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6pe5

Yeast Vo motor in complex with 2 VopQ molecules

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 168.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform

物种未注明

UniProt P32563

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–840 未记录 V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2NVJ NMR structures of transmembrane segment from subunit a from the yeast proton V-ATPase 提交 2006-11-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 720–744（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 303 K；压力 ambient
NMR样品组成 2mM sMTM7 peptide (natural abundance labeling); 100% d6-DMSO | 100% d6-DMSO
分辨率未提供
2RPW Structure of a peptide derived from H+-V-ATPase subunit a 提交 2008-11-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 728–748（21 aa） 片段：TM7, UNP residues 728-748
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 1mM KMTM7, 250mM [U-100% 2H] SDS, 10mM sodium phosphate, 0.3mM DSS, 10% D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3J9T Yeast V-ATPase state 1 提交 2015-02-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 b 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 6.90 Å
3J9U Yeast V-ATPase state 2 提交 2015-02-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 b 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 7.60 Å
3J9V Yeast V-ATPase state 3 提交 2015-02-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 b 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 8.30 Å
5I1M Yeast V-ATPase average of densities, a subunit segment 提交 2016-02-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 V 383–840（458 aa） 片段：a subunit (UNP residues 383-840)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
5TJ5 Atomic model for the membrane-embedded motor of a eukaryotic V-ATPase 提交 2016-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 400–829（430 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 micro M Bafilomycin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Modified for ethane/propane
分辨率 3.90 Å
5VOX Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 1) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 b 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
5VOY Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 2) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 b 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.90 Å
5VOZ Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 3) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 b 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.60 Å
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–840（840 aa）
突变：C-terminal calmodulin binding peptide 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6HH0 Yeast V-ATPase transmembrane helix 7 NMR structure in DPC micelles 提交 2018-08-24 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 728–748（21 aa） 片段：transmembrane helix 7
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 100 mM [U-99% 2H] Deuterated DPC, 50 mM potassium phosphate, 0.02 % sodium azide, 1 mM 13C and 15N labeled aminoacids 8 and 12 TM7 peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 3–827（825 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 3–827（825 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 a 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 Q 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–840（840 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–840（840 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 a 1–840（840 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 a 1–840（840 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 a 1–840（840 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 a 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 a 1–840（840 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 A 1–840（840 aa）
突变：C-terminal calmodulin binding peptide 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 A 1–840（840 aa）
突变：C-terminal calmodulin binding peptide 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 A 1–840（840 aa）
突变：C-terminal calmodulin binding peptide 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 Q 1–840（840 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 Q 1–840（840 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 31 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VPH1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–840； UniProt 1–840

V0 assembly protein 1

物种未注明

UniProt P53262

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–265 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 212–263（52 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 212–263（52 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–265（265 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 N 1–265（265 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAT Yeast VO missing subunits a, e, and f in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 b 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 N 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 N 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 N 1–265（265 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 e 1–265（265 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 e 1–265（265 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VOA1_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–265； UniProt 1–265

V-type proton ATPase subunit d

物种未注明

UniProt P32366

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–345 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J9T Yeast V-ATPase state 1 提交 2015-02-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 6.90 Å
3J9U Yeast V-ATPase state 2 提交 2015-02-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 7.60 Å
3J9V Yeast V-ATPase state 3 提交 2015-02-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 8.30 Å
5TJ5 Atomic model for the membrane-embedded motor of a eukaryotic V-ATPase 提交 2016-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 P 4–155（152 aa）
链 P 176–201（26 aa）
链 P 284–341（58 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 micro M Bafilomycin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Modified for ethane/propane
分辨率 3.90 Å
5VOX Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 1) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 Q 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
5VOY Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 2) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 Q 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.90 Å
5VOZ Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 3) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 Q 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.60 Å
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 S 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 S 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 S 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAT Yeast VO missing subunits a, e, and f in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 d 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 B 1–345（345 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 S 1–345（345 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 S 1–345（345 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 32 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VA0D_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–345； UniProt 1–345

V-type proton ATPase subunit e

物种未注明

UniProt Q3E7B6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–73 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5TJ5 Atomic model for the membrane-embedded motor of a eukaryotic V-ATPase 提交 2016-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 5–61（57 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 micro M Bafilomycin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Modified for ethane/propane
分辨率 3.90 Å
5VOX Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 1) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 c 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
5VOY Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 2) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 c 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.90 Å
5VOZ Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 3) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 c 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.60 Å
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–71（71 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–71（71 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 d 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–73（73 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 M 1–73（73 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 e 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 M 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 M 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 M 1–73（73 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 d 1–73（73 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 d 1–73（73 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VA0E_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73

Uncharacterized protein YPR170W-B

物种未注明

UniProt P0C5R9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–85 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 7–75（69 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 7–75（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 1–85（85 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 O 1–85（85 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 O 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 O 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 O 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 f 1–85（85 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 YP17B_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–85； UniProt 1–85

;V-type proton ATPase subunit c'' ;

