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6qbf

Crystal structure of the pathological D187N variant of calcium-free human gelsolin.

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 145.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gelsolin

Homo sapiens

UniProt P06396

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 28–782 突变：D187N SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1.3 M Ammonium sulfate, 19% glycerol, 100 mM Tris HCl 分辨率 3.50 Å R-free 0.276
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 28–782 突变：D187N SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1.3 M Ammonium sulfate, 19% glycerol, 100 mM Tris HCl 分辨率 3.50 Å R-free 0.276

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6QBF Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1C0F CRYSTAL STRUCTURE OF DICTYOSTELIUM CAATP-ACTIN IN COMPLEX WITH GELSOLIN SEGMENT 1 提交 1999-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa）
突变：N35C CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；290 K；IMIDAZOLE, SODIUM CHLORIDE, ATP, CALCIUM CHLORIDE, MAGNESIUM CHLORIDE, SODIUM AZIDE, DITHIOTHREITOL, PEG 6000, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
1C0G CRYSTAL STRUCTURE OF 1:1 COMPLEX BETWEEN GELSOLIN SEGMENT 1 AND A DICTYOSTELIUM/TETRAHYMENA CHIMERA ACTIN (MUTANT 228: Q228K/T229A/A230Y/E360H) 提交 1999-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa）
突变：YES CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；MES, SODIUM CHLORIDE, ATP, CALCIUM CHLORIDE, MAGNESIUM CHLORIDE, SODIUM AZIDE, DITHIOTHREITOL, PEG 6000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
1D4X Crystal Structure of Caenorhabditis Elegans Mg-ATP Actin Complexed with Human Gelsolin Segment 1 at 1.75 A resolution. 提交 1999-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–177（126 aa） 片段：SEGMENT 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO2 SULFUR DIOXIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 MM TRIS-HCL, PH 8.0, 2 MM MG-ATP, 1.60 M LI2SO4,, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.233
1D4X Crystal Structure of Caenorhabditis Elegans Mg-ATP Actin Complexed with Human Gelsolin Segment 1 at 1.75 A resolution. 提交 1999-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–177（126 aa） 片段：SEGMENT 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO2 SULFUR DIOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 MM TRIS-HCL, PH 8.0, 2 MM MG-ATP, 1.60 M LI2SO4,, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.233
1DEJ CRYSTAL STRUCTURE OF A DICTYOSTELIUM/TETRAHYMENA CHIMERA ACTIN (MUTANT 646: Q228K/T229A/A230Y/A231K/S232E/E360H) IN COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 提交 1999-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa） 片段：SEGMENT 1
突变：YES CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；MES, NACL, CACL2, MGCL2, ATP, PEG6000, DTT, NAN3, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.214
1EQY COMPLEX BETWEEN RABBIT MUSCLE ALPHA-ACTIN: HUMAN GELSOLIN DOMAIN 1 提交 2000-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 52–176（125 aa） 片段：DOMAIN 1
突变：N33C CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.6；298 K；PEG 6000, sodium chloride, adenosine triphosphate, calcium, magnesium, sodium azide, pH 6.6, Vapor Diffusion, temperature 298.0K
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
1ESV COMPLEX BETWEEN LATRUNCULIN A:RABBIT MUSCLE ALPHA ACTIN:HUMAN GELSOLIN DOMAIN 1 提交 2000-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 52–176（125 aa） 片段：DOMAIN 1
突变：N33C CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 LAR LATRUNCULIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.6；298 K；PEG 6000, sodium Chloride, adenosine triphosphate, calcium, magnesium, sodium azide, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.286
1H1V gelsolin G4-G6/actin complex 提交 2002-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 439–769（331 aa） 片段：G4-G6, RESIDUES 412-742 OF CYTOPLASMIC ISOFORM
未记录 CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 100MM HEPES BUFFER, PH 7.5, 20% GLYCEROL, 10 % PEG 8000
分辨率 2.99 Å R-free 0.268
1KCQ Human Gelsolin Domain 2 with a Cd2+ bound 提交 2001-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 185–288（104 aa） 片段：DOMAIN 2
未记录 CD CADMIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, cadmium chloride, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K
分辨率 1.65 Å R-free 0.233
1KCQ Human Gelsolin Domain 2 with a Cd2+ bound 提交 2001-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 185–288（104 aa） 片段：DOMAIN 2
未记录 CD CADMIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；290 K；PEG 400, cadmium chloride, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 290K
分辨率 1.65 Å R-free 0.233
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 52–176（125 aa） 片段：actin-severing
未记录 CA CALCIUM ION × 12 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
1MDU Crystal structure of the chicken actin trimer complexed with human gelsolin segment 1 (GS-1) 提交 2002-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 52–176（125 aa） 片段：actin-severing
