SAXSdb — 7bbl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gem-associated protein 6

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gem-associated protein 7 × 1 （Q9H840） Gem-associated protein 8 × 1 （Q9NWZ8） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gem-associated protein 7 × 1 （Q9H840） Gem-associated protein 8 × 1 （Q9NWZ8） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GEMI6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 C； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

Gem-associated protein 7

Homo sapiens

UniProt Q9H840

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gem-associated protein 6 × 1 （Q8WXD5） Gem-associated protein 8 × 1 （Q9NWZ8） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gem-associated protein 6 × 1 （Q8WXD5） Gem-associated protein 8 × 1 （Q9NWZ8） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GEMI7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–87； UniProt 46–131 作者链 D； PDB构建体 2–87； UniProt 46–131

Gem-associated protein 8

Homo sapiens

UniProt Q9NWZ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gem-associated protein 6 × 1 （Q8WXD5） Gem-associated protein 7 × 1 （Q9H840） water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Gem-associated protein 6 × 1 （Q8WXD5） Gem-associated protein 7 × 1 （Q9H840） water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GEMI8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 3–42； UniProt 191–230 作者链 F； PDB构建体 3–42； UniProt 191–230

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7bbl
沉积日期 deposition_date	2020-12-17
结构标题 title	Structure of human Gemin6/Gemin7/Gemin8 trimeric complex
关键词 keywords	UsnRNP, Biogenesis, SMN-complex, Gemin8, SPLICING; SPLICING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7bbl__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7bbl__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7bbl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.22 Å
Rg（电子密度）	17.92 Å
总 Rg	19.03 Å
原子数	1681
残基数	211
排除体积	29785 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7bbl__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7bbl__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Gem-associated protein 6
分子量 formula_weight	10538.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	3735

MSEWMKKGPLEWQDYIYKEVRVTASEKNEYKGWVLTTDPVSANIVLVNFLEDGSMSVTGIMGHAVQTVETMNEGDHRVREKLMHLFTSGDCK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Gem-associated protein 7
分子量 formula_weight	9733.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,B

MIAQESLESQEQRARAALRERYLRSLLAMVGHQVSFTLHEGVRVAAHFGATDLDVANFYVSQLQTPIGVQAEALLRCSDIISYTFKP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Gem-associated protein 8
分子量 formula_weight	4900.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

HMERPGERRQAEMKRLYGDSAAKIQAMEAAVQLSFDKHCDRK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	363

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晶胞边长 a length_a	59.880 Å
晶胞边长 b length_b	80.597 Å
晶胞边长 c length_c	82.666 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 2 21 21
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.521 Å
最低分辨率 resolution_low	48.494 Å
R 因子 r_factor	0.2080
R_work r_work	0.2058
R_free r_free	0.2506

Structure of human Gemin6/Gemin7/Gemin8 trimeric complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gem-associated protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Gem-associated protein 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Gem-associated protein 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bbl__assembly_2__model_1

7bbl__assembly_2__model_1 | I(q)

7bbl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)

Structure of human Gemin6/Gemin7/Gemin8 trimeric complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gem-associated protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gem-associated protein 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gem-associated protein 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bbl__assembly_2__model_1

7bbl__assembly_2__model_1 | I(q)

7bbl__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)