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1zsx

Crystal Structure Of Human Potassium Channel Kv Beta-subunit (KCNAB2)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 63.2 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit

Homo sapiens

UniProt Q13303

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 25–346 未记录 CL CHLORIDE ION × 16 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；PEG300, sodium/potassium phosphate, sodium chloride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 1.90 Å R-free 0.172
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 25–346 未记录 CL CHLORIDE ION × 32 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 8 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；PEG300, sodium/potassium phosphate, sodium chloride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 1.90 Å R-free 0.172

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1ZSX Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7EJ1 human voltage-gated potassium channel KV1.3 提交 2021-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–367（367 aa）
链 C 1–367（367 aa）
链 E 1–367（367 aa）
链 G 1–367（367 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7EJ2 human voltage-gated potassium channel KV1.3 H451N mutant 提交 2021-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–367（367 aa）
链 C 1–367（367 aa）
链 E 1–367（367 aa）
链 G 1–367（367 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7WF3 Composite map of human Kv1.3 channel in apo state with beta subunits 提交 2021-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 34–361（328 aa）
链 G 34–361（328 aa）
链 I 34–361（328 aa）
链 M 34–361（328 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WF4 Composite map of human Kv1.3 channel in dalazatide-bound state with beta subunits 提交 2021-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 34–361（328 aa）
链 I 34–361（328 aa）
链 M 34–361（328 aa）
链 o 34–361（328 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCAB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 26–347； UniProt 25–346

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1zsx

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1zsx
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1zsx
沉积日期 deposition_date2005-05-25
结构标题 titleCrystal Structure Of Human Potassium Channel Kv Beta-subunit (KCNAB2)
关键词 keywords;Potassium Channel, Kv Beta-subunit, human, aldo-keto reductase, Structural Genomics, SGC, Structural Genomics Consortium, OXIDOREDUCTASE ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.23 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.19 Å
零角强度 I(0) i022675600.00
分子量 molecular_weight36237.0 kDa
排除体积 excluded_volume45267 ų
包络体积 envelope_volume50582 ų
水化壳体积 shell_volume21524 ų
包络直径 envelope_diameter64.4 Å
壳层 Rg shell_rg26.00 Å
包络 Rg envelope_rg19.51 Å
形状 Rg shape_rg19.18 Å
总 Rg total_rg20.07 Å
总原子数 total_atoms2537
残基数 n_residues322
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax63.2 Å
Rg (实空间) rg_real20.13 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real2.2680e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.4860e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.15 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal22680000.0000
解质量估计 total_estimate0.9013
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary25.3 Å
偏度 Skewness skewness0.187
峰度 Kurtosis kurtosis-0.451
角度范围 angular_range— – 0.3950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha6958000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.910; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.993
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1zsxa1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.7 — NAD(P)-linked oxidoreductase
家族 Family familyc.1.7.1 — Aldo-keto reductases (NADP)
结构域编号 domain_idd1zsxa2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1zsxA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — NADP-dependent oxidoreductase domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)