Integrase
Human immunodeficiency virus 1
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 × 12 DNA 4 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物数一致 | 链 A； UniProt 1–288 链 B； UniProt 1–288 链 C； UniProt 1–288 链 D； UniProt 1–288 链 I； UniProt 1–288 链 J； UniProt 1–288 链 K； UniProt 1–288 链 L； UniProt 1–288 链 M； UniProt 1–288 链 N； UniProt 1–288 链 O； UniProt 1–288 链 P； UniProt 1–288 | 未记录 | DNA (27-MER) × 2 DNA (25-MER) × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 DLU (4R,12aS)-N-(2,4-difluorobenzyl)-7-hydroxy-4-methyl-6,8-dioxo-3,4,6,8,12,12a-hexahydro-2H-pyrido[1',2':4,5]pyrazino[2,1-b][1,3]oxazine-9-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.67 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6U8Q | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BIZ HIV-1 INTEGRASE CORE DOMAIN 提交 1998-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
762–927（166 aa）
片段：CORE DOMAIN, RESIDUES 54 - 212
链 B
762–927（166 aa）
片段：CORE DOMAIN, RESIDUES 54 - 212
|
突变：C56S, F185K 突变：C56S, F185K | CAC CACODYLATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 30% PEG 4000, 100 MM HEPES, PH 7.0, 5 MM DTT
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.253 |
| 1HYV HIV INTEGRASE CORE DOMAIN COMPLEXED WITH TETRAPHENYL ARSONIUM 提交 2001-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC CORE DOMAIN (RESIDUES 50-212)
|
突变：F185K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 TTA TETRAPHENYL-ARSONIUM × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, NH4SO4, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.263 |
| 1HYZ HIV INTEGRASE CORE DOMAIN COMPLEXED WITH A DERIVATIVE OF TETRAPHENYL ARSONIUM. 提交 2001-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC CORE DOMAIN (RESIDUES 50-212)
|
突变：F185K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 TTO (3,4-DIHYDROXY-PHENYL)-TRIPHENYL-ARSONIUM × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, NH4SO4, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.291 |
| 1QS4 Core domain of HIV-1 integrase complexed with Mg++ and 1-(5-chloroindol-3-yl)-3-hydroxy-3-(2H-tetrazol-5-yl)-propenone 提交 1999-06-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
771–924（154 aa）
片段：Catalytic core domain
链 B
771–924（154 aa）
片段：Catalytic core domain
|
突变：F185K, W131E 突变：F185K, W131E | MG MAGNESIUM ION × 2 100 1-(5-CHLOROINDOL-3-YL)-3-HYDROXY-3-(2H-TETRAZOL-5-YL)-PROPENONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；30% PEG 4000, 100 MM HEPES, 5 MM MGCL2, 5 MM DTT, 1% GLYCEROL, pH 7.00
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.255 |
| 1QS4 Core domain of HIV-1 integrase complexed with Mg++ and 1-(5-chloroindol-3-yl)-3-hydroxy-3-(2H-tetrazol-5-yl)-propenone 提交 1999-06-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
771–924（154 aa）
片段：Catalytic core domain
|
突变：F185K, W131E | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；30% PEG 4000, 100 MM HEPES, 5 MM MGCL2, 5 MM DTT, 1% GLYCEROL, pH 7.00
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.255 |
| 3LPT HIV integrase 提交 2010-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：HIV integrase core domain
|
突变：F185K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 723 (6-chloro-2-oxo-4-phenyl-1,2-dihydroquinolin-3-yl)acetic acid × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 P03 2-[3-[3-(2-hydroxyethoxy)propoxy]propoxy]ethanol × 2 SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1M Na cacodylate pH 6.5, 0.1M (NH4)2SO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 3LPU HIV integrase 提交 2010-02-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：HIV integrase core domain
|
突变：F185K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 976 (2S)-2-(6-chloro-2-methyl-4-phenylquinolin-3-yl)pentanoic acid × 2 P03 2-[3-[3-(2-hydroxyethoxy)propoxy]propoxy]ethanol × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1M Na cacodylate pH 6.5, 0.1M (NH4)2SO4, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.221 |
| 3NF6 Structural basis for a new mechanism of inhibition of HIV integrase identified by fragment screening and structure based design 提交 2010-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
|
突变：F185H, C56S, F139D 突变：F185H, C56S, F139D | SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 2 ACY ACETIC ACID × 2 IMV 5-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；1.7M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 3NF7 Structural basis for a new mechanism of inhibition of HIV integrase identified by fragment screening and structure based design 提交 2010-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, UNP residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, UNP residues 50-212
|
