6ox0

SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 118.2 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin Peptide

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 66–80	片段：residues 66-80	Histone-lysine N-methyltransferase setd3 × 1 （Q86TU7） SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.75 Å R-free 0.225
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 Z； UniProt 66–80	片段：residues 66-80	Histone-lysine N-methyltransferase setd3 × 1 （Q86TU7） SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.75 Å R-free 0.225

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6OX0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
21VV Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome 提交 2025-12-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 J 1–375（375 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8.0, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 2 mM DTT, 0.5 mM ADP, 8 mM NaF, 1 mM BeSO4. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 170–178（9 aa）片段：sequence database residues 170-178	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3D2U Structure of UL18, a Peptide-Binding Viral MHC Mimic, Bound to a Host Inhibitory Receptor 提交 2008-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 170–178（9 aa）片段：sequence database residues 170-178	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.4 M Mg(NO3)2, and 16~22% (w/v) PEG 33500, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.21 Å R-free 0.259
3J82 Electron cryo-microscopy of DNGR-1 in complex with F-actin 提交 2014-09-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.70 Å
3LUE Model of alpha-actinin CH1 bound to F-actin 提交 2010-02-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）链 G 2–375（374 aa）链 H 2–375（374 aa）链 I 2–375（374 aa）链 J 2–375（374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.00 Å
6ANU Cryo-EM structure of F-actin complexed with the beta-III-spectrin actin-binding domain 提交 2017-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）链 E 1–375（375 aa）链 F 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 66–88（23 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 66–88（23 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 66–88（23 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 66–88（23 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 66–88（23 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate	分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 66–88（23 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate	分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric	链 K 1–375（375 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–80（15 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 66–80（15 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBL SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, Second P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6NBW Ternary Complex of Beta/Gamma-Actin with Profilin and AnCoA-NAA80 提交 2018-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 GOL GLYCEROL × 2 SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；15% PEG 3350, 50mM MES pH6.2, 50mM NH4NO3	分辨率 2.50 Å R-free 0.209
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 66–80（15 aa）片段：residues 66-80	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX5 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 66–83（18 aa）	突变：H73K	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.10 Å R-free 0.205
7AS4 Recombinant human gTuRC 提交 2020-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric	链 7 2–375（374 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.13 Å
7P1H Structure of the V. vulnificus ExoY-G-actin-profilin complex 提交 2021-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 4–375（372 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric	链 P 1–375（375 aa）	未记录	BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7W28 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-4PyrAla73 peptide 提交 2021-11-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 66–81（16 aa）片段：SAH	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；30%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris base/Hydrochloric acid 8.5, 0.2M Lithium sulfate.	分辨率 1.79 Å R-free 0.211
7W29 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-Orn73 peptide 提交 2021-11-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 66–81（16 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；20%(w/v) PEG6000, 0.1M Bicine/Sodium hydroxide 9.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.279
8COG Human arginylated beta-actin 提交 2023-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；Actin for EM was polymerized by mixing, 20 ul 20 uM G-actin, 8 ul 10x MKE and 52 ul 5 mM HEPES-KOH pH 7.4 containing 0.2 mM ATP and 0.5 mM DTT and incubating at RT for 1 hour. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
8DNH Cryo-EM structure of nonmuscle beta-actin 提交 2022-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.99 Å
8OI8 Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the R183W mutation 提交 2023-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）链 E 1–375（375 aa）	突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：R183W, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
8OID Cryo-EM structure of ADP-bound, filamentous beta-actin harboring the N111S mutation 提交 2023-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）链 E 1–375（375 aa）	突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：N111S, C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1x KMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA) supplemented with 0.02% Tween20 (v/v) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.30 Å
8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric	链 B 1–375（375 aa）链 G 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8RTT Structure of the formin Cdc12 bound to the barbed end of phalloidin-stabilized F-actin. 提交 2024-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.56 Å
8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 6.25 Å
8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.49 Å
8VRD Rigid body fitted model for free recombinant gamma tubulin ring complex. 提交 2024-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 S 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å
