SAXSdb — 6sy4

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetracycline repressor protein class B from transposon Tn10

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–RNA 同源多聚体蛋白 × 2 RNA 1 PDB 声明：trimeric（3）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–203 链 B； UniProt 1–203	未记录	TetR-binding aptamer K1 (43-MER) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；4% v/v Tacsimate pH 6.0, 12% w/v PEG 3350	分辨率 2.69 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6SY4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2NS7 How an in vitro selected peptide mimics the antibiotic tetracycline to induce TET repressor 提交 2006-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–187（187 aa）链 B 1–187（187 aa）	突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；1.4M ammonium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.277
2NS7 How an in vitro selected peptide mimics the antibiotic tetracycline to induce TET repressor 提交 2006-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–187（187 aa）链 D 1–187（187 aa）	突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；1.4M ammonium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.40 Å R-free 0.277
2NS8 How an in vitro selected peptide mimics the antibiotic tetracycline to induce TET repressor 提交 2006-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–187（187 aa）链 B 1–187（187 aa）	突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；292 K；4M sodium formate, 0.1M Tris-HCl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.55 Å R-free 0.270
2NS8 How an in vitro selected peptide mimics the antibiotic tetracycline to induce TET repressor 提交 2006-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–187（187 aa）链 D 1–187（187 aa）	突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；292 K；4M sodium formate, 0.1M Tris-HCl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.55 Å R-free 0.270
2NS8 How an in vitro selected peptide mimics the antibiotic tetracycline to induce TET repressor 提交 2006-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 1–187（187 aa）链 B 1–187（187 aa）链 C 1–187（187 aa）链 D 1–187（187 aa）	突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S 突变：C68S, C88N, C121T, C144S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；292 K；4M sodium formate, 0.1M Tris-HCl, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.55 Å R-free 0.270
2VKV TetR (BD) variant L17G with reverse phenotype 提交 2008-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–50（50 aa）片段：RESIDUES 1-50,51-208	突变：YES	TDC 5A,6-ANHYDROTETRACYCLINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.7；277 K；0.1 M TRIS-HCL (PH 8.7), 0.3 M MGCL2, 20 % PEG 4000, 3 % DIOXANE, AT 277 K	分辨率 1.74 Å R-free 0.225
2XGC Crystal structure of a designed heterodimeric variant T-A(I)B of the tetracycline repressor 提交 2010-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–50（50 aa）片段：RESIDUES 1-50,51-208	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.15 Å R-free 0.271
2XGC Crystal structure of a designed heterodimeric variant T-A(I)B of the tetracycline repressor 提交 2010-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–50（50 aa）片段：RESIDUES 1-50,51-208	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.15 Å R-free 0.271
2XGD Crystal structure of a designed homodimeric variant T-A(L)A(L) of the tetracycline repressor 提交 2010-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–50（50 aa）片段：RESIDUES 1-50,51-208	突变：YES	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.25 Å R-free 0.259
2XGE Crystal structure of a designed heterodimeric variant T-A(A)B of the tetracycline repressor 提交 2010-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–50（50 aa）片段：RESIDUES 1-50,51-208	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.14 Å R-free 0.260
2XGE Crystal structure of a designed heterodimeric variant T-A(A)B of the tetracycline repressor 提交 2010-06-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–50（50 aa）片段：RESIDUES 1-50,51-208	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.14 Å R-free 0.260
3FK6 Crystal structure of TetR triple mutant (H64K, S135L, S138I) 提交 2008-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–50（50 aa）片段：DNA-binding domain (residues 1-50) and the effector-binding domain (residues 51-208) 链 B 1–50（50 aa）片段：DNA-binding domain (residues 1-50) and the effector-binding domain (residues 51-208)	突变：H64K, S135L, S138I 突变：H64K, S135L, S138I	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；1M dipotassium hydrogen phosphate, 200mM sodium chloride, 50mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
3FK7 Crystal structure of TetR triple mutant (H64K, S135L, S138I) in complex with 4-ddma-atc 提交 2008-12-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–50（50 aa）片段：DNA-binding domain (residues 1-50) and the effector-binding domain (residues 51-208) 链 B 1–50（50 aa）片段：DNA-binding domain (residues 1-50) and the effector-binding domain (residues 51-208)	突变：H64K, S135L, S138I 突变：H64K, S135L, S138I	MG MAGNESIUM ION × 2 4DM (4aS,12aS)-3,10,11,12a-tetrahydroxy-6-methyl-1,12-dioxo-1,4,4a,5,12,12a-hexahydrotetracene-2-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；1M dipotassium hydrogen phosphate, 200mM sodium chloride, 50mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.06 Å R-free 0.261
3ZQF Structure of Tetracycline repressor in complex with antiinducer peptide-TAP1 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–187（187 aa）片段：RESIDUES 1-187,188-208	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；RESERVOIR: 3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS, PH 6.	分辨率 2.56 Å R-free 0.247
3ZQG Structure of Tetracycline repressor in complex with antiinducer peptide-TAP2 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–187（187 aa）片段：RESIDUES 1-187,188-208	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；RESERVOIR: 3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS, PH 6.5	分辨率 2.45 Å R-free 0.234
3ZQH Structure of Tetracycline repressor in complex with inducer peptide- TIP3 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–187（187 aa）片段：RESIDUES 1-187,188-208	突变：YES	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；0.2 M NACL, 0.1 M TRIS PH 9.0, 25% PEG 3350.	分辨率 1.60 Å R-free 0.224
3ZQI Structure of Tetracycline repressor in complex with inducer peptide- TIP2 提交 2011-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–187（187 aa）片段：RESIDUES 1-187,188-208 链 B 1–187（187 aa）片段：RESIDUES 1-187,188-208	突变：YES 突变：YES	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；0.2 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 7.0, 20% PEG 8000.	分辨率 1.50 Å R-free 0.195
4AC0 TETR(B) IN COMPLEX WITH MINOCYCLINE AND MAGNESIUM 提交 2011-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–203（202 aa）	未记录	MIY (4S,4AS,5AR,12AS)-4,7-BIS(DIMETHYLAMINO)-3,10,12,12A-TETRAHYDROXY-1,11-DIOXO-1,4,4A,5,5A,6,11,12A-OCTAHYDROTETRACENE-2- CARBOXAMIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.45 Å R-free 0.294
6SY6 TetR in complex with the TetR-binding RNA-aptamer K2 提交 2019-09-27	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric	链 A 1–203（203 aa）链 B 1–203（203 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；15 % (v/v) pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), 0.2 M NaCl, pH 6.0, 0.1 M MES-NaOH	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
9DT3 Crystal structure of the engineered sulfonylurea repressor EsR (L11-C6), bound to ethametsulfuron-methyl 提交 2024-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–207（207 aa）链 B 1–207（207 aa）	未记录	RXF methyl 2-[[4-ethoxy-6-(methylamino)-1,3,5-triazin-2-yl]carbamoylsulfamoyl]benzoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05 M Magnesium chloride 0.1 M HEPES pH 7.5 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
9DT3 Crystal structure of the engineered sulfonylurea repressor EsR (L11-C6), bound to ethametsulfuron-methyl 提交 2024-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–207（207 aa）链 D 1–207（207 aa）	未记录	RXF methyl 2-[[4-ethoxy-6-(methylamino)-1,3,5-triazin-2-yl]carbamoylsulfamoyl]benzoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05 M Magnesium chloride 0.1 M HEPES pH 7.5 30% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
9DT4 Crystal structure of the engineered sulfonylurea repressor CsR (L4.2-20), apo form 提交 2024-09-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–207（207 aa）链 B 1–207（207 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2 M Sodium acetate 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5 30% w/v Polyethylene glycol 4,000	分辨率 2.40 Å R-free 0.241
9DT5 Crystal structure of the engineered sulfonylurea repressor CsR (L4.2-20), bound to chlorsulfuron 提交 2024-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–207（207 aa）链 B 1–207（207 aa）	未记录	1CS 1-(2-CHLOROPHENYLSULFONYL)-3-(4-METHOXY-6-METHYL-L,3,5-TRIAZIN-2-YL)UREA × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05 M Ammonium sulfate 0.05 M BIS-TRIS pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 600	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
9DT5 Crystal structure of the engineered sulfonylurea repressor CsR (L4.2-20), bound to chlorsulfuron 提交 2024-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–207（207 aa）链 D 1–207（207 aa）	未记录	1CS 1-(2-CHLOROPHENYLSULFONYL)-3-(4-METHOXY-6-METHYL-L,3,5-TRIAZIN-2-YL)UREA × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.05 M Ammonium sulfate 0.05 M BIS-TRIS pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 600	分辨率 2.00 Å R-free 0.228

