7eic

Crystal structure of AF9 YEATS domain in complex with H4K5acK8ac peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H4

物种未注明

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Protein AF-9 × 1 (P42568) GLYCEROL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–12; UniProt 2–13

Protein AF-9

Homo sapiens

UniProt P42568

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H4 × 1 (P62805) GLYCEROL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 GLYCEROL × 2 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AF9_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 8–145; UniProt 1–138 作者链 B; PDB构建体 8–145; UniProt 1–138

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7eic
沉积日期 deposition_date2021-03-30
结构标题 titleCrystal structure of AF9 YEATS domain in complex with H4K5acK8ac peptide
关键词 keywordsYEATS domain, Transcription, Complex, Histone modification, NUCLEAR PROTEIN; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7eic__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7eic__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7eic__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)18.60 Å
Rg(电子密度)17.51 Å
总 Rg18.69 Å
原子数1233
残基数145
排除体积22045 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7eic__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7eic__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)