突变：F185H, C56S, F139D 突变：F185H, C56S, F139D | SO4 SULFATE ION × 10 ACY ACETIC ACID × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CIW 5-[(5-chloro-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；1.7M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.207 |
| 3NF8 Structural basis for a new mechanism of inhibition of HIV integrase identified by fragment screening and structure based design 提交 2010-06-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
|
突变：F185H, C56S, F139D 突变：F185H, C56S, F139D | SO4 SULFATE ION × 6 CDQ 6-[(5-chloro-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 6 ACY ACETIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；1.7M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.198 |
| 3NF9 Structural basis for a new mechanism of inhibition of HIV integrase identified by fragment screening and structure based design 提交 2010-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
|
突变：F185H, C56S, F139D 突变：F185H, C56S, F139D | SO4 SULFATE ION × 11 CD9 5-[(6-chloro-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACY ACETIC ACID × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；1.7M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.208 |
| 3NFA Structural basis for a new mechanism of inhibition of HIV integrase identified by fragment screening and structure based design 提交 2010-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：catalytic domain, residues 50-212
|
突变：F185H, C56S, F139D 突变：F185H, C56S, F139D | SO4 SULFATE ION × 8 CBJ 6-[(5-bromo-2,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 4 ACY ACETIC ACID × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；1.7M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.204 |
| 3ZCM Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV integrase identified by fragment screening and structure based design. 提交 2012-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 PX3 5-[[[2-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]methyl-prop-2-enyl-amino]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.204 |
| 3ZSO Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based design 提交 2011-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACY ACETIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 2 O2N 5-{[(2-{[bis(4-methoxyphenyl)methyl]carbamoyl}benzyl)(prop-2-en-1-yl)amino]methyl}-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；1.7 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.209 |
| 3ZSQ Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 3 O4N 5-[[[2-[[(1S)-1-(4-METHOXYPHENYL)BUTYL]CARBAMOYL]PHENYL]METHYL-PROP-2-ENYL-AMINO]METHYL]-1,3-BENZODIOXOLE-4-CARBOXYLIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.200 |
| 3ZSR Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 O3N (2S)-2-(2-carboxyethyl)-6-{[{2-[(cyclohexylmethyl)carbamoyl]benzyl}(prop-2-en-1-yl)amino]methyl}-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40MM TRIS PH 8.0, 250MM NACL, 30MM MGCL2, 5MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0M AMMONIUM SULFATE, 100MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.193 |
| 3ZSV Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 ZSV (R)-[(2S)-5-carboxy-2-(2-carboxyethyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl]methyl-[[2-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]methyl]-prop-2-enyl-azanium × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.198 |
| 3ZSW Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | THR THREONINE × 2 SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 ZSW (R)-[2-[[(2R)-butan-2-yl]carbamoyl]phenyl]methyl-[[(2S)-5-carboxy-2-(2-carboxyethyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl]methyl]-prop-2-enyl-azanium × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.206 |
| 3ZSX Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 N44 5-({[2-(benzylcarbamoyl)benzyl](prop-2-en-1-yl)amino}methyl)-1,3-benzodioxole-4-carboxylate × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.228 |
| 3ZSY Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 2 OM3 (R)-(4-CARBOXY-1,3-BENZODIOXOL-5-YL)METHYL-[[2-(CYCLOHEXYLMETHYLCARBAMOYL)PHENYL]METHYL]-METHYL-AZANIUM × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.222 |
| 3ZSZ Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 5 OM2 (R)-[2-[[(2S)-BUTAN-2-YL]CARBAMOYL]PHENYL]METHYL-[(4-CARBOXY-1,3-BENZODIOXOL-5-YL)METHYL]-METHYL-AZANIUM × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 3ZT0 Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ZT0 (4-CARBOXY-1,3-BENZODIOXOL-5-YL)-N-{2-[(4-METHOXYBENZYL)CARBAMOYL]BENZYL}-N-METHYLMETHANAMINIUM × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.240 |
| 3ZT1 Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 OM1 (4-CARBOXY-1,3-BENZODIOXOL-5-YL)METHYL-[[2-[(4-METHOXYPHENYL)METHYLCARBAMOYL]PHENYL]METHYL]AZANIUM × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 4 0MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.199 |