8VRJ Rigid body fitted model for gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 9 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.70 Å
8VRK Rigid body fitted model for refined density map of gamma tubulin ring complex capped microtubule 提交 2024-01-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 9 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.50 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 S 1–375（375 aa）链 U 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 S 1–375（375 aa）链 U 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric	链 S 1–375（375 aa）链 U 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 K 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9B2Z Actin-bound Legionella pneumophila AMPylase LnaB with AMPylated catalytic histidine 提交 2024-03-18	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–375（375 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 LAB LATRUNCULIN B × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
9B7J Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 H 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
9B85 Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1 提交 2024-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric	链 H 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 J 1–375（375 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
9C62 P400 subcomplex of the native human TIP60 complex 提交 2024-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 J 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.28 Å
9C6N ARP module of the human TIP60 complex 提交 2024-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–375（375 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric	链 K 1–375（375 aa）链 L 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 L 1–375（375 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
9FJM Cryo-EM structure of the phalloidin-bound pointed end of the actin filament. 提交 2024-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.	分辨率 3.65 Å
9GXI Subtomogram average of fascin-actin complex 提交 2024-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）链 E 1–375（375 aa）链 F 1–375（375 aa）链 G 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.00 Å
9I8G Inwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric	链 U 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 22.40 Å
9I8H Outwards conformation' of the human gamma-TuRC from purified centrosomes obtained by rigid body docking 提交 2025-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric	链 U 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 23.20 Å
9P1I Atomic structure of vibrio effector fragment VopV bound to Beta-cytoplasmic/gamma1-cytoplasmic F-actin 提交 2025-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 Q 1–375（375 aa）链 R 1–375（375 aa）链 S 1–375（375 aa）链 T 1–375（375 aa）链 U 1–375（375 aa）链 V 1–375（375 aa）链 W 1–375（375 aa）链 X 1–375（375 aa）链 Y 1–375（375 aa）链 Z 1–375（375 aa）链 a 1–375（375 aa）链 b 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 12 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9QEW Cryo-EM structure of the undecorated actin filament in the ADP-Pi state. 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.18 Å
9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.74 Å
9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.42 Å
9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）链 G 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.74 Å
9QFD Cryo-EM structure of the fully cofilin-1-decorated actin filament (cofilactin) 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）链 G 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.61 Å
9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）链 G 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.12 Å
9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）链 G 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.49 Å
9QFJ Cryo-EM structure of the cofilactin filament core at 2.3 Angstrom resolution. 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.31 Å
9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）链 G 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20). cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.99 Å
9QFO Cryo-EM structure of the cofilactin filament pointed end 提交 2025-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）链 F 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.96 Å
9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.76 Å
9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 2–375（374 aa）链 B 2–375（374 aa）链 C 2–375（374 aa）链 D 2–375（374 aa）链 E 2–375（374 aa）	突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C272A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.16 Å
9QVM Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 Z 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.80 Å
9QVN Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein bound to the gamma-tubulin ring complex 提交 2025-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 Z 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 K 1–375（375 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 K 1–375（375 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric	链 K 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 K 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9UXA local ARP-NCP structure of the ncBAF-nucleosome complex in the apo state 提交 2025-05-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 I 2–375（374 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
9UXB The apo structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–375（374 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.92 Å
9UXC The ADP-bound structure of BCL7B-containing ARP module of the human SWI/SNF complex 提交 2025-05-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–375（374 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.74 Å
9WBZ The structure of NCP-motor-ARP module of ncBAF-nucleosome complex 提交 2025-08-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 L 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9WC1 The structure of ARP module in ncBAF complex 提交 2025-08-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 72 个其他 PDB 条目、82 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–15； UniProt 66–80 作者链 Z； PDB构建体 1–15； UniProt 66–80

