SAXSdb — 6sz5

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calmodulin-2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–149	未记录	NADPH oxidase 5 × 2 （Q96PH1） CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30 mM Tris-HCl at pH 7.4, 2.5 mM CaCl2 and 2.5% (v/v) glycerol	分辨率 2.23 Å R-free 0.294

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6SZ5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6PLM Legionella pneumophila SidJ/ Calmodulin 2 complex 提交 2019-07-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–148（147 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M Tris pH 9.2, 0.2 M Sodium Iodide , 15% PEG 3350, 1 mM Calcium Chloride, 1 mM ATP	分辨率 2.59 Å R-free 0.241
6PLM Legionella pneumophila SidJ/ Calmodulin 2 complex 提交 2019-07-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–148（147 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M Tris pH 9.2, 0.2 M Sodium Iodide , 15% PEG 3350, 1 mM Calcium Chloride, 1 mM ATP	分辨率 2.59 Å R-free 0.241
6S5T Legionella pneumophila SidJ-Human calmodulin complex 提交 2019-07-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.15 Å
6XXF 1.7 Angstrom crystal structure of Ca/CaM:RyR2 peptide complex 提交 2020-01-27	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 AAA 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium acetate pH4.5, 0.2M ammonium acetate, 10% PEG4000	分辨率 1.70 Å R-free 0.205
6Y4O Calmodulin bound to cardiac ryanodine receptor (RyR2) calmodulin binding domain 提交 2020-02-21	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；0.1 M Sodium Acetate pH 4.70 and 23 % PEG 550 MME	分辨率 1.84 Å R-free 0.208
7MIR Cryo-EM structure of SidJ-SdeA-CaM reaction intermediate complex 提交 2021-04-17	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5；25 mM Bis-tris pH 6.5, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7MIS Cryo-EM structure of SidJ-SdeC-CaM reaction intermediate complex 提交 2021-04-17	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.5；25 mM Bis-tris pH 6.5, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7PPO Structure of SidJ/CaM bound to SdeA in pre-glutamylation state 提交 2021-09-14	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.91 Å
7PQE Structure of SidJ/CaM bound to SdeA in post-catalysis state 提交 2021-09-17	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8K9Z Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-bound calmodulin 提交 2023-08-02	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；17% (w/v) PEG 3350 and 0.18 M magnesium acetate	分辨率 2.90 Å R-free 0.304
8K9Z Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-bound calmodulin 提交 2023-08-02	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；17% (w/v) PEG 3350 and 0.18 M magnesium acetate	分辨率 2.90 Å R-free 0.304
8KA0 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-bound calmodulin and a nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) 提交 2023-08-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–149（149 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 32.5% (w/v) PEG 4000 and 0.15 M sodium acetate. 10 mM NAD+ soaking	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
8KA0 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-bound calmodulin and a nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) 提交 2023-08-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–149（149 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 32.5% (w/v) PEG 4000 and 0.15 M sodium acetate. 10 mM NAD+ soaking	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
8KA0 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-bound calmodulin and a nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) 提交 2023-08-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–149（149 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 32.5% (w/v) PEG 4000 and 0.15 M sodium acetate. 10 mM NAD+ soaking	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
8KA0 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-bound calmodulin and a nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) 提交 2023-08-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–149（149 aa）	未记录	NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 32.5% (w/v) PEG 4000 and 0.15 M sodium acetate. 10 mM NAD+ soaking	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
8KA1 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-free calmodulin 提交 2023-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–149（149 aa）	突变：E124Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.28 M MgCl2, and 6 mM MnCl2	分辨率 2.82 Å R-free 0.342
8KA1 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-free calmodulin 提交 2023-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–149（149 aa）	突变：E124Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.28 M MgCl2, and 6 mM MnCl2	分辨率 2.82 Å R-free 0.342
8KA1 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-free calmodulin 提交 2023-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–149（149 aa）	突变：E124Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.28 M MgCl2, and 6 mM MnCl2	分辨率 2.82 Å R-free 0.342
8KA1 Crystal structure of Vibrio vulnificus RID-dependent transforming NADase domain (RDTND)/calmodulin-binding domain of Rho inactivation domain (RID-CBD) complexed with Ca2+-free calmodulin 提交 2023-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–149（149 aa）	突变：E124Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.28 M MgCl2, and 6 mM MnCl2	分辨率 2.82 Å R-free 0.342

共 11 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

NADPH oxidase 5

物种未注明

UniProt Q96PH1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 19–737 链 C； UniProt 19–737	未记录	Calmodulin-2 × 1 （P0DP24） CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；30 mM Tris-HCl at pH 7.4, 2.5 mM CaCl2 and 2.5% (v/v) glycerol	分辨率 2.23 Å R-free 0.294

