7ceb

Crystal structure of alpha6beta1 integrin headpiece

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 138.7 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin alpha-6

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 24–641	未记录	Integrin beta-1 × 1 （P05556） TS2/16 VH(S112C)-SARAH × 1 TS2/16 VL-SARAH(S37C) × 1 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% PEG1000, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na/K phosphate, pH 6.5	分辨率 2.89 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7CEB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7CEC Structure of alpha6beta1 integrin in complex with laminin-511 提交 2020-06-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 24–641（618 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	ITA6_HUMAN
Isoform	P23229-2
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–618； UniProt 24–641

Integrin beta-1

Homo sapiens

UniProt P05556

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–465	未记录	Integrin alpha-6 × 1 （P23229） TS2/16 VH(S112C)-SARAH × 1 TS2/16 VL-SARAH(S37C) × 1 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% PEG1000, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na/K phosphate, pH 6.5	分辨率 2.89 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7CEB	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3G9W Crystal Structure of Talin2 F2-F3 in Complex with the Integrin Beta1D Cytoplasmic Tail 提交 2009-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 752–801（50 aa）片段：Cytoplasmic Tail	未记录	GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.02M magnesium chloride, 0.05M HEPES, 5% PEG 8k, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.17 Å R-free 0.248
3G9W Crystal Structure of Talin2 F2-F3 in Complex with the Integrin Beta1D Cytoplasmic Tail 提交 2009-02-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 752–801（50 aa）片段：Cytoplasmic Tail	未记录	GOL GLYCEROL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.02M magnesium chloride, 0.05M HEPES, 5% PEG 8k, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.17 Å R-free 0.248
3T9K Crystal Structure of ACAP1 C-portion mutant S554D fused with integrin beta1 peptide 提交 2011-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 758–769（12 aa）	突变：S554D	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；0.2M ammonium sulfate, 14% PEG 3350, 0.1M Sodium Citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.30 Å R-free 0.225
3T9K Crystal Structure of ACAP1 C-portion mutant S554D fused with integrin beta1 peptide 提交 2011-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 758–769（12 aa）	突变：S554D	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；0.2M ammonium sulfate, 14% PEG 3350, 0.1M Sodium Citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.30 Å R-free 0.225
3VI3 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece (ligand-free form) 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3VI3 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece (ligand-free form) 提交 2011-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3VI4 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece in complex with RGD peptide 提交 2011-09-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
3VI4 Crystal structure of alpha5beta1 integrin headpiece in complex with RGD peptide 提交 2011-09-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris (pH6.5), 20%(w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 X 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 13 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Z 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 14 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 b 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 15 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 d 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 16 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 f 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 17 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 h 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 18 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 j 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 19 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 l 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 20 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 n 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 21 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 p 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 22 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 r 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 23 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 t 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 24 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 v 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 25 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 x 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 26 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 z 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 27 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 8 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 28 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 6 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 29 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 9 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 30 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 7 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 784–798（15 aa）片段：Cytoplasmic tail	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4WJK Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 1.85 Å R-free 0.238
4WK0 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 1.78 Å R-free 0.223
4WK2 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 2.50 Å R-free 0.254
4WK4 Metal Ion and Ligand Binding of Integrin 提交 2014-10-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–465（445 aa）片段：UNP residues 21-465	未记录	CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.1 M HEPES 7.2, 16% PEG 6000	分辨率 2.50 Å R-free 0.236
7CEC Structure of alpha6beta1 integrin in complex with laminin-511 提交 2020-06-22	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7NWL Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 (open form) in complex with fibronectin and TS2/16 Fv-clasp 提交 2021-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 21–798（778 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7NXD Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in the half-bent conformation 提交 2021-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–798（778 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
8RPQ Solution NMR structure of Integrin beta-1 TMD 提交 2024-01-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 726–761（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1 NMR样品组成 0.5 uM NA Itgb1, trifluoroethanol/water \| trifluoroethanol/water	分辨率未提供
8W30 Crystal structure of alpha-V beta-1 integrin headpiece in complex with TR01225179 提交 2024-02-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 21–465（445 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 A1AFA N-(2,4-dichlorobenzoyl)-L-phenylalanine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；28% pentaerythritol ethoxylate (15/4_EO/OH), 0.05M ammonium sulfate, 0.05M Bis Tris pH 6.5	分辨率 2.45 Å R-free 0.275
9B9J Integrin alpha-5 beta-1 in complex with BIIG2 Fab 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM Tris-HCL, 150mM NaCl, 5mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9B9K Integrin alpha-5 beta-1 in complex with MINT1526A Fab 提交 2024-04-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9CKV Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin 提交 2024-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
9DIA Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin candidate 2 提交 2024-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9EF2 Cryo-EM structure of alpha5beta1 integrin in complex with NeoNectin candidate 2, open conformation 提交 2024-11-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–728（728 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
9NAB Cryo-EM structure of the alpha5beta1 integrin headpiece with OS2966 Fab 提交 2025-02-11	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–465（445 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å
9P6S Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 in complex with fibronectin (FN 7-10) 提交 2025-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 26–465（440 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.61 Å