Histone-lysine N-methyltransferase setd3

Homo sapiens

UniProt Q86TU7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–594	未记录	Actin Peptide × 1 （P60709） SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.75 Å R-free 0.225
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–594	未记录	Actin Peptide × 1 （P60709） SFG SINEFUNGIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.75 Å R-free 0.225

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6OX0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3SMT Crystal structure of human SET domain-containing protein3 提交 2011-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–498（497 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ARS ARSENIC × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 ACT ACETATE ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；20 % PEG4000, 0.2 M calcium Acetate, 0.1 M sodium cacodalyte, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 2.04 Å R-free 0.259
3SMT Crystal structure of human SET domain-containing protein3 提交 2011-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–498（497 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 ARS ARSENIC × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 ACT ACETATE ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 22	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；20 % PEG4000, 0.2 M calcium Acetate, 0.1 M sodium cacodalyte, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 2.04 Å R-free 0.259
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–503（503 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–503（503 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–503（503 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICT Structure of SETD3 bound to SAH and methylated actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–503（503 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Magnesium acetate tetrahydrate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 20% Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.95 Å R-free 0.214
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–503（503 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate	分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6ICV Structure of SETD3 bound to SAH and unmodified actin 提交 2018-09-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–503（503 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5 2% Polyethylene glycol 400 2.0M Ammonium sulfate	分辨率 2.15 Å R-free 0.205
6JAT Crystal structure of SETD3 bound to Actin peptide and SFG 提交 2019-01-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–498（498 aa）片段：SETD3 protein	未记录	SFG SINEFUNGIN × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M HEPES/Sodium hydroxide, 0.2 M Ammonium sulfate, 20% PEG 8000, 10% 2-propanol	分辨率 2.71 Å R-free 0.243
6JAT Crystal structure of SETD3 bound to Actin peptide and SFG 提交 2019-01-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–498（498 aa）片段：SETD3 protein	未记录	SFG SINEFUNGIN × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M HEPES/Sodium hydroxide, 0.2 M Ammonium sulfate, 20% PEG 8000, 10% 2-propanol	分辨率 2.71 Å R-free 0.243
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBJ SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, P21 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBK SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, First P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 1.69 Å R-free 0.243
6MBL SETD3, a Histidine Methyltransferase, in Complex with an Actin Peptide and SAH, Second P212121 Crystal Form 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Target Histidine Partially Methylated 提交 2019-05-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.95 Å R-free 0.201
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX2 SETD3in Complex with an Actin Peptide with the Target Histidine Fully Methylated 提交 2019-05-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.09 Å R-free 0.239
6OX3 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.78 Å R-free 0.246
6OX3 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.78 Å R-free 0.246
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	突变：N255A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX4 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	突变：N255A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.29 Å R-free 0.236
6OX5 A SETD3 Mutant (N255A) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-05-13	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	突变：N255A	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.10 Å R-free 0.205
6V62 SETD3 double mutant (N255F/W273A) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Lysine 提交 2019-12-04	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	突变：N255F, W273A	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.36 Å R-free 0.252
6V63 SETD3 WT in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Glutamine 提交 2019-12-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.199
6V63 SETD3 WT in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Glutamine 提交 2019-12-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.199
6WK1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–594（594 aa）链 B 1–594（594 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 46 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.228
6WK1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 27 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.228
6WK1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.89 Å R-free 0.228
6WK2 SETD3 mutant (N255V) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–594（594 aa）链 D 1–594（594 aa）	突变：N255V 突变：N255V	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.76 Å R-free 0.206
6WK2 SETD3 mutant (N255V) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	突变：N255V	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.76 Å R-free 0.206
6WK2 SETD3 mutant (N255V) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–594（594 aa）	突变：N255V	SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000	分辨率 1.76 Å R-free 0.206
7LMS Structure of human SetD3 methyl-transferase in complex with 2A protease from Coxsackievirus B3 提交 2021-02-05	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–594（593 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7W28 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-4PyrAla73 peptide 提交 2021-11-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–498（498 aa）片段：SETD3	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；30%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris base/Hydrochloric acid 8.5, 0.2M Lithium sulfate.	分辨率 1.79 Å R-free 0.211
7W29 Crystal Structure of SETD3-SAH in complex with betaA-Orn73 peptide 提交 2021-11-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–498（498 aa）片段：SETD3	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；289 K；20%(w/v) PEG6000, 0.1M Bicine/Sodium hydroxide 9.0	分辨率 2.90 Å R-free 0.279
8X77 Enterovirus proteinase with host factor 提交 2023-11-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.02M Citric acid, 0.08M BIS-TRIS propane, pH8.8, 16% PEG 3350	分辨率 3.52 Å R-free 0.291
8X77 Enterovirus proteinase with host factor 提交 2023-11-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–594（594 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.02M Citric acid, 0.08M BIS-TRIS propane, pH8.8, 16% PEG 3350	分辨率 3.52 Å R-free 0.291
8X77 Enterovirus proteinase with host factor 提交 2023-11-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–594（594 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.02M Citric acid, 0.08M BIS-TRIS propane, pH8.8, 16% PEG 3350	分辨率 3.52 Å R-free 0.291
8X77 Enterovirus proteinase with host factor 提交 2023-11-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.02M Citric acid, 0.08M BIS-TRIS propane, pH8.8, 16% PEG 3350	分辨率 3.52 Å R-free 0.291
8X8Q Structure of enterovirus protease in complex host factor 提交 2023-11-28	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.14 Å