| 3ZT2 Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 4 ZT2 5-[(E)-(2-OXO-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YLIDENE)METHYL]-1,3-BENZODIOXOLE-4-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40MM TRIS PH 8.0, 250MM NACL, 30MM MGCL2, 5MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0M AMMONIUM SULFATE, 100MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.216 |
| 3ZT3 Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZT4 5-{(E)-[(2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YLIDENE]METHYL}-1,3-BENZODIOXOLE-4-CARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40MM TRIS PH 8.0, 250MM NACL, 30MM MGCL2, 5MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0M AMMONIUM SULFATE, 100MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.216 |
| 3ZT4 Small molecule inhibitors of the LEDGF site of HIV type 1 integrase identified by fragment screening and structure based drug design 提交 2011-07-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
链 B
56–212（157 aa）
片段：CORE CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 56-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACY ACETIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZT2 5-[(E)-(2-OXO-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YLIDENE)METHYL]-1,3-BENZODIOXOLE-4-CARBOXYLIC ACID × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.229 |
| 4CE9 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 O3N (2S)-2-(2-carboxyethyl)-6-{[{2-[(cyclohexylmethyl)carbamoyl]benzyl}(prop-2-en-1-yl)amino]methyl}-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.213 |
| 4CEA Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 ACY ACETIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 ZSW (R)-[2-[[(2R)-butan-2-yl]carbamoyl]phenyl]methyl-[[(2S)-5-carboxy-2-(2-carboxyethyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl]methyl]-prop-2-enyl-azanium × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.206 |
| 4CEB Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 ZSV (R)-[(2S)-5-carboxy-2-(2-carboxyethyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl]methyl-[[2-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]methyl]-prop-2-enyl-azanium × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.198 |
| 4CEC Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 2SS (2S)-6-[[[2-(cyclobutylmethylcarbamoyl)phenyl]methyl-prop-2-enyl-amino]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.195 |
| 4CED Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 9NS (2S)-6-[[[2-(furan-2-ylmethylcarbamoyl)phenyl]methyl-prop-2-enyl-amino]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.194 |
| 4CEE Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-512
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-512
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 B0T (2S)-6-[[[2-[[(2S)-butan-2-yl]carbamoyl]phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 4CEF Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-512
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-512
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 D0T (2S)-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-6-[[methyl-[[2-[(phenylmethyl)carbamoyl]phenyl]methyl]amino]methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.200 |
| 4CEO Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 G0T (2S)-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-6-[[[2-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |
| 4CEQ Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 QCH (2S)-6-[[[2-(cyclohexylmethylcarbamoyl)phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.198 |
| 4CER Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 VL4 (2S)-6-[[[2-(cyclobutylmethylcarbamoyl)phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.201 |
| 4CES Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 NFW (2S)-6-[[[2-(furan-2-ylmethylcarbamoyl)phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.197 |
| 4CEZ Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 O3N (2S)-2-(2-carboxyethyl)-6-{[{2-[(cyclohexylmethyl)carbamoyl]benzyl}(prop-2-en-1-yl)amino]methyl}-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.193 |
| 4CF0 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 O5U (2R)-6-[[(1R,2S)-2-(6-azanylhexanoylamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 4CF1 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 3 IY7 (2s)-6-[[(1r,2s)-2-(5-azanylpentanoylamino)-2,3-dihydro-1h-inden-1-yl]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.209 |
