6ptn

Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA polymerase alpha-binding protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q01454

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CTF4_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–927; UniProt 1–927 作者链 F; PDB构建体 1–927; UniProt 1–927 作者链 G; PDB构建体 1–927; UniProt 1–927

DNA replication complex GINS protein PSF1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12488

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSF1_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–208; UniProt 1–208 作者链 a; PDB构建体 1–208; UniProt 1–208

DNA replication complex GINS protein PSF2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40359

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSF2_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–213; UniProt 1–213 作者链 b; PDB构建体 1–213; UniProt 1–213

DNA replication complex GINS protein PSF3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12146

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSF3_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–194; UniProt 1–194 作者链 c; PDB构建体 1–194; UniProt 1–194

DNA replication complex GINS protein SLD5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q03406

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 SLD5_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–294; UniProt 1–294 作者链 d; PDB构建体 1–294; UniProt 1–294

Cell division control protein 45

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q08032

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CDC45_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–650; UniProt 1–650 作者链 h; PDB构建体 1–650; UniProt 1–650

DNA replication licensing factor MCM2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P29469

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MCM2_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868 作者链 i; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P24279

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MCM3_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–971; UniProt 1–971 作者链 j; PDB构建体 1–971; UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P30665

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MCM4_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933 作者链 k; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933

Minichromosome maintenance protein 5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P29496

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MCM5_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775 作者链 l; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM7 × 2 (P38132) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017 作者链 m; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38132

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 DNA polymerase alpha-binding protein × 3 (Q01454) DNA replication complex GINS protein PSF1 × 2 (Q12488) DNA replication complex GINS protein PSF2 × 2 (P40359) DNA replication complex GINS protein PSF3 × 2 (Q12146) DNA replication complex GINS protein SLD5 × 2 (Q03406) Cell division control protein 45 × 2 (Q08032) DNA replication licensing factor MCM2 × 2 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 2 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 2 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 2 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 2 (P53091) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MCM7_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845 作者链 n; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ptn
沉积日期 deposition_date2019-07-16
结构标题 titleStructure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases
关键词 keywordsDNA replication, Cryo-EM, CMG-Ctf4, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ptn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ptn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ptn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)102.50 Å
总 Rg102.70 Å
原子数91606
残基数11517
排除体积1635600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6ptn__assembly_1__model_1 25-meric (25) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

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7. 引用文献 (1)