未记录 CA CALCIUM ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 3350, tris, calcium chloride, magnesium chloride, ADP, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
1NLV Crystal Structure Of Dictyostelium Discoideum Actin Complexed With Ca ATP And Human Gelsolin Segment 1 提交 2003-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：DOMAIN 1
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO2 SULFUR DIOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；lithium chloride, magnesium chloride, HEPES, ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.258
1NLV Crystal Structure Of Dictyostelium Discoideum Actin Complexed With Ca ATP And Human Gelsolin Segment 1 提交 2003-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：DOMAIN 1
未记录 CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO2 SULFUR DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；lithium chloride, magnesium chloride, HEPES, ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.258
1NM1 Crystal Structure of D. Dicsoideum Actin Complexed With Gelsolin Segment 1 and Mg ATP at 1.8 A Resolution 提交 2003-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：DOMAIN 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO2 SULFUR DIOXIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Magnesium chloride, litheim chloride, HEPES, ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
1NM1 Crystal Structure of D. Dicsoideum Actin Complexed With Gelsolin Segment 1 and Mg ATP at 1.8 A Resolution 提交 2003-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：DOMAIN 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO2 SULFUR DIOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；Magnesium chloride, litheim chloride, HEPES, ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
1NMD Crystal Structure of D. Discoideum Actin-Gelsolin Segment 1 Complex Crystallized In Presence Of Lithium ATP 提交 2003-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：domain I
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO2 SULFUR DIOXIDE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；Lithium sulfate, HEPES, ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
1NMD Crystal Structure of D. Discoideum Actin-Gelsolin Segment 1 Complex Crystallized In Presence Of Lithium ATP 提交 2003-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：domain I
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO2 SULFUR DIOXIDE × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；Lithium sulfate, HEPES, ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.250
1P8X The Calcium-Activated C-terminal half of gelsolin 提交 2003-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–782（344 aa） 片段：C-terminal domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1P8X The Calcium-Activated C-terminal half of gelsolin 提交 2003-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–782（344 aa） 片段：C-terminal domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1P8X The Calcium-Activated C-terminal half of gelsolin 提交 2003-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–782（344 aa） 片段：C-terminal domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1P8Z Complex Between Rabbit Muscle alpha-Actin: Human Gelsolin Residues Val26-Glu156 提交 2003-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–187（136 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1M Sodium Acetate, 10 mM Cadmium Chloride, 12.5% (v/v) PEG 400, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.263
1P8Z Complex Between Rabbit Muscle alpha-Actin: Human Gelsolin Residues Val26-Glu156 提交 2003-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–187（136 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.1M Sodium Acetate, 10 mM Cadmium Chloride, 12.5% (v/v) PEG 400, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.263
1SOL A PIP2 AND F-ACTIN-BINDING SITE OF GELSOLIN, RESIDUE 150-169 (NMR, AVERAGED STRUCTURE) 提交 1995-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 177–196（20 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1T44 Structural basis of actin sequestration by thymosin-B4: Implications for arp2/3 activation 提交 2004-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 55–179（125 aa） 片段：Chimera of Gelsolin domain 1 (residues 28-152) from human and C-Terminal domain of thymosin Beta-4 from mouse (residues 153-171)
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；293 K；PEG 8000, Sodium acetate, calcium chloride, pH 6.5, microbatch, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.195
1YAG STRUCTURE OF THE YEAST ACTIN-HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 COMPLEX 提交 1998-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：SUBDOMAIN 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1YAG STRUCTURE OF THE YEAST ACTIN-HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 COMPLEX 提交 1998-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：SUBDOMAIN 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1YVN THE YEAST ACTIN VAL 159 ASN MUTANT COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1. 提交 1999-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：FRAGMENT 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M HEPES, 1.60 M (NH4)2SO4, 2 MM MG-ATP, PH=8.0.
