SAXSdb — 7c3g

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Activin receptor type-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-(2-pyridin-3-yl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[5,1-c][1,4]oxazin-3-yl)pyrimidin-2-amine × 1 SULFATE ION × 9 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-(2-pyridin-3-yl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[5,1-c][1,4]oxazin-3-yl)pyrimidin-2-amine × 1 SULFATE ION × 8 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACVR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–301； UniProt 201–499 作者链 B； PDB构建体 3–301； UniProt 201–499

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7c3g
沉积日期 deposition_date	2020-05-12
结构标题 title	Crystal structure of human ALK2 kinase domain with R206H mutation in complex with a bicyclic pyrazole inhibitor RK-73134
关键词 keywords	kinase, signaling protein, inhibitor complex; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7c3g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7c3g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7c3g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.20 Å
Rg（电子密度）	18.95 Å
总 Rg	19.89 Å
原子数	2433
残基数	294
排除体积	43122 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7c3g__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7c3g__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Activin receptor type-1
分子量 formula_weight	34531.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.30
突变 mutation	R206H
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5335

SMQRTVAHQITLLECVGKGRYGEVWRGSWQGENVAVKIFSSRDEKSWFRETELYNTVMLRHENILGFIASDMTSRHSSTQLWLITHYHEMGSLYDYLQLTTLDTVSCLRIVLSIASGLAHLHIEIFGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGQCCIADLGLAVMHSQSTNQLDVGNNPRVGTKRYMAPEVLDETIQVDCFDSYKRVDIWAFGLVLWEVARRMVSNGIVEDYKPPFYDVVPNDPSFEDMRKVVCVDQQRPNIPNRWFSDPTLTSLAKLMKECWYQNPSARLTALRIKKTLTKID

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	~{N}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-(2-pyridin-3-yl-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[5,1-c][1,4]oxazin-3-yl)pyrimidin-2-amine
分子量 formula_weight	468.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	469

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d7c3ga_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

结构域编号 domain_id	d7c3gb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

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晶胞边长 a length_a	84.340 Å
晶胞边长 b length_b	140.259 Å
晶胞边长 c length_c	59.758 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.802 Å
最低分辨率 resolution_low	46.098 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1851
R_free r_free	0.2266

Crystal structure of human ALK2 kinase domain with R206H mutation in complex with a bicyclic pyrazole inhibitor RK-73134

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Activin receptor type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7c3g__assembly_1__model_1

7c3g__assembly_1__model_1 | I(q)

7c3g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of human ALK2 kinase domain with R206H mutation in complex with a bicyclic pyrazole inhibitor RK-73134

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Activin receptor type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7c3g__assembly_1__model_1

7c3g__assembly_1__model_1 | I(q)

7c3g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

7. 引用文献 (1)