| 4CF2 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 3GM (2s)-6-[[(1r,2s)-2-(4-azanylbutanoylamino)-2,3-dihydro-1h-inden-1-yl]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 4CF8 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 V7H (2S)-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-6-[[[2-[(phenylmethyl)carbamoyl]phenyl]methylamino]methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.196 |
| 4CF9 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 5EY (3R)-3-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-6-[(E)-[(2R)-2-oxidanyl-2,3-dihydroinden-1-ylidene]methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 EE2 (2R)-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-6-[(E)-[(2S)-2-oxidanyl-2,3-dihydroinden-1-ylidene]methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.199 |
| 4CFA Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 WOP 5-[[methyl-[[(1S)-2-oxidanylidene-1-phenyl-2-[(phenylmethyl)amino]ethyl]carbamoyl]amino]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.215 |
| 4CFB Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 5 OM3 (R)-(4-CARBOXY-1,3-BENZODIOXOL-5-YL)METHYL-[[2-(CYCLOHEXYLMETHYLCARBAMOYL)PHENYL]METHYL]-METHYL-AZANIUM × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 4CFC Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 7NV 5-[[[(1S)-2-(butylamino)-2-oxidanylidene-1-phenyl-ethyl]carbamoyl-methyl-amino]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 4CFD Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 S8Y 5-[[[(1R)-2-(tert-butylamino)-2-oxidanylidene-1-phenyl-ethyl]carbamoyl-methyl-amino]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.237 |
| 4CGD Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 8P3 2-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.232 |
| 4CGF Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 ACT ACETATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 UJ6 5-{[(3S)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-3-yl]methyl}-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.230 |
| 4CGG Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 K5Q (2S)-6-[(E)-[(2E)-2-hydroxyimino-3H-inden-1-ylidene]methyl]-2-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.199 |
| 4CGH Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 7 ACY ACETIC ACID × 2 LOZ 5-[[(1S,2R)-2-(4-azanylbutanoylamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.203 |
| 4CGI Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 2 NZL 5-[[(1S,2S)-2-(6-azanylhexanoylamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.211 |
| 4CGJ Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 2 NZL 5-[[(1S,2S)-2-(6-azanylhexanoylamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.200 |
| 4CHN Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 5 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2 ONZ 2-(1,3-benzodioxol-4-ylcarbonylamino)ethanoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.194 |
| 4CHO Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GOL GLYCEROL × 2 U2Z [1-[2-(aminomethyl)phenyl]-5-methyl-pyrazol-3-yl]methanol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.198 |
| 4CHP Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 IMV 5-[(2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.198 |
| 4CHQ Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ACT ACETATE ION × 2 CWU 5-[[(1S,2R)-2-oxidanyl-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.203 |
| 4CHY Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACY ACETIC ACID × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 C5Q 5-(1H-indol-3-ylmethyl)-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 4CHZ Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 H75 2-(4-bromophenyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,5-a]pyridin-3(2H)-one × 1 LYS LYSINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 4CIF Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 JDX 2-methoxy-6-[[[2-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.191 |
| 4CIG Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 8 X0P 2-methoxy-6-[[[3-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]naphthalen-2-yl]methyl-methyl-amino]methyl]benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.188 |
| 4CJ3 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 E4F 5-[[(1R,2S)-2-(5-azanylpentanoylamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 4CJ4 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 S3G 5-[(2S)-4-methyl-2-[(pyridin-4-ylcarbonylamino)methyl]pentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 4CJ5 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 4VW 5-[(2S)-2-[[(4-aminophenyl)carbonylamino]methyl]-4-methyl-pentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.201 |
| 4CJE Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 Q31 5-[(2S)-2-[[2-(1H-imidazol-4-yl)ethanoylamino]methyl]-4-methyl-pentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |
