yl)-1~{H}-benzimidazole-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；80mM NaCl, 1.9M (NH4)2SO4
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
5XST novel orally efficacious inhibitors complexed with PARP1 提交 2017-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1010（349 aa） 片段：UNP residues 662-1011
未记录 8E6 6-fluoranyl-2-(4,5,6,7-tetrahydrothieno[3,2-c]pyridin-2-yl)-1~{H}-benzimidazole-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；283 K；80mM NaCl, 1.9M (NH4)2SO4
分辨率 2.30 Å R-free 0.236
5XSU novel orally efficacious inhibitors complexed with PARP1 提交 2017-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：UNP residues 660-1011
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 8E3 6-fluoranyl-2-(4,5,6,7-tetrahydrofuro[2,3-c]pyridin-2-yl)-1~{H}-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 1% PEG400, 2.1M (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.274
5XSU novel orally efficacious inhibitors complexed with PARP1 提交 2017-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：UNP residues 660-1011
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 8E3 6-fluoranyl-2-(4,5,6,7-tetrahydrofuro[2,3-c]pyridin-2-yl)-1~{H}-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 1% PEG400, 2.1M (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.274
5XSU novel orally efficacious inhibitors complexed with PARP1 提交 2017-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa） 片段：UNP residues 660-1011
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 8E3 6-fluoranyl-2-(4,5,6,7-tetrahydrofuro[2,3-c]pyridin-2-yl)-1~{H}-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 1% PEG400, 2.1M (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.274
5XSU novel orally efficacious inhibitors complexed with PARP1 提交 2017-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa） 片段：UNP residues 660-1011
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 8E3 6-fluoranyl-2-(4,5,6,7-tetrahydrofuro[2,3-c]pyridin-2-yl)-1~{H}-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 1% PEG400, 2.1M (NH4)2SO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.274
6BHV Human PARP-1 bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide (BAD) 提交 2017-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa）
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PARP-1 CATdeltaHD (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
6BHV Human PARP-1 bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide (BAD) 提交 2017-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 788–1012（225 aa）
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PARP-1 CATdeltaHD (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
6BHV Human PARP-1 bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide (BAD) 提交 2017-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 788–1012（225 aa）
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PARP-1 CATdeltaHD (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
6BHV Human PARP-1 bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide (BAD) 提交 2017-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 788–1012（225 aa）
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PARP-1 CATdeltaHD (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
6GHK Human PARP1 (ARTD1) - Catalytic domain in complex with inhibitor ME0527 提交 2018-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1012（351 aa）
未记录 EZ2 ~{N}-[(1~{R})-1-(4-imidazol-1-ylphenyl)ethyl]-3-(4-oxidanylidene-1~{H}-quinazolin-2-yl)propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；22.5% PEG 3350, 0.18M ammonium sulfate, 0.09M Bis-Tris
分辨率 2.28 Å R-free 0.227
6GHK Human PARP1 (ARTD1) - Catalytic domain in complex with inhibitor ME0527 提交 2018-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1012（351 aa）
未记录 EZ2 ~{N}-[(1~{R})-1-(4-imidazol-1-ylphenyl)ethyl]-3-(4-oxidanylidene-1~{H}-quinazolin-2-yl)propanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；22.5% PEG 3350, 0.18M ammonium sulfate, 0.09M Bis-Tris
分辨率 2.28 Å R-free 0.227
6NRF Crystal Structure of human PARP-1 ART domain bound to inhibitor UTT103 提交 2019-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 KYV 2-({4-[4-(1H-benzimidazol-2-yl)piperazine-1-carbonyl]phenyl}methyl)-3-hydroxy-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；298 K；~20% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate or sodium citrate, 100 mM Hepes pH 7.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
6NRG Crystal Structure of human PARP-1 ART domain bound to inhibitor UTT57 提交 2019-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 KYY 2-{[3-fluoro-4-(1H-tetrazol-5-yl)phenyl]methyl}-3-hydroxy-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；298 K；~20% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate or sodium citrate, 100 mM Hepes pH 7.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.182