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1YVN THE YEAST ACTIN VAL 159 ASN MUTANT COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1. 提交 1999-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：FRAGMENT 1
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M HEPES, 1.60 M (NH4)2SO4, 2 MM MG-ATP, PH=8.0.
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
2FF3 Crystal structure of Gelsolin domain 1:N-wasp V2 motif hybrid in complex with actin 提交 2005-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 52–179（128 aa） 片段：Gelsolin domain 1
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；293.15 K；5% PEG 8000, 0.1M sodium acetate, 10mM calcium chloride, pH 6.5, microbatch, temperature 293.15K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
2FF6 Crystal structure of Gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin 提交 2005-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 51–178（128 aa） 片段：Gelsolin domain 1
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；7% PEG 3000, 0.1M Hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
2FH1 C-terminal half of gelsolin soaked in low calcium at pH 4.5 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.214
2FH1 C-terminal half of gelsolin soaked in low calcium at pH 4.5 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.214
2FH1 C-terminal half of gelsolin soaked in low calcium at pH 4.5 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.214
2FH2 C-terminal half of gelsolin soaked in EGTA at pH 4.5 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.255
2FH2 C-terminal half of gelsolin soaked in EGTA at pH 4.5 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.255
2FH2 C-terminal half of gelsolin soaked in EGTA at pH 4.5 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.255
2FH3 C-terminal half of gelsolin soaked in low calcium at pH 8 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 2.87 Å R-free 0.262
2FH3 C-terminal half of gelsolin soaked in low calcium at pH 8 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 2.87 Å R-free 0.262
2FH3 C-terminal half of gelsolin soaked in low calcium at pH 8 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 2.87 Å R-free 0.262
2FH4 C-terminal half of gelsolin soaked in EGTA at pH 8 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.310
2FH4 C-terminal half of gelsolin soaked in EGTA at pH 8 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.310
2FH4 C-terminal half of gelsolin soaked in EGTA at pH 8 提交 2005-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–782（344 aa） 片段：C-terminal half domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 micro batch under oil；pH 4.5；277 K；PEG 8000, pH 4.5, micro batch under oil, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.310
3A5L Crystal Structure of a Dictyostelium P109A Mg2+-Actin in Complex with Human Gelsolin Segment 1 提交 2009-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa） 片段：GELSOLIN-LIKE 1, residues 53-176
突变：N35C CA CALCIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.207
3A5M Crystal Structure of a Dictyostelium P109I Mg2+-Actin in Complex with Human Gelsolin Segment 1 提交 2009-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa） 片段：GELSOLIN-LIKE 1, residues 53-176
突变：N35C CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.223
3A5N Crystal Structure of a Dictyostelium P109A Ca2+-Actin in Complex with Human Gelsolin Segment 1 提交 2009-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa） 片段：GELSOLIN-LIKE 1, residues 53-176
突变：N35C CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.36 Å R-free 0.204
3A5O Crystal Structure of a Dictyostelium P109I Ca2+-Actin in Complex with Human Gelsolin Segment 1 提交 2009-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 53–176（124 aa） 片段：GELSOLIN-LIKE 1, residues 53-176
突变：N35C CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.207
3CI5 Complex of Phosphorylated Dictyostelium Discoideum Actin with Gelsolin 提交 2008-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：Gelsolin Segment 1 (UNP residues 52-176)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 10 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 1.7M Li2SO4, 2mM ATP, 1mM EDTA, 10% Glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.191
3CI5 Complex of Phosphorylated Dictyostelium Discoideum Actin with Gelsolin 提交 2008-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：Gelsolin Segment 1 (UNP residues 52-176)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 10 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 1.7M Li2SO4, 2mM ATP, 1mM EDTA, 10% Glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.191
3CIP Complex of Dictyostelium Discoideum Actin with Gelsolin 提交 2008-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：Gelsolin Segment 1 (UNP RESIDUES 52-176)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 3 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, pH7.5, 1.7M Li2SO4, 2mM ATP, 1mM EDTA, 5% Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.197
