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7ej2

human voltage-gated potassium channel KV1.3 H451N mutant

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 163.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

Homo sapiens

UniProt Q13303

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–367 链 C； UniProt 1–367 链 E； UniProt 1–367 链 G； UniProt 1–367 未记录 Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3 × 4 （P22001） NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7EJ2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ZSX Crystal Structure Of Human Potassium Channel Kv Beta-subunit (KCNAB2) 提交 2005-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 25–346（322 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 16 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；PEG300, sodium/potassium phosphate, sodium chloride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.172
1ZSX Crystal Structure Of Human Potassium Channel Kv Beta-subunit (KCNAB2) 提交 2005-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 25–346（322 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 32 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；PEG300, sodium/potassium phosphate, sodium chloride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.172
7EJ1 human voltage-gated potassium channel KV1.3 提交 2021-04-01 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–367（367 aa）
链 C 1–367（367 aa）
链 E 1–367（367 aa）
链 G 1–367（367 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7WF3 Composite map of human Kv1.3 channel in apo state with beta subunits 提交 2021-12-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 34–361（328 aa）
链 G 34–361（328 aa）
链 I 34–361（328 aa）
链 M 34–361（328 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WF4 Composite map of human Kv1.3 channel in dalazatide-bound state with beta subunits 提交 2021-12-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 34–361（328 aa）
链 I 34–361（328 aa）
链 M 34–361（328 aa）
链 o 34–361（328 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 4 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCAB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–367； UniProt 1–367 作者链 C； PDB构建体 1–367； UniProt 1–367 作者链 E； PDB构建体 1–367； UniProt 1–367 作者链 G； PDB构建体 1–367； UniProt 1–367

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3

Homo sapiens

UniProt P22001

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–575 链 D； UniProt 1–575 链 F； UniProt 1–575 链 H； UniProt 1–575 突变：H451N Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （Q13303） NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7EJ2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4BGC T1 domain of the renal potassium channel Kv1.3 提交 2013-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 104–204（101 aa） 片段：T1 DOMAIN, RESIDUES 104-204
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；WE WANTED TO USE THE PROTEIN IN 150 MM POTASSIUM PHOSPHATE BUFFER PH 6.5 IN 5 MM NMR TUBES FOR CHARACTERIZATION USING NMR SPECTROSCOPY. DURING TESTING, WE OBSERVED THE FORMATION OF CRYSTALS IN THE NMR TUBES. AN INITIAL TEST OF THE CRYSTALS SHOWED AN EXCELLENT DIFFRACTION PATTERN, SO WE DECIDED TO CONTINUE WITH CRYSTALLIZATION OPTIMIZATION IN NMR TUBES, RESULTING IN VERY GOOD CRYSTALS
分辨率 1.20 Å R-free 0.205
7EJ1 human voltage-gated potassium channel KV1.3 提交 2021-04-01 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
链 F 1–575（575 aa）
链 H 1–575（575 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7SSV Structure of human Kv1.3 with Fab-ShK fusion 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7SSX Structure of human Kv1.3 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7SSY Structure of human Kv1.3 (alternate conformation) 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7SSZ Structure of human Kv1.3 with A0194009G09 nanobodies 提交 2021-11-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
7WF3 Composite map of human Kv1.3 channel in apo state with beta subunits 提交 2021-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 208–493（286 aa） 片段：TM domain
链 D 208–493（286 aa） 片段：TM domain
链 F 208–493（286 aa） 片段：TM domain
链 H 208–493（286 aa） 片段：TM domain
链 J 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
链 N 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
链 O 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
链 P 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
未记录 K POTASSIUM ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WF4 Composite map of human Kv1.3 channel in dalazatide-bound state with beta subunits 提交 2021-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 208–490（283 aa） 片段：TM domain
链 D 208–490（283 aa） 片段：TM domain
链 F 208–490（283 aa） 片段：TM domain
链 H 208–490（283 aa） 片段：TM domain
链 J 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
链 N 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
链 O 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
链 P 99–204（106 aa） 片段：T1 domain
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8DFL Structure of human Kv1.3 with A0194009G09 nanobodies (alternate conformation) 提交 2022-06-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9CLA Human Kv1.3 mutant-H451V 提交 2024-07-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
9CLV Human Kv1.3 mutant-P424G 提交 2024-07-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9CON Human Kv1.3-H451V with A0194009G09 nanobodies conformation 1 提交 2024-07-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9CTY Human Kv1.3-H451V with A0194009G09 nanobodies conformation 2 提交 2024-07-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
9EEF Human Kv1.3 mutant - G427H 提交 2024-11-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
突变：G427H 突变：G427H 突变：G427H 突变：G427H K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9EI0 Human Kv1.3 mutant - G427H with A0194009G09 nanobodies 提交 2024-11-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–575（575 aa）
链 B 1–575（575 aa）
链 C 1–575（575 aa）
链 D 1–575（575 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCNA3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–575； UniProt 1–575 作者链 D； PDB构建体 1–575； UniProt 1–575 作者链 F； PDB构建体 1–575； UniProt 1–575 作者链 H； PDB构建体 1–575； UniProt 1–575

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7ej2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7ej2
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7ej2
沉积日期 deposition_date2021-04-01
结构标题 titlehuman voltage-gated potassium channel KV1.3 H451N mutant
关键词 keywordspotassium channel, complex, C-type inactivation, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier52.35 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron52.64 Å
零角强度 I(0) i01203930000.00
分子量 molecular_weight297290.0 kDa
排除体积 excluded_volume374890 ų
包络体积 envelope_volume563830 ų
水化壳体积 shell_volume89583 ų
包络直径 envelope_diameter163.9 Å
壳层 Rg shell_rg55.54 Å
包络 Rg envelope_rg51.78 Å
形状 Rg shape_rg52.65 Å
总 Rg total_rg52.70 Å
总原子数 total_atoms20968
残基数 n_residues2728
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax163.1 Å
Rg (实空间) rg_real52.35 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.64 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2040e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.5520e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal52.34 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1204000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8494
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary59.8 Å
偏度 Skewness skewness0.265
峰度 Kurtosis kurtosis-0.688
角度范围 angular_range— – 0.1500 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha83550000.0000
实空间数据点数 n_real_points31
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.920; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.279
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)