6NRH Crystal Structure of human PARP-1 ART domain bound inhibitor UTT63 提交 2019-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 KYP 3-hydroxy-2-({4-[4-(pyrimidin-2-yl)piperazine-1-carbonyl]phenyl}methyl)-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；298 K；~20% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate or sodium citrate, 100 mM Hepes pH 7.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.158
6NRI Crystal Structure of human PARP-1 ART domain bound to inhibitor UTT83 提交 2019-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 KYM (2Z)-2-{[4-(3-cyclopropyl-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine-7(8H)-carbonyl)phenyl]methylidene}-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；298 K；~20% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate or sodium citrate, 100 mM Hepes pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
6NRJ Crystal Structure of human PARP-1 ART domain bound to inhibitor UTT93 提交 2019-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 KYJ (2Z)-2-[(4-{[2-(1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]carbamoyl}phenyl)methylidene]-3-oxo-2,3-dihydro-1-benzofuran-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；298 K；~20% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate or sodium citrate, 100 mM Hepes pH 7.5
分辨率 1.65 Å R-free 0.191
6NTU Crystal Structure of human PARP-1 ART domain bound to inhibitor UKTT-15 提交 2019-01-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 L1S methyl 2-{4-[4-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)benzene-1-carbonyl]piperazin-1-yl}pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.6；298 K；~20% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 10% DMSO (plus 20% sucrose in cryo), 100 mM sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.80 Å R-free 0.186
6VKK Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor rucaparib 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 RPB Rucaparib × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris
分辨率 2.10 Å R-free 0.261
6VKK Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor rucaparib 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 RPB Rucaparib × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris
分辨率 2.10 Å R-free 0.261
6VKK Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor rucaparib 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 RPB Rucaparib × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris
分辨率 2.10 Å R-free 0.261
6VKK Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor rucaparib 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 RPB Rucaparib × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris
分辨率 2.10 Å R-free 0.261
6VKO Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor UKTT15 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 L1S methyl 2-{4-[4-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)benzene-1-carbonyl]piperazin-1-yl}pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；2M Ammonium Sulfate, Bis-Tris pH6.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
6VKO Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor UKTT15 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 L1S methyl 2-{4-[4-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)benzene-1-carbonyl]piperazin-1-yl}pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；2M Ammonium Sulfate, Bis-Tris pH6.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
6VKO Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor UKTT15 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 L1S methyl 2-{4-[4-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)benzene-1-carbonyl]piperazin-1-yl}pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；2M Ammonium Sulfate, Bis-Tris pH6.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
6VKO Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor UKTT15 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 L1S methyl 2-{4-[4-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)benzene-1-carbonyl]piperazin-1-yl}pyrimidine-5-carboxylate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；2M Ammonium Sulfate, Bis-Tris pH6.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
6VKQ Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor EB-47 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris pH 8
分辨率 2.90 Å R-free 0.353
6VKQ Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor EB-47 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris pH 8
分辨率 2.90 Å R-free 0.353
6VKQ Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor EB-47 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris pH 8
分辨率 2.90 Å R-free 0.353