物种未注明

UniProt P23968

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–213 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5TJ5 Atomic model for the membrane-embedded motor of a eukaryotic V-ATPase 提交 2016-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 micro M Bafilomycin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Modified for ethane/propane
分辨率 3.90 Å
5VOX Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 1) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 R 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
5VOY Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 2) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 R 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.90 Å
5VOZ Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 3) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 R 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.60 Å
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 16–213（198 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 16–213（198 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 T 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 T 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 T 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–213（213 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–213（213 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAT Yeast VO missing subunits a, e, and f in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 c 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 C 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 C 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 C 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 T 1–213（213 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 T 1–213（213 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATO_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

;V-type proton ATPase subunit c' ;

物种未注明

UniProt P32842

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 1–164 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5TJ5 Atomic model for the membrane-embedded motor of a eukaryotic V-ATPase 提交 2016-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 17–163（147 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 micro M Bafilomycin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Modified for ethane/propane
分辨率 3.90 Å
5VOX Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 1) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 S 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
5VOY Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 2) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 S 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.90 Å
5VOZ Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 3) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 S 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.60 Å
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 7–164（158 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 7–164（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 U 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 U 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 U 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAT Yeast VO missing subunits a, e, and f in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 o 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 U 1–164（164 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 U 1–164（164 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATL2_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–164； UniProt 1–164

V-type proton ATPase subunit c

物种未注明

UniProt P25515

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 1–160 链 J； UniProt 1–160 链 K； UniProt 1–160 链 L； UniProt 1–160 链 M； UniProt 1–160 链 N； UniProt 1–160 链 O； UniProt 1–160 链 P； UniProt 1–160 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） Cation transporter × 2 （A0A0L7YPA6） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J9T Yeast V-ATPase state 1 提交 2015-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 R 1–160（160 aa）
链 S 1–160（160 aa）
链 T 1–160（160 aa）
链 U 1–160（160 aa）
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 6.90 Å
3J9U Yeast V-ATPase state 2 提交 2015-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 R 1–160（160 aa）
链 S 1–160（160 aa）
链 T 1–160（160 aa）
链 U 1–160（160 aa）
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 7.60 Å
3J9V Yeast V-ATPase state 3 提交 2015-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric
链 R 1–160（160 aa）
链 S 1–160（160 aa）
链 T 1–160（160 aa）
链 U 1–160（160 aa）
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside；pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0.02% w/v dodecylmaltoside
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 23 seconds before freezing；77 K；冷冻剂 OTHER；Blot for 23 seconds before freezing in ethane/propane mixture (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 8.30 Å
5TJ5 Atomic model for the membrane-embedded motor of a eukaryotic V-ATPase 提交 2016-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 9–158（150 aa）
链 F 9–158（150 aa）
链 G 9–158（150 aa）
链 H 9–158（150 aa）
链 I 9–158（150 aa）
链 J 9–158（150 aa）
链 M 9–158（150 aa）
链 N 9–158（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 micro M Bafilomycin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Modified for ethane/propane
分辨率 3.90 Å
5VOX Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 1) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 T 1–160（160 aa）
链 U 1–160（160 aa）
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.80 Å
5VOY Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 2) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 T 1–160（160 aa）
链 U 1–160（160 aa）
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.90 Å
5VOZ Yeast V-ATPase in complex with Legionella pneumophila effector SidK (rotational state 3) 提交 2017-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 T 1–160（160 aa）
链 U 1–160（160 aa）
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.60 Å
6C6L Yeast Vacuolar ATPase Vo in lipid nanodisc 提交 2018-01-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
链 G 1–160（160 aa）
链 H 1–160（160 aa）
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6M0R 2.7A Yeast Vo state3 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–159（159 aa）
链 F 1–159（159 aa）
链 G 1–159（159 aa）
链 H 1–159（159 aa）
链 I 1–159（159 aa）
链 J 1–159（159 aa）
链 K 1–159（159 aa）
链 L 1–159（159 aa）
未记录 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 30 PPV PYROPHOSPHATE × 1 EYR (6~{E},10~{E},14~{E},18~{E},22~{E},26~{E},30~{R})-2,6,10,14,18,22,26,30-octamethyldotriaconta-2,6,10,14,18,22,26-heptaene × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6M0S 3.6A Yeast Vo state3 prime 提交 2020-02-22 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–159（159 aa）
链 F 1–159（159 aa）
链 G 1–159（159 aa）
链 H 1–159（159 aa）
链 I 1–159（159 aa）
链 J 1–159（159 aa）
链 K 1–159（159 aa）
链 L 1–159（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6O7T Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Vph1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
6O7U Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-VO 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
6O7V Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 1 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.60 Å
6O7W Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 2 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 7.00 Å
6O7X Saccharomyces cerevisiae V-ATPase Stv1-V1VO State 3 提交 2019-03-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 8.70 Å
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
链 M 1–160（160 aa）
链 N 1–160（160 aa）
链 O 1–160（160 aa）
链 P 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7FDA CryoEM Structure of Reconstituted V-ATPase, state1 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
链 b 1–160（160 aa）
链 c 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7FDB CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase,State2 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
链 b 1–160（160 aa）
链 c 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7FDC CryoEM Structures of Reconstituted V-ATPase, state3 提交 2021-07-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
链 b 1–160（160 aa）
链 c 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7TAO Cryo-EM structure of bafilomycin A1 bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
链 G 1–160（160 aa）
链 H 1–160（160 aa）
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
未记录 WEV (5R)-2,4-dideoxy-1-C-{(2S,3R,4S)-3-hydroxy-4-[(2R,3S,4E,6E,9R,10S,11R,12E,14Z)-10-hydroxy-3,15-dimethoxy-7,9,11,13-tetramethyl-16-oxo-1-oxacyclohexadeca-4,6,12,14-tetraen-2-yl]pentan-2-yl}-4-methyl-5-propan-2-yl-alpha-D-threo-pentopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7TAP Cryo-EM structure of archazolid A bound to yeast VO V-ATPase 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
链 G 1–160（160 aa）
链 H 1–160（160 aa）
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
未记录 KJL Archazolid A × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7TMR V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 1 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
7TMS V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 2 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
7TMT V-ATPase from Saccharomyces cerevisiae, State 3 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.80 Å
8EAS Yeast VO in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8EAT Yeast VO missing subunits a, e, and f in complex with Vma12-22p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8EAU Yeast VO in complex with Vma21p 提交 2022-08-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 g 1–160（160 aa）
链 h 1–160（160 aa）
链 i 1–160（160 aa）
链 j 1–160（160 aa）
链 k 1–160（160 aa）
链 l 1–160（160 aa）
链 m 1–160（160 aa）
链 n 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9E76 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 1WVA25 提交 2024-10-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
链 G 1–160（160 aa）
链 H 1–160（160 aa）
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.40 Å
9E7L Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA7 提交 2024-11-02 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
链 G 1–160（160 aa）
链 H 1–160（160 aa）
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9MJ4 Yeast V-ATPase Vo proton channel bound to nanobody 2WVA149 提交 2024-12-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 E 1–160（160 aa）
链 F 1–160（160 aa）
链 G 1–160（160 aa）
链 H 1–160（160 aa）
链 I 1–160（160 aa）
链 J 1–160（160 aa）
链 K 1–160（160 aa）
链 L 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LEICA EM GP2
分辨率 3.70 Å
9MOY Reconstituted yeast V-ATPase bound to Rtc5p 提交 2024-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
链 b 1–160（160 aa）
链 c 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2
分辨率 3.60 Å
9ODU Yeast V-ATPase bound to Rtc5p, rotary state 2 提交 2025-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 V 1–160（160 aa）
链 W 1–160（160 aa）
链 X 1–160（160 aa）
链 Y 1–160（160 aa）
链 Z 1–160（160 aa）
链 a 1–160（160 aa）
链 b 1–160（160 aa）
链 c 1–160（160 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 32 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VATL1_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 J； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 K； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 L； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 M； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 N； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 O； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160 作者链 P； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

