SAXSdb — 6w22

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	RepA, green fluorescent protein fusion × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–758； UniProt 1–758 作者链 B； PDB构建体 1–758； UniProt 1–758 作者链 C； PDB构建体 1–758； UniProt 1–758 作者链 D； PDB构建体 1–758； UniProt 1–758 作者链 E； PDB构建体 1–758； UniProt 1–758 作者链 F； PDB构建体 1–758； UniProt 1–758

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6w22
沉积日期 deposition_date	2020-03-04
结构标题 title	ClpA Engaged1 State bound to RepA-GFP (ClpA Focused Refinement)
关键词 keywords	AAA+, Chaperone, Protease, Hsp100, ATPase; CHAPERONE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6w22__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6w22__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6w22__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.87 Å
Rg（电子密度）	46.10 Å
总 Rg	46.47 Å
原子数	27536
残基数	3492
排除体积	489890 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6w22__assembly_1__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA
分子量 formula_weight	84321.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	27536

MLNQELELSLNMAFARAREHRHEFMTVEHLLLALLSNPSAREALEACSVDLVALRQELEAFIEQTTPVLPASEEERDTQPTLSFQRVLQRAVFHVQSSGRNEVTGANVLVAIFSEQESQAAYLLRKHEVSRLDVVNFISHGTRKDEPTQSSDPGSQPNSEEQAGGEERMENFTTNLNQLARVGGIDPLIGREKELERAIQVLCRRRKNNPLLVGESGVGKTAIAEGLAWRIVQGDVPEVMADCTIYSLDIGSLLAGTKYRGDFEKRFKALLKQLEQDTNSILFIDEIHTIIGAGAASGGQVDAANLIKPLLSSGKIRVIGSTTYQEFSNIFEKDRALARRFQKIDITEPSIEETVQIINGLKPKYEAHHDVRYTAKAVRAAVELAVKYINDRHLPDKAIDVIDEAGARARLMPVSKRKKTVNVADIESVVARIARIPEKSVSQSDRDTLKNLGDRLKMLVFGQDKAIEALTEAIKMARAGLGHEHKPVGSFLFAGPTGVGKTEVTVQLSKALGIELLRFDMSEYMERHTVSRLIGAPPGYVGFDQGGLLTDAVIKHPHAVLLLDEIEKAHPDVFNILLQVMDNGTLTDNNGRKADFRNVVLVMTTNAGVRETERKSIGLIHQDNSTDAMEEIKKIFTPEFRNRLDNIIWFDHLSTDVIHQVVDKFIVELQVQLDQKGVSLEVSQEARNWLAEKGYDRAMGARPMARVIQDNLKKPLANELLFGSLVDGGQVTVALDKEKNELTYGFQSAQKHKAEAAH

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RepA, green fluorescent protein fusion
分子量 formula_weight	2060.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	176232

ClpA Engaged1 State bound to RepA-GFP (ClpA Focused Refinement)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6w22__assembly_1__model_1

6w22__assembly_1__model_1 | I(q)

6w22__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

ClpA Engaged1 State bound to RepA-GFP (ClpA Focused Refinement)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6w22__assembly_1__model_1

6w22__assembly_1__model_1 | I(q)

6w22__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)