6VKQ Crystal Structure of human PARP-1 CAT domain bound to inhibitor EB-47 提交 2020-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 661–1011（351 aa） 片段：catalytic domain
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；2M Ammonium Sulfate, 5% PEG 400, 100 mM Tris pH 8
分辨率 2.90 Å R-free 0.353
6XVW Catalytic domain of human PARP-1 in complex with the inhibitor MC2050 提交 2020-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 663–1014（352 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 O3H 2-[2-(4-pyridin-2-ylpiperazin-1-yl)ethylsulfanyl]-3~{H}-quinazolin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 20% (w/w) PEG 2.000 MME, 0.01 M NiCl2
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
6XVW Catalytic domain of human PARP-1 in complex with the inhibitor MC2050 提交 2020-01-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 663–1014（352 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 O3H 2-[2-(4-pyridin-2-ylpiperazin-1-yl)ethylsulfanyl]-3~{H}-quinazolin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 20% (w/w) PEG 2.000 MME, 0.01 M NiCl2
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
7AAA Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 (apo) 提交 2020-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.45 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.74 Å R-free 0.227
7AAA Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 (apo) 提交 2020-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.45 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.74 Å R-free 0.227
7AAB Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 in complex with inhibitor EB-47 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；0.4 M ammonium sulfate, 25 % PEG3350, 0.1 M PCTP pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
7AAB Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 in complex with inhibitor EB-47 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；0.4 M ammonium sulfate, 25 % PEG3350, 0.1 M PCTP pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
7AAC Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 in complex with veliparib 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 78P (2R)-2-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)-2-methylpyrrolidinium × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.59 Å R-free 0.242
7AAC Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 in complex with veliparib 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 78P (2R)-2-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)-2-methylpyrrolidinium × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.59 Å R-free 0.242
7AAD Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 in complex with olaparib 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 09L 4-(3-{[4-(cyclopropylcarbonyl)piperazin-1-yl]carbonyl}-4-fluorobenzyl)phthalazin-1(2H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.21 Å R-free 0.254
7AAD Crystal structure of the catalytic domain of human PARP1 in complex with olaparib 提交 2020-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 09L 4-(3-{[4-(cyclopropylcarbonyl)piperazin-1-yl]carbonyl}-4-fluorobenzyl)phthalazin-1(2H)-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.21 Å R-free 0.254
7CMW Complex structure of PARP1 catalytic domain with pamiparib 提交 2020-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
突变：V762A DS9 (2R)-14-fluoro-2-methyl-6,9,10,19-tetrazapentacyclo[14.2.1.02,6.08,18.012,17]nonadeca-1(18),8,12(17),13,15-pentaen-11-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.2 M DL-malic acid pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
7CMW Complex structure of PARP1 catalytic domain with pamiparib 提交 2020-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
突变：V762A DS9 (2R)-14-fluoro-2-methyl-6,9,10,19-tetrazapentacyclo[14.2.1.02,6.08,18.012,17]nonadeca-1(18),8,12(17),13,15-pentaen-11-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.2 M DL-malic acid pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
7KK2 Structure of the catalytic domain of PARP1 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Buffer: 0.1 M bicine (pH 9.00) Precipitant: 2.4 M Ammonium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7KK2 Structure of the catalytic domain of PARP1 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Buffer: 0.1 M bicine (pH 9.00) Precipitant: 2.4 M Ammonium sulfate
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7KK3 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with talazoparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Buffer: 0.1 M Sodium Citrate (pH 5.60) Salt: 1.0 M ammonium formate Precipitant: 23.0 %w/v PEG 4000
分辨率 2.06 Å R-free 0.259
