Escherichia coli (strain K12)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | ASPG2_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 8–333； UniProt 23–348 作者链 B； PDB构建体 8–333； UniProt 23–348 作者链 C； PDB构建体 8–333； UniProt 23–348 作者链 D； PDB构建体 8–333； UniProt 23–348 |
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| 条目编号 entry_id | 6v2c |
| 沉积日期 deposition_date | 2019-11-22 |
| 结构标题 title | Complex of mutant (K162M) of E. coli L-asparaginase II with L-Asp. Covalent acyl-enzyme intermediate and tetrahedral intermediate |
| 关键词 keywords | L-asparagine hydrolase, anti-cancer drug, catalytically deficient mutant, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 30.42 Å |
| Rg（电子密度） | 29.49 Å |
| 总 Rg | 30.36 Å |
| 原子数 | 9782 |
| 残基数 | 1303 |
| 排除体积 | 173490 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6v2ca_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.88 — Glutaminase/Asparaginase |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.88.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 家族 Family family | c.88.1.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 结构域编号 domain_id | d6v2cb1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.88 — Glutaminase/Asparaginase |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.88.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 家族 Family family | c.88.1.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 结构域编号 domain_id | d6v2cb2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d6v2cc1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.88 — Glutaminase/Asparaginase |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.88.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 家族 Family family | c.88.1.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 结构域编号 domain_id | d6v2cc2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d6v2cd1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.88 — Glutaminase/Asparaginase |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.88.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 家族 Family family | c.88.1.1 — Glutaminase/Asparaginase |
| 结构域编号 domain_id | d6v2cd2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |