6tqj

Crystal structure of the c14 ring of the F1FO ATP synthase from spinach chloroplast

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit c, chloroplastic

Spinacia oleracea

UniProt P69447

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 14 EICOSANE × 26 (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 water × 14 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPH_SPIOL
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 B; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 C; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 D; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 E; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 F; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 G; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 H; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 I; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 J; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 K; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 L; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 M; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 N; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6tqj
沉积日期 deposition_date2019-12-16
结构标题 titleCrystal structure of the c14 ring of the F1FO ATP synthase from spinach chloroplast
关键词 keywordsATP synthase, c ring, spinach, chloroplast, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6tqj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6tqj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6tqj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.90 Å
Rg(电子密度)28.79 Å
总 Rg29.67 Å
原子数8089
残基数1134
排除体积150880 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6tqj__assembly_1__model_1 tetradecameric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

CATH v4.4 (14 domains)

结构域编号 domain_id6tqjA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjE01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjF01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjG01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjH01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjI01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjJ01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjK01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjL01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjM01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6tqjN01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C

7. 引用文献 (1)