6tl0

Solution structure and 1H, 13C and 15N chemical shift assignments for the complex of VPS29 with VARP 687-747

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vacuolar protein sorting-associated protein 29

Mus musculus

UniProt Q9QZ88

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ankyrin repeat domain-containing protein 27 × 1 (Q96NW4) ZINC ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VPS29_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 11–192; UniProt 1–182

Ankyrin repeat domain-containing protein 27

Homo sapiens

UniProt Q96NW4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 × 1 (Q9QZ88) ZINC ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ANR27_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 6–60; UniProt 692–746

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6tl0
沉积日期 deposition_date2019-11-29
结构标题 titleSolution structure and 1H, 13C and 15N chemical shift assignments for the complex of VPS29 with VARP 687-747
关键词 keywordsVARP, retromer, NMR complex structure, Zinc finger, endosome, INTRACELLULAR VESICLE TRAFFICKING; INTRACELLULAR VESICLE TRAFFICKING
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6tl0__assembly_1__model_15

Assembly 1 · Model 15 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6tl0__assembly_1__model_15 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6tl0__assembly_1__model_15 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.40 Å
Rg(电子密度)20.79 Å
总 Rg21.85 Å
原子数3902
残基数253
排除体积35006 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6tl0__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 6tl0__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 6tl0__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 6tl0__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 6tl0__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 6tl0__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 6tl0__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 6tl0__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 6tl0__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 6tl0__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 6tl0__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 6tl0__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 6tl0__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 6tl0__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 6tl0__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 6tl0__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 6tl0__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 6tl0__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 6tl0__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 6tl0__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 21 6tl0__assembly_1__model_21 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 22 6tl0__assembly_1__model_22 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 23 6tl0__assembly_1__model_23 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 24 6tl0__assembly_1__model_24 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 25 6tl0__assembly_1__model_25 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd6tl0a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.159 — Metallo-dependent phosphatases
超家族 Superfamily superfamilyd.159.1 — Metallo-dependent phosphatases
家族 Family familyd.159.1.7 — YfcE-like
结构域编号 domain_idd6tl0a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
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7. 引用文献 (1)