7afi

Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state C (body domain)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S4

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SR62_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206

30S ribosomal protein S5

物种未注明

UniProt C3SR27

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SR27_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167

30S ribosomal protein S6

物种未注明

UniProt P02358

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS6_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

30S ribosomal protein S8

物种未注明

UniProt C3SR12

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SR12_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

30S ribosomal protein S11

物种未注明

UniProt C3SR57

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SR57_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

30S ribosomal protein S12

物种未注明

UniProt C3SQR7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SQR7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

30S ribosomal protein S15

物种未注明

UniProt C3SSQ7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SSQ7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

30S ribosomal protein S16

物种未注明

UniProt C3SYP2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SYP2_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

30S ribosomal protein S17

物种未注明

UniProt C3SQY7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SQY7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

30S ribosomal protein S18

物种未注明

UniProt C3SFP7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3SFP7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75

30S ribosomal protein S20

物种未注明

UniProt C3TRH7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） Ribosome maturation factor RimP × 1 （A0A0J3VRH1） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C3TRH7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

Ribosome maturation factor RimP

Escherichia coli

UniProt A0A0J3VRH1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 12 RNA 1	16SrRNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （C3SR62） 30S ribosomal protein S5 × 1 （C3SR27） 30S ribosomal protein S6 × 1 （P02358） 30S ribosomal protein S8 × 1 （C3SR12） 30S ribosomal protein S11 × 1 （C3SR57） 30S ribosomal protein S12 × 1 （C3SQR7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （C3SSQ7） 30S ribosomal protein S16 × 1 （C3SYP2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （C3SQY7） 30S ribosomal protein S18 × 1 （C3SFP7） 30S ribosomal protein S20 × 1 （C3TRH7） MAGNESIUM ION × 46	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0J3VRH1_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7afi
沉积日期 deposition_date	2020-09-19
结构标题 title	Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state C (body domain)
关键词 keywords	Cryo-EM, 30S biogenesis, ribosome assembly, RbfA, RsgA, YjeQ, RimP, KsgA, RsmA, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7afi__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7afi__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7afi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.50 Å
Rg（电子密度）	55.95 Å
总 Rg	55.99 Å
原子数	33803
残基数	2447
排除体积	517430 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7afi__assembly_1__model_1`	tridecameric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16SrRNA
分子量 formula_weight	499551.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	33803

AAAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAAGCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUGACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGCCUUGAACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S4
分子量 formula_weight	23514.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAARLKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALELAEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S5
分子量 formula_weight	17629.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAHIEKQAGELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGTLQHPVKGVHTGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRGKSVEEILGK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	15727.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRFNDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEAGDSEEEEEE

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S8
分子量 formula_weight	14146.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSMQDPIADMLTRIRNGQAANKAAVTMPSSKLKVAIANVLKEEGFIEDFKVEGDTKPELELTLKYFQGKAVVESIQRVSRPGLRIYKRKDELPKVMAGLGIAVVSTSKGVMTDRAARQAGLGGEIICYVA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S11
分子量 formula_weight	13871.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAKAPIRARKRVRKQVSDGVAHIHASFNNTIVTITDRQGNALGWATAGGSGFRGSRKSTPFAAQVAAERCADAVKEYGIKNLEVMVKGPGPGRESTIRALNAAGFRITNITDVTPIPHNGCRPPKKRRV

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	13814.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MATVNQLVRKPRARKVAKSNVPALEACPQKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVILIRGGRVKXLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	10290.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTQLIERLGLRR

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S16
分子量 formula_weight	9207.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNKAA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	9724.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MTDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVEKAVL

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S18
分子量 formula_weight	9005.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MARYFRRRKFCRFTAEGVQEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRHQ

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S20
分子量 formula_weight	9708.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTAQINKLA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Ribosome maturation factor RimP
分子量 formula_weight	16738.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MSTLEQKLTEMITAPVEALGFELVGIEFIRGRTSTLRIYIDSEDGINVDDCADVSHQVSAVLDVEDPITVAYNLEVSSPGLDRPLFTAEHYARFVGEEVTLVLRMAVQNRRKWQGVIKAVDGEMITVTVEGKDEVFALSNIQKANLVPHFA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	46

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	7afiD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1050 — Ribosomal Protein S4 Delta 41; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S4/S9, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	7afiD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	290 — Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA-binding S4 domain

结构域编号 domain_id	7afiX01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — RimP-like superfamily, N-terminal

结构域编号 domain_id	7afiX02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — Ribosome maturation factor RimP, C-terminal domain

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.53 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	14097

Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state C (body domain)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S18

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体