| 4CJF Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ACT ACETATE ION × 5 RVN 5-[(E)-(2-oxidanylidene-1H-indol-3-ylidene)methyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.210 |
| 4CJK Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 H39 5-[(2S)-4-methyl-2-{[(1H-pyrrol-3-ylacetyl)amino]methyl}pentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.193 |
| 4CJL Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 9PA 5-[(2S)-2-{[(5-aminopentanoyl)amino]methyl}-4-methylpentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.229 |
| 4CJP Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 7 CL CHLORIDE ION × 2 4D2 5-[(2S)-4-methyl-2-[(pyridin-3-ylcarbonylamino)methyl]pentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.195 |
| 4CJQ Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 7 ACT ACETATE ION × 3 VXO 5-[(2S)-2-[[2-(1H-indol-3-yl)ethanoylamino]methyl]-4-methyl-pentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.201 |
| 4CJR Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 9 CL CHLORIDE ION × 1 FYM 2-methoxy-6-[[[6-[(4-methoxyphenyl)methylcarbamoyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]methyl-methyl-amino]methyl]benzoic acid × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 4CJS Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 L0Y 6-[[[2-(cyclohexylmethylcarbamoyl)phenyl]methyl-methyl-amino]methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.190 |
| 4CJT Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 HLR 1,2-benzoxazol-3-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.194 |
| 4CJU Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 5 JNS 5-[(Z)-2-phenylethenyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.199 |
| 4CJV Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 IV2 5-chloranyl-4-methyl-1,3-benzothiazol-2-amine × 2 ACT ACETATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.208 |
| 4CJW Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 ACT ACETATE ION × 4 CBJ 6-[(5-bromo-2,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-indol-1-yl)methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.197 |
| 4CK1 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 2 OM1 (4-CARBOXY-1,3-BENZODIOXOL-5-YL)METHYL-[[2-[(4-METHOXYPHENYL)METHYLCARBAMOYL]PHENYL]METHYL]AZANIUM × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.185 |
| 4CK2 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 6 ACT ACETATE ION × 4 NVU 2-(1,2-benzoxazol-3-yl)ethanoic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.211 |
| 4CK3 Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-12-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 50-212
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 7 ACT ACETATE ION × 4 K1T 5-[(2S)-2-{[(4-aminobutanoyl)amino]methyl}-4-methylpentyl]-1,3-benzodioxole-4-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 30 MM MGCL2, 5 MM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.212 |
| 4OVL Interrogating HIV integrase for compounds that bind- a SAMPL challenge 提交 2013-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
链 B
50–212（163 aa）
|
突变：C56S, F139D, F185H 突变：C56S, F139D, F185H | SO4 SULFATE ION × 6 ACY ACETIC ACID × 7 1TD 3-[(E)-(2-oxidanylidene-1H-indol-3-ylidene)methyl]benzoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 5.5 MG/ML IN 40 mM TRIS PH 8.0, 250 mM NACL, 30 mM MGCL2, 5 mM DTT AND SET UP IN A 1:1 RATIO WITH 1.6 TO 2.0 M AMMONIUM SULFATE, 100 mM SODIUM ACETATE BUFFER PH 5.0 TO 5.5.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 4Y1C Cyclic hexapeptide cyc[NdPopPKID] in complex with HIV-1 integrase core domain 提交 2015-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：residues 50-212
|
突变：C56S, W131D, F139D, F185H 突变：C56S, W131D, F139D, F185H | CD CADMIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；1.8M AMMONIUM SULFATE, 0.15M SODIUM
REMARK 280 CITRATE, 5MM CADMIUM CHLORIDE, PH 4.6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.295 |
| 5KGW HIV1 catalytic core domain in complex with inhibitor: (2~{S})-2-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-chromen-6-yl)-1-methyl-indol-2-yl]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]ethanoic acid 提交 2016-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 7SK (2S)-tert-butoxy[3-(3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-6-yl)-1-methyl-1H-indol-2-yl]acetic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；8%PEG 8K
.1M Ammonium Sulfate
.1M Na-cacodylate pH 6.5
5mM DTT
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.241 |
| 5KGX HIV1 catalytic core domain in complex with an inhibitor (2~{S})-2-[3-(3,4-dihydro-2~{H}-chromen-6-yl)-1-methyl-indol-2-yl]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]ethanoic acid 提交 2016-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 7SK (2S)-tert-butoxy[3-(3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-6-yl)-1-methyl-1H-indol-2-yl]acetic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；8%PEG 8K
.1M Ammonium Sulfate
.1M Na-cacodylate
5mM DTT
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.244 |
| 5KRS HIV-1 Integrase Catalytic Core Domain in Complex with an Allosteric Inhibitor, 3-(1H-pyrrol-1-yl)-2-thiophenecarboxylic acid 提交 2016-07-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
57–207（151 aa）
|
突变：F185K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 6XI 3-pyrrol-1-ylthiophene-2-carboxylic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 mM manganese chloride, 100 mM MES pH 6.7, 10% (w/v) PEG 8000, and 5 mM DTT
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.186 |
| 5KRT HIV-1 Integrase Catalytic Core Domain (CCD) in Complex with a Fragment-Derived Allosteric Inhibitor 提交 2016-07-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
57–207（151 aa）
片段：unp residues 57-207
|
突变：F185K 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6W6 3-[2,5-bis(chloranyl)pyrrol-1-yl]thiophene-2-carboxylic acid × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 mM manganese chloride, 100 mM MES pH 6.7, 10% (w/v) PEG 8000, and 5 mM DTT
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.195 |
| 6L0C Crystal structure of HIV-1 Integrase catalytic core domain (A128T/K173Q/F185K) 提交 2019-09-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
|
突变：A128T, K173Q, F185K | SO4 SULFATE ION × 8 ARS ARSENIC × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 6PUT Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with calcium 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.536 |
| 6PUT Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with calcium 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.536 |
| 6PUT Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with calcium 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.536 |
| 6PUW Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and Bictegravir (BIC) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 KLQ Bictegravir × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.534 |
| 6PUW Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and Bictegravir (BIC) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 KLQ Bictegravir × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.534 |
| 6PUW Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and Bictegravir (BIC) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 KLQ Bictegravir × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.534 |
| 6PUY Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ426 (compound 4d) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 OZ1 4-amino-N-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-1-hydroxy-6-(6-hydroxyhexyl)-2-oxo-1,2-dihydro-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.516 |
| 6PUY Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ426 (compound 4d) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 OZ1 4-amino-N-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-1-hydroxy-6-(6-hydroxyhexyl)-2-oxo-1,2-dihydro-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.516 |
| 6PUY Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ426 (compound 4d) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 OZ1 4-amino-N-[(2,4-difluorophenyl)methyl]-1-hydroxy-6-(6-hydroxyhexyl)-2-oxo-1,2-dihydro-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.516 |
| 6PUZ Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ446 (compound 4f) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 XXJ 4-azanyl-N-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-[2-(phenylsulfonyl)ethyl]-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.535 |
| 6PUZ Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ446 (compound 4f) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 XXJ 4-azanyl-N-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-[2-(phenylsulfonyl)ethyl]-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.535 |
| 6PUZ Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ446 (compound 4f) 提交 2019-07-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 XXJ 4-azanyl-N-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-[2-(phenylsulfonyl)ethyl]-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.535 |
| 6UM8 HIV Integrase in complex with Compound-14 提交 2019-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
57–212（156 aa）
链 B
