SAXSdb — 6wjc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Muscarinic toxin 7 × 1 （Q8QGR0） ACETAMIDE × 1 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 (1R,5S)-8-METHYL-8-AZABICYCLO[3.2.1]OCT-3-YL (2R)-3-HYDROXY-2-PHENYLPROPANOATE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D9IEF7_BPT4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 228–387； UniProt 2–161

Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion

Homo sapiens

UniProt P11229

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Muscarinic toxin 7 × 1 （Q8QGR0） ACETAMIDE × 1 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 (1R,5S)-8-METHYL-8-AZABICYCLO[3.2.1]OCT-3-YL (2R)-3-HYDROXY-2-PHENYLPROPANOATE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACM1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 11–227； UniProt 2–218 作者链 A； PDB构建体 388–493； UniProt 355–460

Muscarinic toxin 7

Dendroaspis angusticeps

UniProt Q8QGR0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion × 1 （D9IEF7,P11229） ACETAMIDE × 1 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 (1R,5S)-8-METHYL-8-AZABICYCLO[3.2.1]OCT-3-YL (2R)-3-HYDROXY-2-PHENYLPROPANOATE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	3SIM7_DENAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 5–69； UniProt 22–86

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6wjc
沉积日期 deposition_date	2020-04-13
结构标题 title	Muscarinic acetylcholine receptor 1 - muscarinic toxin 7 complex
关键词 keywords	GPCR, natural toxin, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6wjc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6wjc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6wjc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.39 Å
Rg（电子密度）	31.40 Å
总 Rg	31.95 Å
原子数	4206
残基数	514
排除体积	76529 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6wjc__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion
分子量 formula_weight	56907.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.17
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4213

DYKDDDDAAAQTSAPPAVSPQITVLAPGKGPWQVAFIGITTGLLSLATVTGNLLVLISFKVNTELKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLACDLWLALDYVASQARVMNLLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLWAPAILFWQYLVGERTVLAGQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETENRNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYFSLVKEKKAARTLSAILLAFILTWTPYNIMVLVSTFCKDCVPETLWELGYWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDTFRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQCHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Muscarinic toxin 7
分子量 formula_weight	7787.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GPGSLTCVKSNSIWFPTSEDCPDGQNLCFKRWQYISPRMYDFTRGCAATCPKAEYRDVINCCGTDKCNK

来源 Source

来源生物 organism	Dendroaspis angusticeps
通用名 common_name	Eastern green mamba
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8618
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ACETAMIDE
分子量 formula_weight	59.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
分子量 formula_weight	486.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	(1R,5S)-8-METHYL-8-AZABICYCLO[3.2.1]OCT-3-YL (2R)-3-HYDROXY-2-PHENYLPROPANOATE
分子量 formula_weight	289.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	7

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d6wjcc1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family family	g.7.1.1 — Snake venom toxins

结构域编号 domain_id	d6wjcc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6wjcC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — CD59

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晶胞边长 a length_a	122.148 Å
晶胞边长 b length_b	150.429 Å
晶胞边长 c length_c	76.927 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.77 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.550 Å
最低分辨率 resolution_low	44.110 Å
R 因子 r_factor	0.2453
R_work r_work	0.2445
R_free r_free	0.2626

Muscarinic acetylcholine receptor 1 - muscarinic toxin 7 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Muscarinic toxin 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6wjc__assembly_1__model_1

6wjc__assembly_1__model_1 | I(q)

6wjc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Muscarinic acetylcholine receptor 1 - muscarinic toxin 7 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Muscarinic acetylcholine receptor M1,Endolysin fusion

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Muscarinic toxin 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6wjc__assembly_1__model_1

6wjc__assembly_1__model_1 | I(q)

6wjc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)