共 17 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TETR2_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 B； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6sy4
沉积日期 deposition_date	2019-09-27
结构标题 title	TetR in complex with the TetR-binding RNA-aptamer K1
关键词 keywords	TetR, Complex, Aptamer, Transcriptional regulator, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	27.07 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.77 Å
零角强度 I(0) i0	62809400.00
分子量 molecular_weight	52827.0 kDa
排除体积 excluded_volume	62299 Å³
包络体积 envelope_volume	82151 Å³
水化壳体积 shell_volume	27555 Å³
包络直径 envelope_diameter	92.0 Å
壳层 Rg shell_rg	31.79 Å
包络 Rg envelope_rg	25.58 Å
形状 Rg shape_rg	25.72 Å
总 Rg total_rg	26.49 Å
总原子数 total_atoms	3682
残基数 n_residues	401
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	90.7 Å
Rg (实空间) rg_real	27.12 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.77 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.2810e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.5310e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	27.11 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	62810000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8869
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	29.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.365
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.410
角度范围 angular_range	— – 0.2950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5593000.0000
实空间数据点数 n_real_points	60
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.883; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.910; Smooth: 0.967

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tetracycline repressor protein class B from transposon Tn10
分子量 formula_weight	23531.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3718

MSRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAIEMLDRHHTHFSPLEGESWQDFLRNNAKSFRNALLSHRDGAKVHLGTRPTEKQYETLENQLAFLTQQGFSLENALYALSAVGHFTLGSVLEDQEHQVAKEERETPTTDSMPPLLRQAIELFDHQGAEPAFLHGLESLIRGFEVQLTALLQIV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TetR-binding aptamer K1 (43-MER)
分子量 formula_weight	14035.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	C

GGCCGGAGAAUGUUAUGGCGCGAAAGCGCAGAGAAAACCGGUC

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	19

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6sy4A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	6sy4A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetracycline Repressor, domain 2

结构域编号 domain_id	6sy4B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	6sy4B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetracycline Repressor, domain 2

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	96.027 Å
晶胞边长 b length_b	96.027 Å
晶胞边长 c length_c	163.015 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.695 Å
最低分辨率 resolution_low	15.764 Å
R 因子 r_factor	0.2036
R_work r_work	0.2012
R_free r_free	0.2460

fit	/app/data/saxs_computation/sy/6sy4/6sy4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/sy/6sy4/6sy4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/sy/6sy4/6sy4.dat

TetR in complex with the TetR-binding RNA-aptamer K1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tetracycline repressor protein class B from transposon Tn10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)