57–212（156 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 QCG (2S)-tert-butoxy[7-(8-fluoro-5-methyl-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-6-yl)-5-methyl-2-phenylpyrazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]acetic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M ammonium sulfate and 100 mM citric acid pH 3.5
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.220 |
| 6V3K Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ419 (compound 4c) 提交 2019-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 QUW 4-azanyl-N-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-(5-oxidanylpentyl)-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.555 |
| 6V3K Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ419 (compound 4c) 提交 2019-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 QUW 4-azanyl-N-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-(5-oxidanylpentyl)-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.555 |
| 6V3K Structure of HIV cleaved synaptic complex (CSC) intasome bound with magnesium and INSTI XZ419 (compound 4c) 提交 2019-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–288（288 aa）
链 B
1–288（288 aa）
链 C
1–288（288 aa）
链 D
1–288（288 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 QUW 4-azanyl-N-[[2,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-6-(5-oxidanylpentyl)-1,8-naphthyridine-3-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.555 |
| 6VQS HIV Integrase Core domain (IN) in complex with [5-(3-fluorophenyl)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid 提交 2020-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：core domain (UNP residues 50-212)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 IOD IODIDE ION × 8 R7J [5-(3-fluorophenyl)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；2.2 M ammonium sulfate, 100 mM potassium iodide
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.269 |
| 7L1P HIV Integrase Core domain (IN) in complex with dimer-spanning ligand 提交 2020-12-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：UNP residues 50-212
链 B
50–212（163 aa）
片段：UNP residues 50-212
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | R2A (2-{[3-(4-{2-[(3-{[3-(carboxymethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl}benzene-1-carbonyl)amino]ethyl}piperazine-1-carbonyl)phenyl]ethynyl}-5-methyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 IOD IODIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；2.2 M ammonium sulfate, 100 mM potassium iodide
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.284 |
| 7L23 HIV Integrase core domain in complex with inhibitor 2-(5-(3-fluorophenyl)-2-(2-(thiophen-2-yl)ethynyl)-1- benzofuran-3-yl)ethanoic acid 提交 2020-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
57–206（150 aa）
片段：UNP residues 57-206
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 IOD IODIDE ION × 10 XFS 3-{[3-(carboxymethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl}benzoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；2.2 M ammonium sulfate, 100 mM potassium iodide
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.280 |
| 7LQP Rapid development of potent inhibitors of the HIV integrase-LEDGF interaction by fragment-linking using off-rate screening 提交 2021-02-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
57–212（156 aa）
片段：core domain (UNP residues 57-212)
链 B
57–212（156 aa）
片段：core domain (UNP residues 57-212)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 12 YAV 2-[2-[2-[3-[2-[2-[2-[[3-[2-[3-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl]phenyl]carbonylamino]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]ethynyl]-5-methyl-1-benzofuran-3-yl]ethanoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 100 mM sodium iodide
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.239 |
| 7RQ0 HIV Integrase CORE domain in complex with 2-{2-[2-(3-{[4-(2-{[(3-{2-[3-(carboxymethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl}phenyl)methyl]amino}ethyl)piperazin-1-yl]methyl}phenyl)ethynyl]-5-methyl-1-benzofuran-3-yl}acetic acid 提交 2021-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：CORE domain (UNP residues 50-212)
链 B
50–212（163 aa）
片段：CORE domain (UNP residues 50-212)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 IOD IODIDE ION × 5 6I2 {2-[(3-{[4-(2-{[(3-{[3-(carboxymethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl}phenyl)methyl]amino}ethyl)piperazin-1-yl]methyl}phenyl)ethynyl]-5-methyl-1-benzofuran-3-yl}acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.2 M ammonium sulfate, pH 7.0, 100 mM potassium iodide
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.270 |
| 7SIA HIV Integrase core domain in complex with inhibitor 2-[2-(2-{3-[(4-{2-[(3-{2-[3-(carboxymethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl}phenyl)formamido]ethyl}piperazin-1-yl)methyl]phenyl}ethynyl)-5-methyl-1-benzofuran-3-yl]acetic acid 提交 2021-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