3CIP Complex of Dictyostelium Discoideum Actin with Gelsolin 提交 2008-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 52–176（125 aa） 片段：Gelsolin Segment 1 (UNP RESIDUES 52-176)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 18 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 6 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, pH7.5, 1.7M Li2SO4, 2mM ATP, 1mM EDTA, 5% Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.197
3CJB Actin dimer cross-linked by V. cholerae MARTX toxin and complexed with Gelsolin-segment 1 提交 2008-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：segment 1
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；10% Peg MME 5000, 5% Tacsimate, 0.1 M Hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.21 Å R-free 0.269
3CJC Actin dimer cross-linked by V. cholerae MARTX toxin and complexed with DNase I and Gelsolin-segment 1 提交 2008-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 52–176（125 aa） 片段：segment 1
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.5 M (NH4)SO4, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M NaCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.278
3FFK Crystal structure of human Gelsolin domains G1-G3 bound to Actin 提交 2008-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 52–426（375 aa） 片段：UNP residues 52-426
未记录 CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；297 K；9% PEG 4000, 100 mM Sodium Acetate, 100 mM Calcium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
3FFK Crystal structure of human Gelsolin domains G1-G3 bound to Actin 提交 2008-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 52–426（375 aa） 片段：UNP residues 52-426
未记录 CA CALCIUM ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；297 K；9% PEG 4000, 100 mM Sodium Acetate, 100 mM Calcium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
3FFN Crystal structure of calcium-free human gelsolin 提交 2008-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–782（782 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；297 K；15% glycerol, 100 mM Bis-Tris HCl, 1.5M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
3FFN Crystal structure of calcium-free human gelsolin 提交 2008-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–782（782 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；297 K；15% glycerol, 100 mM Bis-Tris HCl, 1.5M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
3TU5 Actin complex with Gelsolin Segment 1 fused to Cobl segment 提交 2011-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 53–174（122 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；10% (w/v) polyethyleneglycol 20000, 2% (v/v) dioxane, and 0.1M bicine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.204
4PKG Complex of ATP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 12–136（125 aa） 片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
分辨率 1.80 Å R-free 0.187
4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–136（125 aa） 片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
分辨率 2.15 Å R-free 0.326
4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 12–136（125 aa） 片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
分辨率 2.15 Å R-free 0.326
4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 12–136（125 aa） 片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
分辨率 2.15 Å R-free 0.326
4PKH Complex of ADP-actin With the N-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 12–136（125 aa） 片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 1 (UNP residues 50-101)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.18 M sodium fluoride, 11% w/v PEG3350, 1% v/v PEG1000, 1% v/v PEG400
分辨率 2.15 Å R-free 0.326
4PKI Complex of ATP-actin With the C-terminal Actin-Binding Domain of Tropomodulin 提交 2014-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 12–136（125 aa） 片段：Gelsolin (UNP residues 12-136), GGSGGSGGS linker, Tmod1 Actin-binding site 2 (UNP residues 160-349)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.25 M sodium chloride, 12% w/v PEG3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.201
4S10 Gelsolin nanobody shielding mutant plasma gelsolin from furin proteolysis 提交 2015-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 186–288（103 aa） 片段：GELSOLIN DOMAIN 2
突变：S226D, R228D CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；288 K；30% PEG 1500, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K
分辨率 2.61 Å R-free 0.312
4S10 Gelsolin nanobody shielding mutant plasma gelsolin from furin proteolysis 提交 2015-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 186–288（103 aa） 片段：GELSOLIN DOMAIN 2
突变：S226D, R228D CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；288 K；30% PEG 1500, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K
分辨率 2.61 Å R-free 0.312
4Z94 Actin Complex With a Chimera of Tropomodulin-1 and Leiomodin-1 Actin-Binding Site 2 提交 2015-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 12–136（125 aa） 片段：;Gelsolin residues 12-136 (UNP), linker,Tropomodulin-1 residues 160-228 (UNP), Leiomodin-1 Actin-Binding Site 2 (UNP residues 364-486) ;
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291.5 K；20% PEG3350, 200 mM lithium sulfate, 100 mM Tris, pH 8.8, 15% glycerol
分辨率 2.40 Å R-free 0.243
