6pbk

Archaellum periplasmic stator protein complex FlaF and FlaG from Sulfolobus acidocaldarius

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Saci FlaG soluble domain

Sulfolobus acidocaldarius (strain ATCC 33909 / DSM 639 / JCM 8929 / NBRC 15157 / NCIMB 11770)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Conserved flagellar protein F × 2 （Q4J9K8） DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 SODIUM ION × 3 1,2-ETHANEDIOL × 2 IMIDAZOLE × 3 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q4J9K7_SULAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 16–135； UniProt 32–151 作者链 C； PDB构建体 16–135； UniProt 32–151

Conserved flagellar protein F

Sulfolobus acidocaldarius (strain ATCC 33909 / DSM 639 / JCM 8929 / NBRC 15157 / NCIMB 11770)

UniProt Q4J9K8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Saci FlaG soluble domain × 2 （Q4J9K7） DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 SODIUM ION × 3 1,2-ETHANEDIOL × 2 IMIDAZOLE × 3 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q4J9K8_SULAC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 17–146； UniProt 35–164 作者链 D； PDB构建体 17–146； UniProt 35–164

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6pbk
沉积日期 deposition_date	2019-06-14
结构标题 title	Archaellum periplasmic stator protein complex FlaF and FlaG from Sulfolobus acidocaldarius
关键词 keywords	beta-sandwich fold Archaellum assembly subunit Stator protein, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6pbk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6pbk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6pbk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.43 Å
Rg（电子密度）	24.49 Å
总 Rg	25.27 Å
原子数	3908
残基数	490
排除体积	69848 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6pbk__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Saci FlaG soluble domain
分子量 formula_weight	14971.5 kDa
突变 mutation	V118K
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	4073

MGSSHHHHHHSQDPNSISTTMSSYSIQQSQKMLTQLQIDYATNTSSNTVVAYLHNVGETTISYLQNSVVYFGPNGQLQPVGYNSGSSPYWTVTSNSLQPGSKVKIIIYLSSPLSSNQYYTIQIVTPNGYTVSYMF

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus acidocaldarius (strain ATCC 33909 / DSM 639 / JCM 8929 / NBRC 15157 / NCIMB 11770)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	330779
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Conserved flagellar protein F
分子量 formula_weight	16248.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MGSSHHHHHHSQDPNSNQAQELNHELELEQLETKITVSSVSLTGSTLNVVLENNGSTNLYDFQGFSVIVQYYANISNISTFNLSLYNYTKNSNPSPYYWTINTPLLAPGSQATLTIILPYPPYPNTQATVVIVTNYGPSVIWRGSL

来源 Source

来源生物 organism	Sulfolobus acidocaldarius (strain ATCC 33909 / DSM 639 / JCM 8929 / NBRC 15157 / NCIMB 11770)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	330779
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	IMIDAZOLE
分子量 formula_weight	69.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	147

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晶胞边长 a length_a	120.038 Å
晶胞边长 b length_b	120.038 Å
晶胞边长 c length_c	152.138 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 61
空间群编号 int_tables_number	169
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.805 Å
最低分辨率 resolution_low	39.292 Å
R 因子 r_factor	0.1728
R_work r_work	0.1713
R_free r_free	0.2021

Archaellum periplasmic stator protein complex FlaF and FlaG from Sulfolobus acidocaldarius

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Saci FlaG soluble domain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Conserved flagellar protein F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6pbk__assembly_1__model_1

6pbk__assembly_1__model_1 | I(q)

6pbk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)

Archaellum periplasmic stator protein complex FlaF and FlaG from Sulfolobus acidocaldarius

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Saci FlaG soluble domain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Conserved flagellar protein F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6pbk__assembly_1__model_1

6pbk__assembly_1__model_1 | I(q)

6pbk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)