片段：core domain (UNP residues 50-212)
链 B
50–212（163 aa）
片段：core domain (UNP residues 50-212)
|
未记录 | 9I4 (2-{[3-({4-[2-(3-{[3-(carboxymethyl)-5-methyl-1-benzofuran-2-yl]ethynyl}benzamido)ethyl]piperazin-1-yl}methyl)phenyl]ethynyl}-5-methyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 IOD IODIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 100 mM potassium iodide
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.264 |
| 7T9H HIV Integrase in complex with Compound-15 提交 2021-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
47–212（166 aa）
链 B
47–212（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GE7 (2S)-tert-butoxy[2-methyl-4-(4-methylphenyl)quinolin-3-yl]acetic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.6%(w/v) PEG 3350, 261 mM ammonium acetate, 0.81% glycerol(v/v), 91 mM magnesium chloride and 100 mM MES pH 6.0
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.273 |
| 7T9O HIV Integrase in complex with Compound-25 提交 2021-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
47–209（163 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GEI (2S)-tert-butoxy[4-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-5-{4-[2-(4-fluorophenyl)ethoxy]phenyl}-2,6-dimethylpyridin-3-yl]acetic acid × 2 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.6%(w/v) PEG 3350, 261 mM ammonium acetate, 0.81% glycerol(v/v), 91 mM magnesium chloride and 100 mM MES pH 6.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.219 |
| 7U2U CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 INTEGRASE COMPLEXED WITH Compound-2a AKA (2S)-2-(TERT-BUTOXY)-2-[7-(4,4-DIMETHYLPIPE RIDIN-1-YL)-8-{4-[2-(4-FLUOROPHENYL)ETHOXY]PHENYL}-2,5-DIM ETHYLIMIDAZO[1,2-A]PYRIDIN-6-YL]ACETIC ACID 提交 2022-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–209（160 aa）
|
未记录 | KZD (2S)-tert-butoxy[(4S)-7-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-8-{4-[2-(4-fluorophenyl)ethoxy]phenyl}-2,5-dimethylimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]acetic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2-0.18M Ammonium Sulfate, 100mM Na acetate pH 4.6-5.0
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.211 |
| 7UOQ CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 INTEGRASE COMPLEXED WITH (2S)-2-(TERT-BUTOXY)-2-(5-{2-[(2-CHLORO-6-M ETHYLPHENYL)METHYL]-1,2,3,4-TETRAHYDROISOQUINOLIN-6-YL}-4- (4,4-DIMETHYLPIPERIDIN-1-YL)-2-METHYLPYRIDIN-3-YL)ACETIC ACID 提交 2022-04-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–209（160 aa）
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突变：C56S, F139D, F185H | O20 (2S)-tert-butoxy[(5M)-5-{2-[(2-chloro-6-methylphenyl)methyl]-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-6-yl}-4-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-2-methylpyridin-3-yl]acetic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.2-0.18M Ammonium Sulfate, 100mM Na acetate
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分辨率 1.89 Å R-free 0.224 |
| 8D3S HIV-1 Integrase Catalytic Core Domain F185H Mutant Complexed with BKC-110 提交 2022-06-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
50–212（163 aa）
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突变：F185H | QD6 (2S)-tert-butoxy{4-(4-chlorophenyl)-2,6-dimethyl-1-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl}acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 10% PEG8000, 5 mM DTT
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分辨率 1.84 Å R-free 0.274 |
| 8S9Q HIV-1 Integrase Catalytic Core Domain (CCD) F185H Mutant Complexed with STP03-0404 提交 2023-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
50–212（163 aa）
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未记录 | WBV (2S)-tert-butoxy{4-(4-chlorophenyl)-2,3,6-trimethyl-1-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl}acetic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M sodium cacodylate (pH = 6.5), 10% PEG 8000, 5 mM DTT
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分辨率 2.26 Å R-free 0.293 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | Q76353_9HIV1 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 B； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 C； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 D； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 I； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 J； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 K； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 L； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 M； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 N； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 O； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 作者链 P； PDB构建体 77–364； UniProt 1–288 |