5FAE N184K pathological variant of gelsolin domain 2 (trigonal form) 提交 2015-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 178–293（116 aa） 片段：UNP residues 178-293
突变：N184K CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M lithium sulfate 0.1 M tris 40% PEG 400
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
5FAF N184K pathological variant of gelsolin domain 2 (orthorhombic form) 提交 2015-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 178–293（116 aa） 片段：UNP residues 178-293
突变：N184K CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；20% PEG 8000 0.1 M MES 0.2 M calcium acetate
分辨率 1.05 Å R-free 0.168
5H3M Solution structure of human Gelsolin protein domain 1 at pH 5.0 提交 2016-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 55–187（133 aa） 片段：UNP residues 55-187
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 0.65 mM 13C, 15N gelsolin domain 1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5H3N Solution structure of human Gelsolin protein domain 1 at pH 7.3 提交 2016-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 55–187（133 aa） 片段：UNP residues 55-187
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成 0.70 mM 13C, 15N human Gelsolin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5O2Z Domain swap dimer of the G167R variant of gelsolin second domain 提交 2017-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 178–293（116 aa）
链 B 178–293（116 aa）
突变：G167R 突变：G167R CA CALCIUM ION × 2 FLC CITRATE ANION × 2 ACT ACETATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium citrate, 30% PEG 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.242
5UBO Mical-oxidized Actin complex with Gelsolin Segment 1 提交 2016-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 12–138（127 aa） 片段：unp residues 12-138
未记录 CA CALCIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 6000, NaCl, imidazole, ATP, calcium
分辨率 2.39 Å R-free 0.191
5ZZ0 HUMAN GELSOLIN FROM RESIDUES GLU28 TO ARG161 WITH CALCIUM 提交 2018-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 55–188（134 aa） 片段：UNP residues 55-188
未记录 CA CALCIUM ION × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Peg 6000 (20%), 100mM Sodium acetate, 200mM Calcium Chloride Dihydrate, pH 5
分辨率 2.63 Å R-free 0.254
5ZZ0 HUMAN GELSOLIN FROM RESIDUES GLU28 TO ARG161 WITH CALCIUM 提交 2018-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 55–188（134 aa） 片段：UNP residues 55-188
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Peg 6000 (20%), 100mM Sodium acetate, 200mM Calcium Chloride Dihydrate, pH 5
分辨率 2.63 Å R-free 0.254
6H1F Structure of the nanobody-stabilized gelsolin D187N variant (second domain) 提交 2018-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 178–293（116 aa）
突变：D187N SCN THIOCYANATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Potassium thiocyanate, 30%w/v PEG 2000 MME
分辨率 1.90 Å R-free 0.233
6JCO Crystal structure of calcium free human gelsolin amyloid mutant D187N 提交 2019-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 56–782（727 aa）
链 B 56–782（727 aa）
突变：D187N 突变：D187N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298.1 K；15% glycerol, 1.5M ammonium sulfate, 0.1M tris HCl pH8.5
分辨率 2.88 Å R-free 0.267
6JEG Crystal structure of calcium free human gelsolin amyloid mutant G167R 提交 2019-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 54–782（729 aa）
链 B 54–782（729 aa）
突变：G167R 突变：G167R GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；15% glycerol, 1.5M ammonium sulfate, 0.1M tris HCl, pH8.5
分辨率 2.98 Å R-free 0.237
6JEH Crystal structure of calcium free human gelsolin amyloid mutant D187Y 提交 2019-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 56–782（727 aa）
链 B 56–782（727 aa）
突变：D187Y 突变：D187Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；15% glycerol, 1.5M ammonium sulfate, 0.1M tris HCl pH8.5
分辨率 2.95 Å R-free 0.249
6LJE Crystal structure of gelsolin G3 domain (calcium and magnesium condition) 提交 2019-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 297–397（101 aa） 片段：UNP residues 297-397
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium sulphate, calcium chloride, magnesium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.189
6LJE Crystal structure of gelsolin G3 domain (calcium and magnesium condition) 提交 2019-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 297–397（101 aa） 片段：UNP residues 297-397
未记录 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium sulphate, calcium chloride, magnesium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.189
6LJF Crystal structure of gelsolin G3 domain (calcium condition) 提交 2019-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 297–397（101 aa） 片段：UNP residues 297-397
未记录 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium sulphate, calcium chloride
分辨率 1.50 Å R-free 0.183
6LJF Crystal structure of gelsolin G3 domain (calcium condition) 提交 2019-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 297–397（101 aa） 片段：UNP residues 297-397
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium sulphate, calcium chloride
分辨率 1.50 Å R-free 0.183