共 21 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–445； UniProt 21–465

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ceb
沉积日期 deposition_date	2020-06-22
结构标题 title	Crystal structure of alpha6beta1 integrin headpiece
关键词 keywords	Integrin, Fv-clasp, Laminin, CELL ADHESION, CELL ADHESION-IMMUNE SYSTEM complex; CELL ADHESION/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	39.47 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	39.36 Å
零角强度 I(0) i0	291723000.00
分子量 molecular_weight	137110.0 kDa
排除体积 excluded_volume	170940 Å³
包络体积 envelope_volume	230880 Å³
水化壳体积 shell_volume	50093 Å³
包络直径 envelope_diameter	149.1 Å
壳层 Rg shell_rg	43.43 Å
包络 Rg envelope_rg	39.87 Å
形状 Rg shape_rg	39.30 Å
总 Rg total_rg	39.81 Å
总原子数 total_atoms	9629
残基数 n_residues	1212
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	138.7 Å
Rg (实空间) rg_real	39.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.9170e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8890e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	39.57 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	291700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8548
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	41.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.470
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.170
角度范围 angular_range	— – 0.2000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	40550000.0000
实空间数据点数 n_real_points	41
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.803; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.892; Smooth: 0.807

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Integrin alpha-6
分子量 formula_weight	69776.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	9632

FNLDTREDNVIRKYGDPGSLFGFSLAMHWQLQPEDKRLLLVGAPRAEALPLQRANRTGGLYSCDITARGPCTRIEFDNDADPTSESKEDQWMGVTVQSQGPGGKVVTCAHRYEKRQHVNTKQESRDIFGRCYVLSQNLRIEDDMDGGDWSFCDGRLRGHEKFGSCQQGVAATFTKDFHYIVFGAPGTYNWKGIVRVEQKNNTFFDMNIFEDGPYEVGGETEHDESLVPVPANSYLGFSLDSGKGIVSKDEITFVSGAPRANHSGAVVLLKRDMKSAHLLPEHIFDGEGLASSFGYDVAVVDLNKDGWQDIVIGAPQYFDRDGEVGGAVYVYMNQQGRWNNVKPIRLNGTKDSMFGIAVKNIGDINQDGYPDIAVGAPYDDLGKVFIYHGSANGINTKPTQVLKGISPYFGYSIAGNMDLDRNSYPDVAVGSLSDSVTIFRSRPVINIQKTITVTPNRIDLRQKTACGAPSGICLQVKSCFEYTANPAGYNPSISIVGTLEAEKERRKSGLSSRVQFRNQGSEPKYTQELTLKRQKQKVCMEETLWLQDNIRDKLRPIPITASVEIQEPSSRRRVNSLPEVLPILNSDEPKTAHIDVHFLKEGCGDDNVCNSNLKLEYKGSLENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Integrin beta-1
分子量 formula_weight	50510.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECEGGLENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	TS2/16 VH(S112C)-SARAH
分子量 formula_weight	19464.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MDVKLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSYTMSWVRQTPEKRLEWVATISSGGSYTYYPDSVKGRFTISRDKAKNTLYLQMGSLKSEDTAMYYCTRIGYDEDYAMDHWGQGTSVTVCSGSDYEFLKSWTVEDLQKRLLALDPMMEQEIEEIRQKYQSKRQPILDAIEAK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	TS2/16 VL-SARAH(S37C)
分子量 formula_weight	18270.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GSHMQIVVTQRPTTMAASPGDKIIITCSVSSIISSNYLHWYSQKPGFSPKLLIYRTSNLASGVPPRFSGSGSGTSYSLTIGTMEAEDVATYYCQQGSDIPLTFGDGTKLDLKRGSDYEFLKSWTVEDLQKRLLALDPMMEQEIEEIRQKYQCKRQPILDAIEAK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

▶

8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	116.520 Å
晶胞边长 b length_b	251.310 Å
晶胞边长 c length_c	63.250 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	2.890 Å
最低分辨率 resolution_low	44.570 Å
R 因子 r_factor	0.2088
R_work r_work	0.2066
R_free r_free	0.2486

fit	/app/data/saxs_computation/ce/7ceb/7ceb.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ce/7ceb/7ceb.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ce/7ceb/7ceb.dat

Crystal structure of alpha6beta1 integrin headpiece

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin alpha-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Integrin beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)