7KK3 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with talazoparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Buffer: 0.1 M Sodium Citrate (pH 5.60) Salt: 1.0 M ammonium formate Precipitant: 23.0 %w/v PEG 4000
分辨率 2.06 Å R-free 0.259
7KK3 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with talazoparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa）
未记录 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Buffer: 0.1 M Sodium Citrate (pH 5.60) Salt: 1.0 M ammonium formate Precipitant: 23.0 %w/v PEG 4000
分辨率 2.06 Å R-free 0.259
7KK3 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with talazoparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa）
未记录 2YQ (8S,9R)-5-fluoro-8-(4-fluorophenyl)-9-(1-methyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl)-2,7,8,9-tetrahydro-3H-pyrido[4,3,2-de]phthalazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Buffer: 0.1 M Sodium Citrate (pH 5.60) Salt: 1.0 M ammonium formate Precipitant: 23.0 %w/v PEG 4000
分辨率 2.06 Å R-free 0.259
7KK4 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with olaparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 09L 4-(3-{[4-(cyclopropylcarbonyl)piperazin-1-yl]carbonyl}-4-fluorobenzyl)phthalazin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Salt: 0.2 M Magnesium chloride hexahydrate Buffer: 0.1 M Tris (pH 8.50) Precipitant: 30.0 %w/v PEG 4000
分辨率 1.96 Å R-free 0.266
7KK4 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with olaparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 09L 4-(3-{[4-(cyclopropylcarbonyl)piperazin-1-yl]carbonyl}-4-fluorobenzyl)phthalazin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Salt: 0.2 M Magnesium chloride hexahydrate Buffer: 0.1 M Tris (pH 8.50) Precipitant: 30.0 %w/v PEG 4000
分辨率 1.96 Å R-free 0.266
7KK5 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with niraparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50) Precipitant: 25.0 %w/v PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7KK5 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with niraparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50) Precipitant: 25.0 %w/v PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7KK5 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with niraparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–1011（350 aa）
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50) Precipitant: 25.0 %w/v PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7KK5 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with niraparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–1011（350 aa）
未记录 3JD 2-{4-[(3S)-piperidin-3-yl]phenyl}-2H-indazole-7-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；294 K；Salt: 0.2 M Ammonium sulfate Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.50) Precipitant: 25.0 %w/v PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.238
7KK6 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with veliparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 78P (2R)-2-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)-2-methylpyrrolidinium × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.00) Precipitant: 3.0 M Ammonium sulfate
分辨率 2.06 Å R-free 0.271
7KK6 Structure of the catalytic domain of PARP1 in complex with veliparib 提交 2020-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 78P (2R)-2-(7-carbamoyl-1H-benzimidazol-2-yl)-2-methylpyrrolidinium × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Buffer: 0.1 M HEPES (pH 7.00) Precipitant: 3.0 M Ammonium sulfate
分辨率 2.06 Å R-free 0.271
7ONR PARP1 catalytic domain in complex with 8-chloroquinazolinone-based inhibitor (compound 9) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A VKW 8-chloranyl-2-[3-[4-(1,5-dimethylimidazol-2-yl)piperazin-1-yl]propyl]-3~{H}-quinazolin-4-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M PCTP pH 9.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.213
7ONR PARP1 catalytic domain in complex with 8-chloroquinazolinone-based inhibitor (compound 9) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A VKW 8-chloranyl-2-[3-[4-(1,5-dimethylimidazol-2-yl)piperazin-1-yl]propyl]-3~{H}-quinazolin-4-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M PCTP pH 9.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.213
7ONS PARP1 catalytic domain in complex with isoquinolone-based inhibitor (compound 16) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A VKT 7-[[4-(1,5-dimethylimidazol-2-yl)piperazin-1-yl]methyl]-3-ethyl-1~{H}-quinolin-2-one × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.223
7ONS PARP1 catalytic domain in complex with isoquinolone-based inhibitor (compound 16) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A VKT 7-[[4-(1,5-dimethylimidazol-2-yl)piperazin-1-yl]methyl]-3-ethyl-1~{H}-quinolin-2-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.223