6Q9R Crystal structure of the pathological N184K variant of calcium-free human gelsolin 提交 2018-12-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–782（755 aa）
突变：N184K CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 15 % glycerol, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.73 Å R-free 0.260
6Q9R Crystal structure of the pathological N184K variant of calcium-free human gelsolin 提交 2018-12-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 28–782（755 aa）
突变：N184K CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 9 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 15 % glycerol, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.73 Å R-free 0.260
6Q9Z Crystal structure of the pathological G167R variant of calcium-free human gelsolin, 提交 2018-12-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–782（755 aa）
突变：G167R SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 20% glycerol, 100 mM Tris-HCl
分辨率 3.80 Å R-free 0.264
6Q9Z Crystal structure of the pathological G167R variant of calcium-free human gelsolin, 提交 2018-12-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 28–782（755 aa）
突变：G167R SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；1.5 M ammonium sulfate, 20% glycerol, 100 mM Tris-HCl
分辨率 3.80 Å R-free 0.264
6QW3 Calcium-bound gelsolin domain 2 提交 2019-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 178–293（116 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；36% PEG5000 MME, 0.1M Sodium Acetate
分辨率 1.30 Å R-free 0.174
7P2B Crystal structure of human gelsolin amyloid mutant A551P 提交 2021-07-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–782（755 aa）
突变：A551P SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；15% glycerol, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1M tris HCl, pH8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.263
7P2B Crystal structure of human gelsolin amyloid mutant A551P 提交 2021-07-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 28–782（755 aa）
突变：A551P SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；15% glycerol, 2.0 M ammonium sulfate, 0.1M tris HCl, pH8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.263
8VIZ Structure of full-length gelsolin bound to the barbed end of F-actin 提交 2024-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 52–782（731 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 CA CALCIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8VKH Structure of gelsolin domains G1G3 bound to the barbed end of F-actin 提交 2024-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 52–782（731 aa）
链 H 52–782（731 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
9UG2 Severed and capped actin fragment by two G1G3 domains of gelsolin 提交 2025-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 54–401（348 aa）
链 B 54–401（348 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å

共 60 个其他 PDB 条目、93 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GELS_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 24–778； UniProt 28–782 作者链 B； PDB构建体 24–778； UniProt 28–782

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6qbf

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6qbf
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6qbf
沉积日期 deposition_date2018-12-21
结构标题 titleCrystal structure of the pathological D187N variant of calcium-free human gelsolin.
关键词 keywordsamyloidosis, gelsolin, actin-binding, pathological mutation, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier42.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron42.68 Å
零角强度 I(0) i0378268000.00
分子量 molecular_weight157710.0 kDa
排除体积 excluded_volume196530 ų
包络体积 envelope_volume266990 ų
水化壳体积 shell_volume53707 ų
包络直径 envelope_diameter159.1 Å
壳层 Rg shell_rg45.80 Å
包络 Rg envelope_rg42.47 Å
形状 Rg shape_rg42.68 Å
总 Rg total_rg42.83 Å
总原子数 total_atoms11131
残基数 n_residues1429
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax145.5 Å
Rg (实空间) rg_real42.66 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.47 Å
I(0) (实空间) i0_real3.7830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.6260e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal42.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal378200000.0000
解质量估计 total_estimate0.8617
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary39.3 Å
偏度 Skewness skewness0.432
峰度 Kurtosis kurtosis-0.457
角度范围 angular_range— – 0.1850 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha60760000.0000
实空间数据点数 n_real_points38
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.812; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.908; Smooth: 0.853
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id6qbfA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfA05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfA06
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfB04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfB05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
结构域编号 domain_id6qbfB06
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology20 — Severin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Severin
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)