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6SZ5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8U7Y Structural Basis of Human NOX5 Activation 提交 2023-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–719（719 aa）链 B 1–719（719 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 D12 DODECANE × 2 D10 DECANE × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 HEB HEME B/C × 4 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.06 Å
8U85 Structural Basis of Human NOX5 Activation 提交 2023-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–719（719 aa）链 C 1–719（719 aa）	未记录	HEB HEME B/C × 4 NDP NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 PX2 1,2-DILAUROYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8U86 Structural Basis of Human NOX5 Activation 提交 2023-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–719（719 aa）链 C 1–719（719 aa）	未记录	HEB HEME B/C × 4 NDP NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 D12 DODECANE × 2 D10 DECANE × 2 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8U87 Structural Basis of Human NOX5 Activation 提交 2023-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–719（719 aa）链 C 1–719（719 aa）	未记录	HEB HEME B/C × 4 NDP NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 ZN ZINC ION × 1 D12 DODECANE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NOX5_HUMAN
Isoform	Q96PH1-3
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–719； UniProt 19–737 作者链 C； PDB构建体 1–719； UniProt 19–737

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6sz5
沉积日期 deposition_date	2019-10-02
结构标题 title	Human calmodulin bound to a peptide of human NADPH oxidase 5
关键词 keywords	NOX5, calmodulin, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	22.08 Å
零角强度 I(0) i0	6856530.00
分子量 molecular_weight	18865.0 kDa
排除体积 excluded_volume	23268 Å³
包络体积 envelope_volume	29971 Å³
水化壳体积 shell_volume	12528 Å³
包络直径 envelope_diameter	72.7 Å
壳层 Rg shell_rg	26.16 Å
包络 Rg envelope_rg	21.69 Å
形状 Rg shape_rg	22.06 Å
总 Rg total_rg	22.72 Å
总原子数 total_atoms	1315
残基数 n_residues	165
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	73.3 Å
Rg (实空间) rg_real	22.92 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.61 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.8570e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1090e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.88 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6856000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7894
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	17.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.367
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.844
角度范围 angular_range	— – 0.3500 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	960900.0000
实空间数据点数 n_real_points	67
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.557; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.600; Smooth: 0.986

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Calmodulin-2
分子量 formula_weight	16852.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1362

MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	NADPH oxidase 5
分子量 formula_weight	82119.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.6.3.-
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C

MSAEEDARWLRWVTQQFKTIAGEDGEISLQEFKAALHVKESFFAERFFALFDSDRSGTITLQELQEALTLLIHGSPMDKLKFLFQVYDIDGSGSIDPDELRTVLQSCLRESAISLPDEKLDQLTLALFESADADGNGAITFEELRDELQRFPGVMENLTISAAHWLTAPAPRPRPRRPRQLTRAYWHNHRSQLFCLATYAGLHVLLFGLAASAHRDLGASVMVAKGCGQCLNFDCSFIAVLMLRRCLTWLRATWLAQVLPLDQNIQFHQLMGYVVVGLSLVHTVAHTVNFVLQAQAEASPFQFWELLLTTRPGIGWVHGSASPTGVALLLLLLLMFICSSSCIRRSGHFEVFYWTHLSYLLVWLLLIFHGPNFWKWLLVPGILFFLEKAIGLAVSRMAAVCIMEVNLLPSKVTHLLIKRPPFFHYRPGDYLYLNIPTIARYEWHPFTISSAPEQKDTIWLHIRSQGQWTNRLYESFKASDPLGRGSKRLSRSVTMRKSQRSSKGSEILLEKHKFCNIKCYIDGPYGTPTRRIFASEHAVLIGAGIGITPFASILQSIMYRHQKRKHTCPSCQHSWIEGVQDNMKLHKVDFIWINRDQRSFEWFVSLLTKLEMDQAEEAQYGRFLELHMYMTSALGKNDMKAIGLQMALDLLANKEKKDSITGLQTRTQPGRPDWSKVFQKVAAEKKGKVQVFFCGSPALAKVLKGHCEKFGFRFFQENF

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	32

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6sz5A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	24.759 Å
晶胞边长 b length_b	60.840 Å
晶胞边长 c length_c	102.444 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.230 Å
最低分辨率 resolution_low	39.210 Å
R 因子 r_factor	0.2227
R_work r_work	0.2190
R_free r_free	0.2937

fit	/app/data/saxs_computation/sz/6sz5/6sz5.fit
pddf	/app/data/pr_computation/sz/6sz5/6sz5.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/sz/6sz5/6sz5.dat

Human calmodulin bound to a peptide of human NADPH oxidase 5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calmodulin-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

NADPH oxidase 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)