SAXSdb — 6x63

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HIV-1 capsid protein

Human immunodeficiency virus 1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 378	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAG_HV1N5
Isoform	—
PDB实体	1
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UniProt 133–363 作者链 pE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 q； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 qA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 qB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 qC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 qD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 qE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 r； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 rA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 rB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 rC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 rD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 rE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 s； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 sA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 sB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 sC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 sD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 sE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 t； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 tA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 tB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 tC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 tD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 tE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 u； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 uA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 uB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 uC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 uD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 uE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 v； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 vA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 vB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 vC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 vD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 vE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 w； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 wA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 wB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 wC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 wD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 wE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 x； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 xA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 xB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 xC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 xD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 xE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 y； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 yA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 yB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 yC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 yD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 yE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 z； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 zA； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 zB； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 zC； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 zD； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363 作者链 zE； PDB构建体 1–231； UniProt 133–363

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6x63
沉积日期 deposition_date	2020-05-27
结构标题 title	Atomic-Resolution Structure of HIV-1 Capsid Tubes by Magic Angle Spinning NMR
关键词 keywords	magic angle spinning NMR, HIV-1 capsid, CA protein assemblies, HIV-AIDS, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	SOLID-STATE NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6x63__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6x63__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6x63__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	224.50 Å
总 Rg	224.30 Å
原子数	1359288
残基数	87318
排除体积	12090000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6x63__assembly_1__model_1`	378-meric （378）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HIV-1 capsid protein
分子量 formula_weight	25630.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	378

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v,w,x,y,z,0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,aA,bA,cA,dA,eA,fA,gA,hA,iA,jA,kA,lA,mA,nA,oA,pA,qA,rA,sA,tA,uA,vA,wA,xA,yA,zA,0A,1A,2A,3A,4A,5A,6A,7A,8A,9A,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,aB,bB,cB,dB,eB,fB,gB,hB,iB,jB,kB,lB,mB,nB,oB,pB,qB,rB,sB,tB,uB,vB,wB,xB,yB,zB,0B,1B,2B,3B,4B,5B,6B,7B,8B,9B,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,aC,bC,cC,dC,eC,fC,gC,hC,iC,jC,kC,lC,mC,nC,oC,pC,qC,rC,sC,tC,uC,vC,wC,xC,yC,zC,0C,1C,2C,3C,4C,5C,6C,7C,8C,9C,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,aD,bD,cD,dD,eD,fD,gD,hD,iD,jD,kD,lD,mD,nD,oD,pD,qD,rD,sD,tD,uD,vD,wD,xD,yD,zD,0D,1D,2D,3D,4D,5D,6D,7D,8D,9D,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,aE,bE,cE,dE,eE,fE,gE,hE,iE,jE,kE,lE,mE,nE,oE,pE,qE,rE,sE,tE,uE,vE,wE,xE,yE,zE,0E,1E,2E,3E,4E,5E,6E,7E,8E,9E,AF,BF,CF,DF,EF,FF ;
原子数 atom_count	1359288

PIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVL

来源 Source

来源生物 organism	Human immunodeficiency virus 1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11676
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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Atomic-Resolution Structure of HIV-1 Capsid Tubes by Magic Angle Spinning NMR