SAXSdb — 7bfc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S6,30S ribosomal protein S6

Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 7	water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 7	water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS6_THET8
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 A； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 B； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 B； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 C； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 C； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 D； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 D； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 E； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 E； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 F； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 F； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 G； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 G； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 H； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 H； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 I； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 I； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 J； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 J； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 K； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 K； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 L； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 L； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 M； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 M； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46 作者链 N； PDB构建体 2–36； UniProt 57–91 作者链 N； PDB构建体 43–86； UniProt 3–46

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7bfc
沉积日期 deposition_date	2021-01-02
结构标题 title	Circular permutant of ribosomal protein S6, P54-55 truncated,
关键词 keywords	Circular permutant, native stacking, , designed amyloid fibril, RIBOSOMAL PROTEIN; RIBOSOMAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7bfc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7bfc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7bfc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.89 Å
Rg（电子密度）	39.90 Å
总 Rg	39.73 Å
原子数	4962
残基数	601
排除体积	88035 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7bfc__assembly_1__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7bfc__assembly_2__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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晶胞边长 a length_a	85.381 Å
晶胞边长 b length_b	73.582 Å
晶胞边长 c length_c	115.796 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.98 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	28

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.130 Å
最低分辨率 resolution_low	47.770 Å
R 因子 r_factor	0.2287
R_work r_work	0.2268
R_free r_free	0.2665

描述 description	30S ribosomal protein S6,30S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	10131.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,N,B,M,A,D,E,I,G,H,J,K,L,F
原子数 atom_count	10174

Circular permutant of ribosomal protein S6, P54-55 truncated,

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S6,30S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bfc__assembly_1__model_1

7bfc__assembly_1__model_1 | I(q)

7bfc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	300852
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	266

Circular permutant of ribosomal protein S6, P54-55 truncated,

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S6,30S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7bfc__assembly_1__model_1

7bfc__assembly_1__model_1 | I(q)

7bfc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 引用文献 (1)