7ONT PARP1 catalytic domain in complex with a selective pyridine carboxamide-based inhibitor (compound 22) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A VKQ 5-[4-[(3-ethyl-2-oxidanylidene-1~{H}-quinolin-7-yl)methyl]piperazin-1-yl]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
7ONT PARP1 catalytic domain in complex with a selective pyridine carboxamide-based inhibitor (compound 22) 提交 2021-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
突变：V762A VKQ 5-[4-[(3-ethyl-2-oxidanylidene-1~{H}-quinolin-7-yl)methyl]piperazin-1-yl]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；2.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
7S68 Structure of human PARP1 domains (Zn1, Zn3, WGR and HD) bound to a DNA double strand break. 提交 2021-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–95（95 aa）
链 A 206–366（161 aa）
链 B 527–786（260 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 8000, ethylene glycol, HEPES pH 7.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.292
7S6H Human PARP1 deltaV687-E688 bound to NAD+ analog EB-47 and to a DNA double strand break. 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–95（95 aa）
链 A 206–366（161 aa）
链 B 518–1014（497 aa）
突变：DeltaV687-E688 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 6000, MES pH 6.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.251
7S6H Human PARP1 deltaV687-E688 bound to NAD+ analog EB-47 and to a DNA double strand break. 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–95（95 aa）
链 C 206–366（161 aa）
链 D 518–1014（497 aa）
突变：DeltaV687-E688 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 6000, MES pH 6.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.251
7S6M Human PARP1 deltaV687-E688 bound to a DNA double strand break. 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–95（95 aa）
链 C 206–366（161 aa）
链 D 518–1014（497 aa）
突变：deltaV687-E688 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 6000, MES pH 6.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.239
7S6M Human PARP1 deltaV687-E688 bound to a DNA double strand break. 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–95（95 aa）
链 A 206–366（161 aa）
链 B 518–1014（497 aa）
突变：deltaV687-E688 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 6000, MES pH 6.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.239
7S81 Structure of human PARP1 domains (Zn1, Zn3, WGR, HD) bound to a DNA double strand break. 提交 2021-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 I 1–96（96 aa） 片段：first zinc finger (Zn1)
链 J 216–366（151 aa） 片段：third zinc finger (Zn3)
链 K 527–786（260 aa） 片段：WGR domain and helical domain (HD)
链 N 1–96（96 aa） 片段：first zinc finger (Zn1)
链 O 216–366（151 aa） 片段：third zinc finger (Zn3)
链 P 527–786（260 aa） 片段：WGR domain and helical domain (HD)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tert-butanol, Tris pH 8.5
分辨率 3.60 Å R-free 0.312
7S81 Structure of human PARP1 domains (Zn1, Zn3, WGR, HD) bound to a DNA double strand break. 提交 2021-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–96（96 aa） 片段：first zinc finger (Zn1)
链 B 216–366（151 aa） 片段：third zinc finger (Zn3)
链 C 527–786（260 aa） 片段：WGR domain and helical domain (HD)
链 F 1–96（96 aa） 片段：first zinc finger (Zn1)
链 G 216–366（151 aa） 片段：third zinc finger (Zn3)
链 H 527–786（260 aa） 片段：WGR domain and helical domain (HD)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tert-butanol, Tris pH 8.5
分辨率 3.60 Å R-free 0.312
7SCY Nuc147 bound to single BRCT 提交 2021-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 385–492（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7SCZ Nuc147 bound to multiple BRCTs 提交 2021-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 K 385–492（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8FYY Crystal structure of human PARP1 ART domain bound to inhibitor UKTT5 (compound 10) 提交 2023-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–677（17 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 YH0 2-(4-{[2-(1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]carbamoyl}phenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.273
8FYZ Crystal structure of human PARP1 ART domain bound to inhibitor UKTT10 (compound 13) 提交 2023-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–677（17 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 CIT CITRIC ACID × 1 YNQ (2P)-2-{3-[(4R)-3-(trifluoromethyl)-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine-7(8H)-carbonyl]phenyl}-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate
分辨率 3.40 Å R-free 0.267
8FYZ Crystal structure of human PARP1 ART domain bound to inhibitor UKTT10 (compound 13) 提交 2023-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–677（17 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
