SAXSdb — 7b1i

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

OSIGBa0128P10.9 protein

Oryza sativa

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	AVR-Pik protein × 1 （C4B8B8） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q01IL6_ORYSA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–78； UniProt 2–77

AVR-Pik protein

Magnaporthe oryzae

UniProt C4B8B8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	OSIGBa0128P10.9 protein × 1 （Q01IL6） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C4B8B8_MAGOR
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–94； UniProt 22–113

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7b1i
沉积日期 deposition_date	2020-11-24
结构标题 title	Complex of rice blast (Magnaporthe oryzae) effector protein AVR-PikF with the HMA domain of OsHIPP19 from rice (Oryza sativa)
关键词 keywords	complex, effector, HMA domain, rice, rice blast fungus, plant protein; PLANT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7b1i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7b1i__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7b1i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	16.16 Å
Rg（电子密度）	15.01 Å
总 Rg	16.24 Å
原子数	1208
残基数	155
排除体积	21606 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7b1i__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	OSIGBa0128P10.9 protein
分子量 formula_weight	8337.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	1294

GPKQKIVIKVSMPCEKSRSKAMKLVVMASGVSSVEVTGDGKDRLQVVGDGVDAACLVTCLRKKIGHAELVQVEEVKEK

来源 Source

来源生物 organism	Oryza sativa
通用名 common_name	Rice
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4530
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	AVR-Pik protein
分子量 formula_weight	10856.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GPETGNKYIEKRAIDLSRERDPNFFDNADIPVPECFWFMFKNNVRQDAGTCYSSWKMDKKVGPNWVHIKSDDNCNLSGDFPPGWIVLGKKRPGF

来源 Source

来源生物 organism	Magnaporthe oryzae
通用名 common_name	Rice blast fungus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	318829
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	67

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晶胞边长 a length_a	29.783 Å
晶胞边长 b length_b	53.782 Å
晶胞边长 c length_c	98.026 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	98.030 Å
R 因子 r_factor	0.1975
R_work r_work	0.1956
R_free r_free	0.2334

Complex of rice blast (Magnaporthe oryzae) effector protein AVR-PikF with the HMA domain of OsHIPP19 from rice (Oryza sativa)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

OSIGBa0128P10.9 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

AVR-Pik protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7b1i__assembly_1__model_1

7b1i__assembly_1__model_1 | I(q)

7b1i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (2)

Complex of rice blast (Magnaporthe oryzae) effector protein AVR-PikF with the HMA domain of OsHIPP19 from rice (Oryza sativa)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

OSIGBa0128P10.9 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AVR-Pik protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7b1i__assembly_1__model_1

7b1i__assembly_1__model_1 | I(q)

7b1i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (2)