Cation transporter

Vibrio parahaemolyticus

UniProt A0A0L7YPA6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白拷贝数一致 链 Q； UniProt 1–492 链 R； UniProt 1–492 未记录 V-type proton ATPase subunit a, vacuolar isoform × 1 （P32563） V0 assembly protein 1 × 1 （P53262） V-type proton ATPase subunit d × 1 （P32366） V-type proton ATPase subunit e × 1 （Q3E7B6） Uncharacterized protein YPR170W-B × 1 （P0C5R9） ;V-type proton ATPase subunit c'' ; × 1 （P23968） ;V-type proton ATPase subunit c' ; × 1 （P32842） V-type proton ATPase subunit c × 8 （P25515） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6PE5 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6PE4 Yeast Vo motor in complex with 1 VopQ molecule 提交 2019-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 Q 1–492（492 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0L7YPA6_VIBPH
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 22–513； UniProt 1–492 作者链 R； PDB构建体 22–513； UniProt 1–492

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6pe5

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6pe5
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6pe5
沉积日期 deposition_date2019-06-20
结构标题 titleYeast Vo motor in complex with 2 VopQ molecules
关键词 keywordscomplex, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier51.10 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron50.19 Å
零角强度 I(0) i01971950000.00
分子量 molecular_weight392980.0 kDa
排除体积 excluded_volume501050 ų
包络体积 envelope_volume732990 ų
水化壳体积 shell_volume117490 ų
包络直径 envelope_diameter174.3 Å
壳层 Rg shell_rg57.12 Å
包络 Rg envelope_rg49.44 Å
形状 Rg shape_rg50.20 Å
总 Rg total_rg50.39 Å
总原子数 total_atoms27642
残基数 n_residues3666
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax168.8 Å
Rg (实空间) rg_real50.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.39 Å
I(0) (实空间) i0_real1.9720e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.6970e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal51.22 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1973000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8735
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary65.3 Å
偏度 Skewness skewness0.221
峰度 Kurtosis kurtosis-0.333
角度范围 angular_range— – 0.1550 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha161400000.0000
实空间数据点数 n_real_points32
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.836; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.856
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)