链 B 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 YNQ (2P)-2-{3-[(4R)-3-(trifluoromethyl)-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine-7(8H)-carbonyl]phenyl}-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate
分辨率 3.40 Å R-free 0.267
8FZ1 Crystal structure of human PARP1 ART domain bound to inhibitor UKTT22 (compound 14) 提交 2023-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 661–677（17 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 YVB (2P)-2-{3-[(2-amino-4,5-dimethylphenyl)carbamoyl]phenyl}-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
8FZ1 Crystal structure of human PARP1 ART domain bound to inhibitor UKTT22 (compound 14) 提交 2023-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 661–677（17 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
链 B 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain,ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 YVB (2P)-2-{3-[(2-amino-4,5-dimethylphenyl)carbamoyl]phenyl}-1H-benzimidazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3000, 0.1 M sodium citrate pH 5.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
8G0H Human PARP1 deltaV687-E688 bound to UKTT5 (compound 10) and to a DNA double strand break. 提交 2023-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–95（95 aa）
链 C 206–366（161 aa）
链 D 518–1014（497 aa）
未记录 YH0 2-(4-{[2-(1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]carbamoyl}phenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12% PEG6000 and 100 mM MES pH 6.5
分辨率 3.80 Å R-free 0.306
8G0H Human PARP1 deltaV687-E688 bound to UKTT5 (compound 10) and to a DNA double strand break. 提交 2023-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–95（95 aa）
链 A 206–366（161 aa）
链 B 518–1014（497 aa）
未记录 YH0 2-(4-{[2-(1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]carbamoyl}phenyl)-1H-benzimidazole-7-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12% PEG6000 and 100 mM MES pH 6.5
分辨率 3.80 Å R-free 0.306
8HE7 ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2022-11-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 1WI 1-[[4-fluoranyl-3-(3-oxidanylidene-4-pentan-3-yl-piperazin-1-yl)carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.5 M (NH4)2SO4, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.250
8HE7 ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to a quinazoline-2,4(1H,3H)-dione inhibitor 提交 2022-11-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 1WI 1-[[4-fluoranyl-3-(3-oxidanylidene-4-pentan-3-yl-piperazin-1-yl)carbonyl-phenyl]methyl]quinazoline-2,4-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.5 M (NH4)2SO4, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.250
8HLR Human ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to Fluzoparib (SHR3162) 提交 2022-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 25I Fluzoparib × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
8HLR Human ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to Fluzoparib (SHR3162) 提交 2022-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 25I Fluzoparib × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
8JNZ Human ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to a pyrazolopyrimidine carboxamide inhibitor 提交 2023-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 ERV 6-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.84 Å R-free 0.278
8JNZ Human ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to a pyrazolopyrimidine carboxamide inhibitor 提交 2023-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 ERV 6-methylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine-3-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.84 Å R-free 0.278
8U4W The crystal structure of a helical domain deleted PARP1 in complex with isoindolinone based inhibitor. 提交 2023-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–677（16 aa）
链 A 788–1011（224 aa）
突变：Y829H 突变：Y829H VHU (4M)-4-(2-{4-[(3S)-1-acetylpiperidine-3-carbonyl]piperazine-1-carbonyl}-1-benzofuran-7-yl)-1H-isoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；35% PEG2000 MME, 0.2M KSC and 0.1M HEPES pH 7.0
分辨率 3.02 Å R-free 0.292
8U4W The crystal structure of a helical domain deleted PARP1 in complex with isoindolinone based inhibitor. 提交 2023-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–677（16 aa）
链 B 788–1011（224 aa）
突变：Y829H 突变：Y829H VHU (4M)-4-(2-{4-[(3S)-1-acetylpiperidine-3-carbonyl]piperazine-1-carbonyl}-1-benzofuran-7-yl)-1H-isoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；35% PEG2000 MME, 0.2M KSC and 0.1M HEPES pH 7.0
分辨率 3.02 Å R-free 0.292
8U4W The crystal structure of a helical domain deleted PARP1 in complex with isoindolinone based inhibitor. 提交 2023-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 662–677（16 aa）
