Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | (2~{S})-4-methyl-~{N}-prop-2-enyl-2-[[(1~{S})-2,2,2-tris(fluoranyl)-1-[4-(4-methylsulfonylphenyl)phenyl]ethyl]amino]pentanamide × 2 CALCIUM ION × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CATK_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–215； UniProt 115–329 作者链 B； PDB构建体 1–215； UniProt 115–329 |
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| 条目编号 entry_id | 6qbs |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-12-21 |
| 结构标题 title | The Alkyne Moiety as a Latent Electrophile in Irreversible Covalent Small Molecule Inhibitors of Cathepsin K |
| 关键词 keywords | Covalent Inhibitor, Cathepsin K, hydrolase; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 23.78 Å |
| Rg（电子密度） | 23.23 Å |
| 总 Rg | 24.05 Å |
| 原子数 | 4217 |
| 残基数 | 430 |
| 排除体积 | 59459 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6qbsa_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.3 — Cysteine proteinases |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.3.1 — Cysteine proteinases |
| 家族 Family family | d.3.1.1 — Papain-like |
| 结构域编号 domain_id | d6qbsb_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.3 — Cysteine proteinases |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.3.1 — Cysteine proteinases |
| 家族 Family family | d.3.1.1 — Papain-like |
| 结构域编号 domain_id | 6qbsA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin B; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cysteine proteinases |
| 结构域编号 domain_id | 6qbsB00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin B; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cysteine proteinases |