共 21 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SETD3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–599； UniProt 1–594 作者链 B； PDB构建体 6–599； UniProt 1–594

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ox0
沉积日期 deposition_date	2019-05-13
结构标题 title	SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor
关键词 keywords	TRANSFERASE, TRANSFERASE-STRUCTURAL PROTEIN complex; TRANSFERASE/STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	34.51 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.25 Å
零角强度 I(0) i0	197738000.00
分子量 molecular_weight	114860.0 kDa
排除体积 excluded_volume	144480 Å³
包络体积 envelope_volume	180990 Å³
水化壳体积 shell_volume	45084 Å³
包络直径 envelope_diameter	127.1 Å
壳层 Rg shell_rg	39.59 Å
包络 Rg envelope_rg	34.62 Å
形状 Rg shape_rg	34.22 Å
总 Rg total_rg	34.75 Å
总原子数 total_atoms	8100
残基数 n_residues	994
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	118.2 Å
Rg (实空间) rg_real	34.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.88 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.9770e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.2710e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	34.54 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	197700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8658
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	41.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.482
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.110
角度范围 angular_range	— – 0.2300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	35950000.0000
实空间数据点数 n_real_points	47
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.775; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.937

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin Peptide
分子量 formula_weight	1788.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,Z
原子数 atom_count	8858

TLKYPIEHGIVTNWD

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone-lysine N-methyltransferase setd3
分子量 formula_weight	67753.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.85
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B

GPLGSMGKKSRVKTQKSGTGATATVSPKEILNLTSELLQKCSSPAPGPGKEWEEYVQIRTLVEKIRKKQKGLSVTFDGKREDYFPDLMKWASENGASVEGFEMVNFKEEGFGLRATRDIKAEELFLWVPRKLLMTVESAKNSVLGPLYSQDRILQAMGNIALAFHLLCERASPNSFWQPYIQTLPSEYDTPLYFEEDEVRYLQSTQAIHDVFSQYKNTARQYAYFYKVIQTHPHANKLPLKDSFTYEDYRWAVSSVMTRQNQIPTEDGSRVTLALIPLWDMCNHTNGLITTGYNLEDDRCECVALQDFRAGEQIYIFYGTRSNAEFVIHSGFFFDNNSHDRVKIKLGVSKSDRLYAMKAEVLARAGIPTSSVFALHFTEPPISAQLLAFLRVFCMTEEELKEHLLGDSAIDRIFTLGNSEFPVSWDNEVKLWTFLEDRASLLLKTYKTTIEEDKSVLKNHDLSVRAKMAIKLRLGEKEILEKAVKSAAVNREYYRQQMEEKAPLPKYEESNLGLLESSVGDSRLPLVLRNLEEEAGVQDALNIREAISKAKATENGLVNGENSIPNGTRSENESLNQESKRAVEDAKGSSSDSTAGVKE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SINEFUNGIN
分子量 formula_weight	381.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	29

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	645

▶

8. 引用文献 (2)

▶

晶胞边长 a length_a	60.265 Å
晶胞边长 b length_b	175.194 Å
晶胞边长 c length_c	66.031 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.80 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.755 Å
最低分辨率 resolution_low	36.486 Å
R 因子 r_factor	0.2065
R_work r_work	0.2062
R_free r_free	0.2249

fit	/app/data/saxs_computation/ox/6ox0/6ox0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ox/6ox0/6ox0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ox/6ox0/6ox0.dat

SETD3 in Complex with an Actin Peptide with Sinefungin Replacing SAH as Cofactor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin Peptide

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone-lysine N-methyltransferase setd3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)