SAXSdb — 7adz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cap protein (Algo1)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	cap adaptor protein (Algo2) × 6 （A3HTC3） Phage tail protein × 12 （A3HTC1） Putative phage tail sheath protein FI × 6 （A3HTC2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC4_9BACT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0A； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197 作者链 0B； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197 作者链 0C； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197 作者链 0D； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197 作者链 0E； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197 作者链 0F； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197

cap adaptor protein (Algo2)

物种未注明

UniProt A3HTC3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	cap protein (Algo1) × 6 （A3HTC4） Phage tail protein × 12 （A3HTC1） Putative phage tail sheath protein FI × 6 （A3HTC2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC3_9BACT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1A； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 1B； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 1C； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 1D； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 1E； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 1F； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284

Phage tail protein

物种未注明

UniProt A3HTC1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	cap protein (Algo1) × 6 （A3HTC4） cap adaptor protein (Algo2) × 6 （A3HTC3） Putative phage tail sheath protein FI × 6 （A3HTC2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC1_9BACT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 1a； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1b； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1c； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1d； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1e； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1f； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2a； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2b； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2c； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2d； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2e； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2f； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

Putative phage tail sheath protein FI

物种未注明

UniProt A3HTC2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	cap protein (Algo1) × 6 （A3HTC4） cap adaptor protein (Algo2) × 6 （A3HTC3） Phage tail protein × 12 （A3HTC1）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC2_9BACT
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 2A； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2B； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2C； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2D； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2E； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2F； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7adz
沉积日期 deposition_date	2020-09-17
结构标题 title	Cryo-EM structure of an extracellular contractile injection system in marine bacterium Algoriphagus machipongonensis, the cap portion in extended state.
关键词 keywords	extracellular contractile injection system, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7adz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7adz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7adz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	70.77 Å
Rg（电子密度）	69.88 Å
总 Rg	70.01 Å
原子数	67794
残基数	8508
排除体积	1206500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7adz__assembly_1__model_1`	30-meric （30）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	cap protein (Algo1)
分子量 formula_weight	22981.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0A,0B,0C,0D,0E,0F
原子数 atom_count	67794

MIFEVLKILTDEVNQNFKGLEMEDSEVVLNNVALIDSQQDVATELQNKVILSMINLREEVTMKNFPNNVLEGTKVTYKNPKLNINLFLIFCANRTGYKKSLSDLSRILEFFQHKSVFTQSNTSFDRDLEEMENVKNFRFTMELFTPTFEELNYIWGTLGGRQYPSVFYKLNLIVIDRDATTSEEGVITNIHRNYETL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	cap adaptor protein (Algo2)
分子量 formula_weight	33083.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1A,1B,1C,1D,1E,1F

MQVSSSFRSFLKLDILHSYFLNDGEKDFSSMNEEESKTQLKSYNWKDFLEIYPSQKTSHMMRGNKIFFKSFNDSIILAIKVESGTENQPFNELYEDESMTFLLSLKDQYFGNYTDLDLADQLLYFSNKTPVLPEAFTFKPIDRINQSGTVGEEYLYEGENKKHLLEEAHLNPGGGVLGIIQIYMKGDTPVLSLINNDGTLKNSLPHFKIHFSNRKSTWKYINLKDDFETETKKDYPLTKFGFILLDKKSDFISPPAHFEKYVFPNPDARRIKITPTKNYSEIFI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phage tail protein
分子量 formula_weight	16375.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1a,1b,1c,1d,1e,1f,2a,2b,2c,2d,2e,2f

MSYPLSKFHFSVEWGGTKIGFTEVSGLDLETEIIEYRHGASPEYSKIKMPGMQKFSNITLKRGTFKSDNEYFQWYNTINLNKVERRDLTISLLNEEHEPVVTWKVKNAWPLKVQSTDLKGDGNEVAIESMELAHEGLVIQNE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Putative phage tail sheath protein FI
分子量 formula_weight	76319.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2A,2B,2C,2D,2E,2F

MATYKTPGVYIEEITKFPPSVAQVETAIPAFIGYTQFARTKPSVDSDDLILKPKRISSLLDFTTYYGGAQNEQGITVKLTDTLIEGAENRTINVPEPTFKSPYLMFYSLQMYFANGGGPCYIVSTGVYDDWSDSETPPTINFSDLESGLAVIRKEDEPTLLLFPDATNLPTDDEFYSLYNSALMQCNDLQDRFTILDTYSDQTYNDGVEDLDPIPALRNGINLTKDYLKYGAAYYPFVQTILNYQYSADEIVIQHLSYNPNAIATALDNLNAVNGPTFIDAILDDLRDLSLPDISGEISDAVGFMYDDVDGFDIDGTFTTNSVKVANFASLVESVLSTLNELIDAKEEINKDVNSAIASSEEDNAIKTAISDALDVFNEDFEGADKIESVAKNLSDLLIKIKQADTNTKVENVLSINALNFSAEFEKLLTYDVNTGLTASVTLDLFANIGTRLDDIIAAVSAAEPIDVNNGKLNGRLLSDIEPLDNATYNTILLEINSHKVTLPPSSSMAGAYARVDNDRGVWKSPANIGLNYVSKPSVTVSHEEQESMNVHGTGKSVNAIRSFVGKGTLVWGARTLAGNDNEWRYISVRRFFNMAEESIKKATEQFVFEPNDGNTWVRVRAMIENFLILQWRAGALAGAKPEHAFYVKVGLGQTMTAQDILEGNMNVEIGLAVVRPAEFIILKFSHKMQES

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分辨率 resolution	2.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	65059

Cryo-EM structure of an extracellular contractile injection system in marine bacterium Algoriphagus machipongonensis, the cap portion in extended state.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cap protein (Algo1)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

cap adaptor protein (Algo2)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phage tail protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Putative phage tail sheath protein FI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7adz__assembly_1__model_1

7adz__assembly_1__model_1 | I(q)

7adz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of an extracellular contractile injection system in marine bacterium Algoriphagus machipongonensis, the cap portion in extended state.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cap protein (Algo1)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

cap adaptor protein (Algo2)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phage tail protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Putative phage tail sheath protein FI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7adz__assembly_1__model_1

7adz__assembly_1__model_1 | I(q)

7adz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)