SAXSdb — 6x7q

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chloramphenicol acetyltransferase 3

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–213 链 B； UniProt 2–213 链 C； UniProt 2–213	未记录	UTA acetyl-oxa(dethia)-CoA × 3 ZN ZINC ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CLM CHLORAMPHENICOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM magnesium chloride, 100 mM sodium citrate:citric acid, pH 5.5, 46% PEG400	分辨率 1.68 Å R-free 0.201

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6X7Q	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CIA REPLACEMENT OF CATALYTIC HISTIDINE-195 OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE: EVIDENCE FOR A GENERAL BASE ROLE FOR GLUTAMATE 提交 1993-07-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 6 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1CIA REPLACEMENT OF CATALYTIC HISTIDINE-195 OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE: EVIDENCE FOR A GENERAL BASE ROLE FOR GLUTAMATE 提交 1993-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 12 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1CLA EVIDENCE FOR TRANSITION-STATE STABILIZATION BY SERINE-148 IN THE CATALYTIC MECHANISM OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1989-10-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 6 CLM CHLORAMPHENICOL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.34 Å
1CLA EVIDENCE FOR TRANSITION-STATE STABILIZATION BY SERINE-148 IN THE CATALYTIC MECHANISM OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1989-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 12 CLM CHLORAMPHENICOL × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.34 Å
1QCA QUADRUPLE MUTANT Q92C, N146F, Y168F, I172V TYPE III CAT COMPLEXED WITH FUSIDIC ACID. CRYSTALS GROWN AT PH 6.3. X-RAY DATA COLLECTED AT ROOM TEMPERATURE 提交 1995-08-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–213（213 aa）	突变：Q92C, N146F, Y168F, I172V	CO COBALT (II) ION × 6 FUA FUSIDIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.3；pH 6.3	分辨率 2.20 Å
1QCA QUADRUPLE MUTANT Q92C, N146F, Y168F, I172V TYPE III CAT COMPLEXED WITH FUSIDIC ACID. CRYSTALS GROWN AT PH 6.3. X-RAY DATA COLLECTED AT ROOM TEMPERATURE 提交 1995-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–213（213 aa）	突变：Q92C, N146F, Y168F, I172V	CO COBALT (II) ION × 12 FUA FUSIDIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.3；pH 6.3	分辨率 2.20 Å
2CLA CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASP-199-ASN MUTANT OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE TO 2.35 ANGSTROMS RESOLUTION. STRUCTURAL CONSEQUENCES OF DISRUPTION OF A BURIED SALT-BRIDGE 提交 1990-04-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å
2CLA CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASP-199-ASN MUTANT OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE TO 2.35 ANGSTROMS RESOLUTION. STRUCTURAL CONSEQUENCES OF DISRUPTION OF A BURIED SALT-BRIDGE 提交 1990-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 12	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å
3CLA REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE III CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE AT 1.75 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-07-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 6 CLM CHLORAMPHENICOL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
3CLA REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE III CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE AT 1.75 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 12 CLM CHLORAMPHENICOL × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
4CLA ALTERNATIVE BINDING MODES FOR CHLORAMPHENICOL AND 1-SUBSTITUTED CHLORAMPHENICOL ANALOGUES REVEALED BY SITE-DIRECTED MUTAGENESIS AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1990-10-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 6 CLM CHLORAMPHENICOL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
4CLA ALTERNATIVE BINDING MODES FOR CHLORAMPHENICOL AND 1-SUBSTITUTED CHLORAMPHENICOL ANALOGUES REVEALED BY SITE-DIRECTED MUTAGENESIS AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY OF CHLORAMPHENICOL ACETYLTRANSFERASE 提交 1990-10-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–213（213 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 12 CLM CHLORAMPHENICOL × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å

共 6 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAT3_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–215； UniProt 2–213 作者链 B； PDB构建体 4–215； UniProt 2–213 作者链 C； PDB构建体 4–215； UniProt 2–213

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6x7q
沉积日期 deposition_date	2020-05-30
结构标题 title	Chloramphenicol acetyltransferase type III in complex with chloramphenicol and acetyl-oxa(dethia)-CoA
关键词 keywords	Chloramphenicol acetyltransferase, Antibiotic resistance, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.37 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.02 Å
零角强度 I(0) i0	100580000.00
分子量 molecular_weight	78424.0 kDa
排除体积 excluded_volume	97787 Å³
包络体积 envelope_volume	114250 Å³
水化壳体积 shell_volume	36237 Å³
包络直径 envelope_diameter	79.6 Å
壳层 Rg shell_rg	33.96 Å
包络 Rg envelope_rg	25.30 Å
形状 Rg shape_rg	24.99 Å
总 Rg total_rg	26.03 Å
总原子数 total_atoms	5508
残基数 n_residues	638
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	80.8 Å
Rg (实空间) rg_real	26.19 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.29 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0060e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1640e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.25 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	100600000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9044
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	33.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.107
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.536
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	32090000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.925; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.993

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Chloramphenicol acetyltransferase 3
分子量 formula_weight	25091.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.28
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	6530

SGGNYTKFDVKNWVRREHFEFYRHRLPCGFSLTSKIDITTLKKSLDDSAYKFYPVMIYLIAQAVNQFDELRMAIKDDELIVWDSVDPQFTVFHQETETFSALSCPYSSDIDQFMVNYLSVMERYKSDTKLFPQGVTPENHLNISALPWVNFDSFNLNVANFTDYFAPIITMAKYQQEGDRLLLPLSVQVHHAVCDGFHVARFINRLQELCNSKLK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	acetyl-oxa(dethia)-CoA
分子量 formula_weight	793.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHLORAMPHENICOL
分子量 formula_weight	323.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	806

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d6x7qa_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.43 — CoA-dependent acyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.43.1 — CoA-dependent acyltransferases
家族 Family family	c.43.1.1 — CAT-like

结构域编号 domain_id	d6x7qb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.43 — CoA-dependent acyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.43.1 — CoA-dependent acyltransferases
家族 Family family	c.43.1.1 — CAT-like

结构域编号 domain_id	d6x7qc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.43 — CoA-dependent acyltransferases
超家族 Superfamily superfamily	c.43.1 — CoA-dependent acyltransferases
家族 Family family	c.43.1.1 — CAT-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	106.918 Å
晶胞边长 b length_b	106.918 Å
晶胞边长 c length_c	126.596 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 42 21 2
空间群编号 int_tables_number	94
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.680 Å
最低分辨率 resolution_low	34.330 Å
R 因子 r_factor	0.1612
R_work r_work	0.1592
R_free r_free	0.2013

fit	/app/data/saxs_computation/x7/6x7q/6x7q.fit
pddf	/app/data/pr_computation/x7/6x7q/6x7q.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/x7/6x7q/6x7q.dat

Chloramphenicol acetyltransferase type III in complex with chloramphenicol and acetyl-oxa(dethia)-CoA