链 C 788–1011（224 aa）
突变：Y829H 突变：Y829H VHU (4M)-4-(2-{4-[(3S)-1-acetylpiperidine-3-carbonyl]piperazine-1-carbonyl}-1-benzofuran-7-yl)-1H-isoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；35% PEG2000 MME, 0.2M KSC and 0.1M HEPES pH 7.0
分辨率 3.02 Å R-free 0.292
8U4W The crystal structure of a helical domain deleted PARP1 in complex with isoindolinone based inhibitor. 提交 2023-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 662–677（16 aa）
链 D 788–1011（224 aa）
突变：Y829H 突变：Y829H VHU (4M)-4-(2-{4-[(3S)-1-acetylpiperidine-3-carbonyl]piperazine-1-carbonyl}-1-benzofuran-7-yl)-1H-isoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；35% PEG2000 MME, 0.2M KSC and 0.1M HEPES pH 7.0
分辨率 3.02 Å R-free 0.292
8VYH Crystal Structure Analysis of PARP1 in complex with a compound 提交 2024-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 660–1011（352 aa） 片段：residues 660-1011
未记录 A1AEO (4S)-1-{2-fluoro-5-[(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)methyl]benzoyl}-4-hydroxy-L-proline × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG-4000, 200 mM Lithium sulfate, 100 mM Tris, pH 8.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.250
8VYH Crystal Structure Analysis of PARP1 in complex with a compound 提交 2024-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 660–1011（352 aa） 片段：residues 660-1011
未记录 A1AEO (4S)-1-{2-fluoro-5-[(4-oxo-3,4-dihydrophthalazin-1-yl)methyl]benzoyl}-4-hydroxy-L-proline × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG-4000, 200 mM Lithium sulfate, 100 mM Tris, pH 8.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.250
9BPY Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analogs benzamide adenine dinucleotide and carba-NAD+ 提交 2024-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 CNA CARBA-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PARP1 ART (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.258
9BPY Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analogs benzamide adenine dinucleotide and carba-NAD+ 提交 2024-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PARP1 ART (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.258
9BPY Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analogs benzamide adenine dinucleotide and carba-NAD+ 提交 2024-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PARP1 ART (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.258
9BPY Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analogs benzamide adenine dinucleotide and carba-NAD+ 提交 2024-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PARP1 ART (30 mg/ml) was crystallized in the presence of 1.6 mM BAD in 24 to 29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.258
9CKC Crystal structure of SMYD2 in complex with two PARP1 peptides 提交 2024-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 522–534（13 aa）
链 E 522–534（13 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 100 mM Tris pH 7.5, 5% ethanol, 1 mM PARP1 peptide, 0.6 mM AdoHcy
分辨率 2.10 Å R-free 0.208
9CKC Crystal structure of SMYD2 in complex with two PARP1 peptides 提交 2024-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 522–534（13 aa）
链 F 522–534（13 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 100 mM Tris pH 7.5, 5% ethanol, 1 mM PARP1 peptide, 0.6 mM AdoHcy
分辨率 2.10 Å R-free 0.208
9DMC Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide and ADP-ribose 提交 2024-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain, residues 788-1012
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
9DMC Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide and ADP-ribose 提交 2024-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain, residues 788-1012
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
9DMC Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide and ADP-ribose 提交 2024-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain, residues 788-1012
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
9DMC Human PARP1 ART domain bound to NAD+ analog benzamide adenine dinucleotide and ADP-ribose 提交 2024-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 788–1012（225 aa） 片段：ADP-ribosyltransferase (ART) domain, residues 788-1012
未记录 DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；29% PEG 3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
9ETQ Crystal structure of PARP1 catalytic domain bound to AZD5305 (SARUPARIB) 提交 2024-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 A1H63 5-[4-[(7-ethyl-6-oxidanylidene-5~{H}-1,5-naphthyridin-3-yl)methyl]piperazin-1-yl]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.4-2.9 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.59 Å R-free 0.217
9ETQ Crystal structure of PARP1 catalytic domain bound to AZD5305 (SARUPARIB) 提交 2024-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa） 片段：catalytic domain (662-1101)
未记录 A1H63 5-[4-[(7-ethyl-6-oxidanylidene-5~{H}-1,5-naphthyridin-3-yl)methyl]piperazin-1-yl]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.4-2.9 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.59 Å R-free 0.217
9ETR Crystal structure of PARP1 catalytic domain bound to AZD9574 提交 2024-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 A1H64 6-fluoranyl-5-[4-[(5-fluoranyl-2-methyl-3-oxidanylidene-4~{H}-quinoxalin-6-yl)methyl]piperazin-1-yl]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.4-2.9 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.82 Å R-free 0.252
9ETR Crystal structure of PARP1 catalytic domain bound to AZD9574 提交 2024-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 A1H64 6-fluoranyl-5-[4-[(5-fluoranyl-2-methyl-3-oxidanylidene-4~{H}-quinoxalin-6-yl)methyl]piperazin-1-yl]-~{N}-methyl-pyridine-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；2.4-2.9 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.82 Å R-free 0.252
9ILN ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to a pyrimidine 2,4-diketone derivative inhibitor 提交 2024-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 662–1011（350 aa）
未记录 A1D9M 5-ethyl-1-[[3-[(3~{R})-4-ethyl-3-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]carbonyl-4-fluoranyl-phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.49 Å R-free 0.250
9ILN ADP-ribosyltransferase 1 (PARP1) catalytic domain bound to a pyrimidine 2,4-diketone derivative inhibitor 提交 2024-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 662–1011（350 aa）
未记录 A1D9M 5-ethyl-1-[[3-[(3~{R})-4-ethyl-3-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]carbonyl-4-fluoranyl-phenyl]methyl]pyrimidine-2,4-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；2.5 M ammonium sulfate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5
分辨率 2.49 Å R-free 0.250
9MI8 Human PARP1 N-terminal domains bound to nicked DNA 提交 2024-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1014（1014 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MJA PARP1 ART in complex with HPF1 and EB47 提交 2024-12-14 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1014（1014 aa）
未记录 UHB 2-[4-[(2S,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]carbonylpiperazin-1-yl]-N-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-4-yl)ethanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9UMC Human poly ADP-ribose polymerase(PARP-1 )zinc finger 1 bound to 13bp DNA 提交 2025-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 5–96（92 aa）
链 B 5–96（92 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；4M Sodium Formate
分辨率 2.60 Å R-free 0.258
9UMF Human poly ADP-ribose polymerase(PARP-1 )zinc finger 1 bound to 17bp DNA 提交 2025-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 5–91（87 aa） 片段：zinc finger 1
链 B 5–91（87 aa） 片段：zinc finger 1
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；100mM Tris-HCl pH 8.5, 200mM NaCl, 25% PEG3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.240

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 PARP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 27–253； UniProt 788–1014

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6m3i

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6m3i
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6m3i
沉积日期 deposition_date2020-03-03
结构标题 titleCrystal structure of HPF1/PARP1 complex
关键词 keywordscomplex, ADP-ribosylation, DNA damage response, NUCLEAR PROTEIN; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier29.42 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron29.22 Å
零角强度 I(0) i059384800.00
分子量 molecular_weight62009.0 kDa
排除体积 excluded_volume78250 ų
包络体积 envelope_volume96056 ų
水化壳体积 shell_volume28849 ų
包络直径 envelope_diameter106.2 Å
壳层 Rg shell_rg34.63 Å
包络 Rg envelope_rg29.53 Å
形状 Rg shape_rg29.20 Å
总 Rg total_rg29.83 Å
总原子数 total_atoms4376
残基数 n_residues550
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax100.0 Å
Rg (实空间) rg_real29.64 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.79 Å
I(0) (实空间) i0_real5.9380e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.0880e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal29.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal59380000.0000
解质量估计 total_estimate0.8399
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary27.8 Å
偏度 Skewness skewness0.539
峰度 Kurtosis kurtosis-0.308
角度范围 angular_range— – 0.2700 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha26700000.0000
实空间数据点数 n_real_points55
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.743; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.855; Smooth: 0.831
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)